Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01113
• Subject: XM_006517151.3
• Aligned Length: 1491
• Identities: 1230
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ATGTCGTCCTGGATAAGGTGGCATGGACCCGCCATGGCGCGGCTCTGGGGCTTCTGCTGGCTGGTTGTGGGCTT  74
            ||||||.|||||.|.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||..||||||..|||||||
Sbjct    1  ATGTCGCCCTGGCTGAAGTGGCATGGACCCGCCATGGCGCGGCTCTGGGGCTTATGCCTGCTGGTCTTGGGCTT  74

Query   75  CTGGAGGGCCGCTTTCGCCTGTCCCACGTCCTGCAAATGCAGTGCCTCTCGGATCTGGTGCAGCGACCCTTCTC  148
            ||||||||||.||.|||||||.||.||||||||||||||||||.||.||.||||.|||||.|..||.|||||||
Sbjct   75  CTGGAGGGCCTCTCTCGCCTGCCCGACGTCCTGCAAATGCAGTTCCGCTAGGATTTGGTGTACTGAGCCTTCTC  148

Query  149  CTGGCATCGTGGCATTTCCGAGATTGGAGCCTAACAGTGTAGATCCTGAGAACATCACCGAAATTTTCATCGCA  222
            |.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||.||||.|||
Sbjct  149  CAGGCATCGTGGCATTCCCGAGGTTGGAACCTAACAGCGTTGACCCGGAGAACATCACGGAAATTCTCATTGCA  222

Query  223  AACCAGAAAAGGTTAGAAATCATCAACGAAGATGATGTTGAAGCTTATGTGGGACTGAGAAATCTGACAATTGT  296
            ||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  223  AACCAGAAAAGGCTAGAAATCATCAATGAAGATGACGTTGAAGCTTACGTGGGGCTGAGAAACCTTACAATTGT  296

Query  297  GGATTCTGGATTAAAATTTGTGGCTCATAAAGCATTTCTGAAAAACAGCAACCTGCAGCACATCAATTTTACCC  370
            ||||||.||.|||||.|||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||.||||||.|||||.||.|
Sbjct  297  GGATTCCGGCTTAAAGTTTGTGGCTTACAAAGCGTTTCTGAAAAACAGCAACCTGCGGCACATAAATTTCACAC  370

Query  371  GAAACAAACTGACGAGTTTGTCTAGGAAACATTTCCGTCACCTTGACTTGTCTGAACTGATCCTGGTGGGCAAT  444
            |||||||.||||||||||||||.||||.|||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||..|||.|||
Sbjct  371  GAAACAAGCTGACGAGTTTGTCCAGGAGACATTTCCGCCACCTTGACTTGTCTGACCTGATCCTGACGGGTAAT  444

Query  445  CCATTTACATGCTCCTGTGACATTATGTGGATCAAGACTCTCCAAGAGGCTAAATCCAGTCCAGACACTCAGGA  518
            ||.||.||.||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.|||.||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  445  CCGTTCACGTGCTCCTGCGACATCATGTGGCTCAAGACTCTCCAGGAGACTAAATCCAGCCCCGACACTCAGGA  518

Query  519  TTTGTACTGCCTGAATGAAAGCAGCAAGAATATTCCCCTGGCAAACCTGCAGATACCCAATTGTGGTTTGCCAT  592
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  519  TTTGTACTGCCTCAATGAGAGCAGCAAGAACATGCCCCTGGCGAACCTGCAGATACCCAATTGTGGTCTGCCAT  592

Query  593  CTGCAAATCTGGCCGCACCTAACCTCACTGTGGAGGAAGGAAAGTCTATCACATTATCCTGTAGTGTGGCAGGT  666
            |||||..||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|.||..|.|||||.|||||||..|||
Sbjct  593  CTGCACGTCTGGCTGCTCCTAACCTCACCGTGGAGGAAGGAAAGTCTGTGACCCTTTCCTGCAGTGTGGGGGGT  666

Query  667  GATCCGGTTCCTAATATGTATTGGGATGTTGGTAACCTGGTTTCCAAACATATGAATGAAACAAGCCACACACA  740
            ||.||..|.||.|...||||.|||||.|||||.||..||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACCCACTCCCCACCTTGTACTGGGACGTTGGGAATTTGGTTTCCAAGCACATGAATGAAACAAGCCACACACA  740

