Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00998
• Subject: NM_170677.5
• Aligned Length: 1438
• Identities: 1166
• Gaps: 263

Alignment

Query    1  ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG  74

Query   75  AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGC  148

Query  149  ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAG  222

Query  223  CGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC  296

Query  297  GACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCG  370

Query  371  CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATA  444

Query  445  CAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCA  518

Query  519  CCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGT  592

Query  593  CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGAT  666

Query  667  GATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAA  740

Query  741  CAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATA  814

Query  815  AGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTC  888

Query  889  CAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCT  962

Query  963  CCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG---  1033
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  963  CCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAG  1036

Query 1034  ------------------CAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTG  1089
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTTTTCTTCTTGATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTG  1110

Query 1090  TTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGAGC-ATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGG  1162
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||.| |||  ||.|||              
Sbjct 1111  TTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAG-------GACCTATG--AGTGGA--------------  1161

Query 1163  GTGGTCCTATGGGAATGAGTATGGCACA------GCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACT  1230
                    |||||.||||.||||| .||      |.||| |..||||       |.|||               
Sbjct 1162  --------ATGGGCATGAATATGG-GCATGGATGGGCAA-TGGCACT-------ACATG---------------  1203

Query 1231  CAATTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGATGATGCACGG  1304
                                                                                      
Sbjct 1204  --------------------------------------------------------------------------  1203

Query 1305  AGGACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATG  1378
                                                                                      
Sbjct 1204  --------------------------------------------------------------------------  1203

Query 1379  TTGGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1410
                                            
Sbjct 1204  --------------------------------  1203