Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01147
• Subject: NM_008797.3
• Aligned Length: 3534
• Identities: 3151
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCTGAAGTTCCGAACAGTCCATGGGGGCCTGAGGCTCCTGGGAATCCGCCGAACCTCCACCGCCCCCGCTGC  74
            |||||||||||||.||||||.|..||||||||||||||||||||..||||||||.|||||.|.|||||.|.|||
Sbjct    1  ATGCTGAAGTTCCAAACAGTTCGAGGGGGCCTGAGGCTCCTGGGTGTCCGCCGATCCTCCTCGGCCCCTGTTGC  74

Query   75  CTCCCCAAATGTCCGGCGCCTGGAGTATAAGCCCATCAAGAAAGTCATGGTGGCCAACAGAGGTGAGATTGCCA  148
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCCCAAATGTCCGGCGTCTGGAGTATAAGCCTATCAAGAAAGTAATGGTGGCCAACAGAGGTGAGATTGCCA  148

Query  149  TCCGTGTGTTCCGGGCCTGCACGGAGCTGGGCATCCGCACCGTAGCCATCTACTCTGAGCAGGACACGGGCCAG  222
            ||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.||..|||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  149  TCCGAGTGTTTCGTGCGTGCACAGAGCTGGGTATCCGCACAGTGGCTGTCTACTCGGAGCAGGACACAGGGCAG  222

Query  223  ATGCACCGGCAGAAAGCAGATGAAGCCTATCTCATCGGCCGCGGCCTGGCCCCCGTGCAGGCCTACCTGCACAT  296
            ||||||.||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGCACAGGCAGAAAGCTGATGAAGCCTACCTTATTGGCCGTGGCCTGGCACCTGTGCAGGCCTACCTGCACAT  296

Query  297  CCCAGACATCATCAAGGTGGCCAAGGAGAACAACGTAGATGCAGTGCACCCTGGCTACGGGTTCCTCTCTGAGC  370
            .||||||||||||||||||||||||||.||....||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  297  TCCAGACATCATCAAGGTGGCCAAGGAAAATGGTGTAGATGCGGTGCATCCTGGCTATGGGTTCCTCTCAGAGC  370

Query  371  GAGCGGACTTCGCCCAGGCCTGCCAGGATGCAGGGGTCCGGTTTATTGGGCCAAGCCCAGAAGTGGTCCGCAAG  444
            ||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  GAGCAGACTTTGCCCAGGCCTGCCAAGATGCTGGAGTCCGGTTCATTGGTCCAAGCCCAGAGGTGGTCCGCAAG  444

Query  445  ATGGGAGACAAGGTGGAGGCCCGGGCCATCGCCATTGCTGCGGGTGTTCCCGTTGTCCCTGGCACAGATGCCCC  518
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||..||||
Sbjct  445  ATGGGAGACAAGGTGGAAGCCCGGGCCATTGCCATCGCTGCAGGCGTTCCAGTGGTCCCCGGCACGGACTCCCC  518

Query  519  CATCACGTCCCTGCATGAGGCCCACGAGTTCTCCAACACCTACGGCTTCCCCATCATCTTCAAGGCGGCCTATG  592
            |||||..||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct  519  CATCAGCTCCCTGCACGAGGCGCATGAGTTCTCCAACACCTACGGCTTCCCTATTATCTTCAAGGCCGCCTACG  592

Query  593  GGGGTGGAGGGCGTGGCATGAGGGTGGTGCACAGCTACGAGGAGCTGGAGGAGAATTACACCCGGGCCTACTCA  666
            |.|||||.||.||.||||||.||||.|||||.|||||.||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  GAGGTGGGGGCCGCGGCATGCGGGTCGTGCATAGCTATGAGGAGTTGGAAGAGAATTACACCCGGGCCTACTCC  666