Query  741  GGGCTCCTTAAGGATAACTAACATTTCATCCGATGACAGTGGGAAGCAGATCTCTTGTGTGGCGGAAAATCTTG  814
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  741  GGGCTCCTTAAGGATAACGAACATTTCATCTGATGACAGTGGAAAGCAAATCTCTTGTGTGGCAGAAAACCTTG  814

Query  815  TAGGAGAAGATCAAGATTCTGTCAACCTCACTGTGCATTTTGCACCAACTATCACATTTCTCGAATCTCCAACC  888
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  815  TAGGAGAAGATCAAGATTCTGTGAACCTCACTGTGCATTTTGCGCCAACTATCACGTTTCTCGAGTCTCCAACC  888

Query  889  TCAGACCACCACTGGTGCATTCCATTCACTGTGAAAGGCAACCCCAAACCAGCGCTTCAGTGGTTCTATAACGG  962
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct  889  TCAGATCACCACTGGTGCATTCCATTCACTGTGAGAGGCAACCCCAAGCCTGCGCTTCAGTGGTTCTACAATGG  962

Query  963  GGCAATATTGAATGAGTCCAAATACATCTGTACTAAAATACATGTTACCAATCACACGGAGTACCACGGCTGCC  1036
            |||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  963  GGCCATACTGAATGAGTCCAAGTACATCTGTACTAAGATCCACGTCACCAATCACACGGAGTACCATGGCTGCC  1036

Query 1037  TCCAGCTGGATAATCCCACTCACATGAACAATGGGGACTACACTCTAATAGCCAAGAATGAGTATGGGAAGGAT  1110
            |||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  TCCAGCTGGATAACCCCACTCATATGAATAACGGAGACTACACCCTGATGGCCAAGAACGAGTATGGGAAGGAT  1110

Query 1111  GAGAAACAGATTTCTGCTCACTTCATGGGCTGGCCTGGAATTGACGATGGTGCAAACCCAAATTATCCTGATGT  1184
            ||||.||||||.||.|||||||||||||||.||||||||.|.|||.|.|...|||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1111  GAGAGACAGATCTCCGCTCACTTCATGGGCCGGCCTGGAGTCGACTACGAGACAAACCCAAATTACCCTGAAGT  1184

Query 1185  AATTTATGAAGATTATGGA--ACTGCAGCGAA-TGACATCGGGGACACCACGAACAGAAGTAATGAAATCCCTT  1255
            ..|.||||||||  .||||  ||    ||.|| ||||||.|||||.||.|||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct 1185  CCTCTATGAAGA--CTGGACCAC----GCCAACTGACATTGGGGATACTACGAACAAAAGTAATGAAATCCCCT  1252

Query 1256  CCACAGACGTCACTGATAAAACCGGTCGGGAACATCTCTCGGTCTATGCTGTGGTGGTGATTGCGTCTGTGGTG  1329
            ||||.||.||..||||..|||.|..||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1253  CCACGGATGTTGCTGACCAAAGCAATCGGGAGCATCTCTCGGTCTATGCCGTGGTGGTGATTGCATCTGTGGTG  1326

Query 1330  GGATTTTGCCTTTTGGTAATGCTGTTTCTGCTTAAGTTGGCAAGACACTCCAAGTTTGGCATGAAAGG------  1397
            |||||.|||||..||||.|||.||.|.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||      
Sbjct 1327  GGATTCTGCCTGCTGGTGATGTTGCTCCTGCTCAAGTTGGCGAGACATTCCAAGTTTGGCATGAAAGGAGGAAG  1400

Query 1398  ---------TTTTGTT--TTGTTTCATAAGATCCCACTGGATGGG-----------------------------  1431
                     ||.||.|  .||.|||.|||         ||.||.|                             
Sbjct 1401  CGGCTGGATTTATGATGACTGGTTCTTAA---------GGCTGAGAAATAGCAGCAAGGATATGATACTACACA  1465

Query 1432  -----------  1431
                       
Sbjct 1466  TCAAGACAGAA  1476