Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00998
- Subject:
- NM_001346045.1
- Aligned Length:
- 1607
- Identities:
- 1106
- Gaps:
- 433
Alignment
Query 1 ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG 74
Query 75 AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 75 AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGC 148
Query 149 ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAG 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 149 ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAA 222
Query 223 CGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC 296
.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGAGACAAGGACGCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC 296
Query 297 GACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCG 370
|||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GACCTGCACTCCCCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCG 370
Query 371 CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATA 444
Query 445 CAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCA 518
||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 445 CAAGCAATTCAAGTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCA 518
Query 519 CCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGT 592
|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 519 CCGGTACATTAGCTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGT 592
Query 593 CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 593 CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGAT 666
Query 667 GATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAA 740
||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 GACGCAACCTCAACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAA 740
Query 741 CAGCAGTGAGCA-------------------------------------------------------------- 752
||||||||||||
Sbjct 741 CAGCAGTGAGCAAGGCGCTTCGGAGACTGAGGCTGACCATTTACTATTGTGGAAGCCCATGACTGATCGCACAG 814
Query 753 -------------------------------------------------------------------------- 752
Sbjct 815 GATGCGTTTCAGTGCAAATGTCAAGAGAAGATAGAGAAGAAAGCAGAGAGGGAAAACACTCTCCACAACCACTT 888
Query 753 -----------------------------------------------------AGGGGATGGTTTAGACAACAG 773
|||.|||||.|||||||||||
Sbjct 889 GAAAACATCATCATTCCCTGTCAGCCGCCCTTTCGTGGGGAAAGCGAAGCTGGAGGCGATGGGTTAGACAACAG 962
Query 774 TGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTT 847
.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 963 CGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATAT 1036
Query 848 TCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAG 921
||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1037 TCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAA 1110
Query 922 CAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAG 995
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1111 CAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAG 1184
Query 996 AAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTC 1069
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTC 1258
Query 1070 AGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGA-GCATGCC 1142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || .||||
Sbjct 1259 AGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAG-------GACCCATG-- 1323
Query 1143 AGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCTATGGGAATGAGTATGGCACA-------GCCAAGTTACACTCCTCCC 1209
||.||| |||||.||||.||||| .|| || |||..||||
Sbjct 1324 AGTGGA----------------------ATGGGCATGAATATGG-GCATGGATGGGC--AGTGGCACT------ 1366
Query 1210 CAGATGACCCCACACCCTACTCAATTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCA 1283
|.|||
Sbjct 1367 -ATATG-------------------------------------------------------------------- 1371
Query 1284 CCCAGCCATGATGATGCACGGAGGACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGT 1357
Sbjct 1372 -------------------------------------------------------------------------- 1371
Query 1358 TAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA 1410
Sbjct 1372 ----------------------------------------------------- 1371