Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00998
• Subject: XM_017316104.1
• Aligned Length: 1493
• Identities: 1339
• Gaps: 88

Alignment

Query    1  ----------------------------------------------------------ATGGCGCAAAGG----  12
                                                                      ||     |||.|    
Sbjct    1  ATGCCAAACATCCCCAACGCGACCCAGTTAGGCAGGAGCCAAGAGGAGTGGTGGGGAAAT-----AAACGAGAA  69

Query   13  TACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGC  86
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   70  TACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGC  143

Query   87  GCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGC  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  144  GCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGCACTACGGCGCGC  217

Query  161  ACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGAC  234
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||
Sbjct  218  ACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAAAGAGACAAGGAC  291

Query  235  GCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCC  308
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  GCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCC  365

Query  309  CCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCA  382
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  CCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCA  439

Query  383  AGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAA  456
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  440  AGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATACAAGCAATTCAA  513

Query  457  GTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAG  530
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  514  GTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCACCGGTACATTAG  587

Query  531  CTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAG  604
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  588  CTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGTCAGATCATGAAG  661

Query  605  AACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCA  678
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  662  AACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGATGACGCAACCTCA  735

Query  679  ACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCA  752
            ||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  736  ACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAACAGCAGTGAGCA  809

Query  753  AGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAAC  826
            |||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  810  AGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAAC  883

Query  827  GCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACA  900
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  884  GCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACA  957

Query  901  CATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAA  974
            ||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  958  CACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAA  1031

Query  975  CTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG---------------  1033
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct 1032  CTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGGTTTTCTTCTTG  1105

Query 1034  ------CAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAG  1101
                  |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  ATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAG  1179

Query 1102  CAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGAGCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCTATGGG  1175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1180  CAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGAGCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCAATGGG  1253

Query 1176  AATGAGTATGGCACAGCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAATTAAGACATGGACCCC  1249
            ||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1254  AATGGGTATGGCCCAGCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAGTTAAGACATGGACCCC  1327

Query 1250  CAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGATGATGCACGGAGGACCCCCTACCCACCCT  1323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328  CAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGGTGATGCACGGAGGACCCCCTACCCACCCT  1401

Query 1324  GGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTATGGA  1397
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402  GGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTATGGA  1475

Query 1398  CATTCATGCCCAA  1410
            |||||||||||||
Sbjct 1476  CATTCATGCCCAA  1488