Query  667  GAGGCTCTGGCCGCCTTTGGGAATGGGGCGCTGTTTGTGGAGAAGTTCATCGAGAAGCCACGGCACATCGAGGT  740
            |||||..||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||
Sbjct  667  GAGGCCTTGGCAGCCTTTGGGAATGGAGCGTTGTTTGTGGAGAAGTTCATTGAGAAGCCAAGGCACATTGAGGT  740

Query  741  GCAGATCTTGGGGGACCAGTATGGGAACATCCTGCACCTGTACGAGCGAGACTGCTCCATCCAGCGGCGGCACC  814
            |||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  741  GCAGATCCTAGGGGACCAGTATGGGAACATCCTGCACCTGTACGAGCGAGACTGCTCCATCCAGCGTCGGCACC  814

Query  815  AGAAGGTGGTCGAGATTGCCCCCGCCGCCCACCTGGACCCGCAGCTTCGGACTCGGCTCACCAGCGACTCTGTG  888
            ||||||||||.|||||.|||||.||..||||||||||.||.||.|||||..|.||.||||||||.||||||||.
Sbjct  815  AGAAGGTGGTAGAGATCGCCCCTGCTACCCACCTGGATCCCCAACTTCGCTCACGTCTCACCAGTGACTCTGTC  888

Query  889  AAACTCGCTAAACAGGTGGGCTACGAGAACGCAGGCACCGTGGAGTTCCTGGTGGACAGGCACGGCAAGCACTA  962
            |||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  889  AAACTTGCCAAGCAGGTAGGCTATGAGAACGCCGGCACTGTGGAGTTCCTGGTGGACAAGCACGGCAAGCACTA  962

Query  963  CTTCATCGAGGTCAACTCCCGCCTGCAGGTGGAGCACACGGTCACAGAGGAGATCACCGACGTAGACCTGGTCC  1036
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct  963  CTTCATCGAGGTCAATTCCCGCCTGCAGGTGGAGCACACGGTCACCGAGGAGATCACAGATGTGGACCTGGTCC  1036

Query 1037  ATGCTCAGATCCACGTGGCTGAGGGCAGGAGCCTACCCGACCTGGGCCTGCGGCAGGAGAACATCCGCATCAAC  1110
            |||||||||||||||||.|.||.|||.|||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  ATGCTCAGATCCACGTGTCCGAAGGCCGGAGCCTGCCTGACCTGGGCCTGCGGCAGGAGAACATCCGCATCAAT  1110

Query 1111  GGGTGTGCCATCCAGTGCCGGGTCACCACCGAGGACCCCGCGCGCAGCTTCCAGCCGGACACCGGCCGCATTGA  1184
            ||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGCTGTGCCATTCAGTGTCGGGTCACCACCGAGGACCCTGCACGCAGCTTCCAGCCAGACACCGGCCGCATTGA  1184

Query 1185  GGTGTTCCGGAGCGGAGAGGGCATGGGCATCCGCCTGGATAATGCTTCCGCCTTCCAAGGAGCCGTCATCTCGC  1258
            |||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 1185  GGTTTTCCGGAGTGGTGAGGGCATGGGCATCCGCCTGGACAACGCCTCTGCATTCCAGGGCGCTGTCATATCGC  1258

Query 1259  CCCACTACGACTCCCTGCTGGTCAAAGTCATTGCCCACGGCAAAGACCACCCCACGGCCGCCACCAAGATGAGC  1332
            |||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCACTATGACTCTCTGCTCGTCAAGGTCATTGCACACGGCAAAGACCACCCCACAGCTGCCACCAAGATGAGC  1332

Query 1333  AGGGCCCTTGCGGAGTTCCGCGTCCGAGGTGTGAAGACCAACATCGCCTTCCTGCAGAATGTGCTCAACAACCA  1406
            ||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  AGAGCCCTGGCCGAGTTCCGTGTCCGAGGTGTAAAGACCAACATCCCCTTCCTGCAGAATGTTCTCAACAACCA  1406

Query 1407  GCAGTTCCTGGCAGGCACTGTGGACACCCAGTTCATCGACGAGAACCCAGAGCTGTTCCAGCTGCGGCCTGCAC  1480
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1407  GCAGTTCCTGGCAGGCACAGTGGACACCCAGTTCATCGATGAGAACCCTGAGCTGTTCCAGCTTCGGCCTGCAC  1480

Query 1481  AGAACCGGGCCCAAAAGCTGTTGCACTACCTCGGCCATGTCATGGTAAACGGTCCAACCACCCCGATTCCCGTC  1554
            |||||||||||||.|||.||.|.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 1481  AGAACCGGGCCCAGAAGTTGCTACATTACCTCGGACATGTCATGGTGAATGGCCCTACCACTCCAATCCCTGTC  1554

Query 1555  AAGGCCAGCCCCAGCCCCACGGACCCCGTTGTCCCTGCAGTGCCCATAGGCCCGCCCCCGGCTGGTTTCAGAGA  1628
            ||.|..||||||||.||...|||.||.|.|||.||||..||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1555  AATGTGAGCCCCAGTCCTGTGGATCCTGCTGTTCCTGTGGTGCCCATAGGCCCACCTCCAGCTGGTTTCAGGGA  1628

Query 1629  CATCCTGCTGCGAGAGGGGCCTGAGGGCTTTGCTCGAGCTGTGCGGAACCACCCGGGGCTGCTGCTGATGGACA  1702
            ||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||.||||||||||.|||||||||
Sbjct 1629  CATCCTTCTGCGAGAAGGGCCAGAGGGCTTTGCCCGAGCTGTGCGGAATCACCAGGGGCTGCTGTTGATGGACA  1702

Query 1703  CGACCTTCAGGGACGCCCACCAGTCACTGCTGGCCACTCGTGTGCGCACCCACGATCTCAAAAAGATCGCCCCC  1776
            |.||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1703  CAACCTTCCGGGATGCCCACCAGTCACTACTGGCCACTAGAGTGCGCACACATGATCTCAAAAAGATTGCGCCC  1776

Query 1777  TATGTTGCCCACAACTTCAGCAAGCTCTTCAGCATGGAGAACTGGGGAGGAGCCACGTTTGACGTCGCCATGCG  1850
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1777  TATGTTGCCCACAACTTCAACAAGCTCTTCAGCATGGAGAACTGGGGAGGCGCCACGTTCGACGTTGCCATGCG  1850

Query 1851  CTTCCTGTATGAGTGCCCCTGGCGGCGGCTGCAGGAGCTCCGGGAGCTCATCCCCAACATCCCTTTCCAGATGC  1924
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1851  CTTCCTGTACGAGTGCCCCTGGCGGCGGCTCCAGGAGCTCCGGGAGCTTATCCCGAACATCCCGTTCCAGATGC  1924

Query 1925  TGCTGCGGGGGGCCAATGCTGTGGGCTACACCAACTACCCAGACAACGTGGTCTTCAAGTTCTGTGAAGTGGCC  1998
            |.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1925  TACTGAGGGGGGCCAATGCTGTGGGCTACACCAACTACCCTGACAACGTGGTCTTCAAGTTCTGTGAGGTGGCC  1998

Query 1999  AAAGAGAATGGCATGGATGTCTTCCGTGTGTTTGACTCCCTCAACTACTTGCCCAACATGCTGCTGGGCATGGA  2072
            |||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAAGAGAATGGTATGGACGTCTTCCGAGTCTTTGACTCCCTCAACTACTTGCCAAACATGCTGCTGGGCATGGA  2072

Query 2073  GGCGGCAGGAAGTGCCGGAGGCGTGGTGGAGGCTGCCATCTCATACACGGGCGACGTGGCCGACCCCAGCCGCA  2146
            .||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 2073  AGCAGCAGGCAGTGCTGGGGGTGTGGTGGAGGCTGCCATCTCATACACGGGGGACGTGGCTGACCCTAGTCGCA  2146

Query 2147  CCAAGTACTCACTGCAGTACTACATGGGCTTGGCCGAAGAGCTGGTGCGAGCTGGCACCCACATCCTGTGCATC  2220
            |.||.|||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 2147  CTAAATACTCACTGGAGTACTACATGGGCTTAGCTGAAGAACTGGTGCGAGCTGGCACTCACATCCTGTGCATT  2220

Query 2221  AAGGACATGGCCGGGCTGCTGAAGCCCACGGCCTGCACCATGCTGGTCAGCTCCCTCCGGGACCGCTTCCCCGA  2294
            |||||||||||.||.|||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2221  AAGGACATGGCGGGCCTGCTGAAGCCTGCCGCCTGCACCATGCTGGTCAGCTCCCTCCGGGACCGATTCCCCGA  2294

Query 2295  CCTCCCACTGCACATCCACACCCACGACACGTCAGGGGCAGGCGTGGCAGCCATGCTGGCCTGTGCCCAGGCTG  2368
            ||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 2295  CCTCCCACTGCACATCCATACCCATGATACATCAGGGGCAGGTGTGGCAGCCATGCTGGCCTGTGCACAAGCAG  2368

Query 2369  GAGCTGATGTGGTGGATGTGGCAGCTGATTCCATGTCTGGGATGACTTCACAGCCCAGCATGGGGGCCCTGGTG  2442
            |.||||||||.|||||.|||||||..||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GGGCTGATGTTGTGGACGTGGCAGTAGACTCCATGTCTGGGATGACCTCACAGCCAAGCATGGGGGCCCTGGTG  2442

Query 2443  GCCTGTACCAGAGGGACTCCCCTGGACACAGAGGTGCCCATGGAGCGCGTGTTTGACTACAGTGAGTACTGGGA  2516
            ||||||||||.|||||||||..|||||||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GCCTGTACCAAAGGGACTCCTTTGGACACAGAGGTACCCCTGGAGCGTGTGTTTGACTACAGTGAGTACTGGGA  2516

Query 2517  GGGGGCTCGGGGACTGTACGCGGCCTTCGACTGCACGGCCACCATGAAGTCTGGCAACTCGGACGTGTATGAAA  2590
            .||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 2517  AGGGGCTCGGGGACTGTACGCAGCCTTCGATTGCACGGCTACCATGAAGTCTGGCAACTCCGACGTGTATGAGA  2590

Query 2591  ATGAGATCCCAGGGGGCCAGTACACCAACCTGCACTTCCAGGCCCACAGCATGGGGCTTGGCTCCAAGTTCAAG  2664
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ATGAGATTCCAGGGGGCCAGTACACCAACCTGCACTTCCAGGCCCATAGCATGGGGCTTGGCTCCAAGTTCAAG  2664

Query 2665  GAGGTCAAGAAGGCCTATGTGGAGGCCAACCAGATGCTGGGCGATCTCATCAAGGTGACGCCCTCCTCCAAGAT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 2665  GAGGTCAAGAAGGCCTATGTGGAGGCTAACCAGATGCTGGGGGACCTCATCAAGGTGACACCATCCTCCAAGAT  2738

Query 2739  CGTGGGGGACCTGGCCCAGTTTATGGTGCAGAATGGATTGAGCCGGGCAGAGGCCGAAGCTCAGGCGGAAGAGC  2812
            .||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2739  TGTGGGGGACCTGGCCCAGTTCATGGTGCAGAATGGGTTGAGCCGGGCAGAGGCAGAAGCTCAGGCAGAAGAGC  2812

Query 2813  TGTCCTTTCCCCGCTCCGTGGTGGAGTTCCTGCAGGGCTACATCGGTGTCCCCCATGGGGGGTTCCCCGAACCC  2886
            |||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||..|.|||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 2813  TGTCCTTCCCCCGCTCTGTGGTGGAGTTCCTGCAGGGCTACATTGGCATTCCCCATGGGGGTTTCCCTGAGCCC  2886

Query 2887  TTTCGCTCTAAGGTACTGAAGGACCTGCCAAGGGTGGAGGGGCGGCCTGGAGCCTCCCTCCCTCCCCTGGATCT  2960
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 2887  TTTCGCTCTAAGGTGCTAAAGGACCTGCCAAGAATAGAGGGGCGGCCTGGAGCCTCCCTCCCTCCCCTGAACCT  2960

Query 2961  GCAGGCACTGGAGAAGGAGCTGGTAGACCGGCATGGGGAGGAGGTGACGCCGGAAGATGTGCTCTCAGCAGCTA  3034
            |.|||..|||||||||||.|||.|.||..|||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 2961  GAAGGAGCTGGAGAAGGACCTGATTGATAGGCATGGGGAGGAGGTGACCCCAGAGGACGTCCTCTCTGCAGCCA  3034

Query 3035  TGTACCCCGATGTGTTTGCCCACTTCAAGGACTTCACTGCCACCTTTGGCCCCCTGGATAGCCTGAATACTCGC  3108
            |||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 3035  TGTACCCTGATGTCTTTGCTCAATTCAAAGACTTCACGGCTACCTTCGGCCCCCTGGATAGCCTTAATACTCGT  3108

Query 3109  CTCTTCCTGCAGGGACCCAAGATCGCAGAGGAGTTTGAGGTGGAGCTGGAGCGGGGCAAGACGCTGCACATCAA  3182
            |||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 3109  CTCTTTCTTCAAGGACCCAAAATTGCAGAGGAGTTTGAGGTTGAGCTGGAACGGGGCAAGACCCTGCACATCAA  3182

Query 3183  AGCCCTGGCCGTGAGCGACCTGAACCGGGCCGGCCAGAGGCAGGTCTTCTTTGAGCTCAATGGGCAGCTGCGGT  3256
            |||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 3183  AGCCCTGGCTGTAAGCGACCTGAACCGTGCTGGCCAGAGGCAGGTGTTCTTTGAACTCAATGGGCAGCTTCGAT  3256

Query 3257  CCATCTTGGTCAAGGACACCCAGGCCATGAAGGAGATGCACTTCCACCCCAAGGCCCTAAAGGACGTGAAGGGC  3330
            ||||..||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|.|||||.|||||||||
Sbjct 3257  CCATTCTGGTTAAAGACACCCAGGCCATGAAGGAGATGCACTTCCATCCCAAGGCTTTGAAGGATGTGAAGGGC  3330

Query 3331  CAGATCGGGGCGCCCATGCCTGGGAAGGTGATAGACATCAAAGTGGTGGCAGGGGCCAAGGTGGCCAAGGGCCA  3404
            ||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||..|||||||.|||||||||.||||||||
Sbjct 3331  CAAATTGGGGCCCCGATGCCTGGGAAGGTCATAGACATCAAGGTGGCAGCAGGGGACAAGGTGGCTAAGGGCCA  3404

Query 3405  GCCCCTGTGTGTGCTCAGTGCCATGAAGATGGAGACTGTGGTGACCTCACCCATGGAGGGTACTGTCCGCAAGG  3478
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.||||.||||
Sbjct 3405  GCCCCTCTGTGTGCTCAGCGCCATGAAGATGGAGACTGTGGTGACTTCGCCCATGGAGGGCACTATCCGAAAGG  3478

Query 3479  TTCATGTGACCAAGGACATGACACTGGAAGGTGACGACCTCATCCTGGAGATCGAG  3534
            |||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 3479  TTCATGTTACCAAGGACATGACTCTGGAAGGCGACGACCTCATCCTAGAGATTGAG  3534