Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_01147
Subject:
NM_008797.3
Aligned Length:
1178
Identities:
1140
Gaps:
0

Alignment

Query    1  MLKFRTVHGGLRLLGIRRTSTAPAASPNVRRLEYKPIKKVMVANRGEIAIRVFRACTELGIRTVAIYSEQDTGQ  74
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Sbjct    1  MLKFQTVRGGLRLLGVRRSSSAPVASPNVRRLEYKPIKKVMVANRGEIAIRVFRACTELGIRTVAVYSEQDTGQ  74

Query   75  MHRQKADEAYLIGRGLAPVQAYLHIPDIIKVAKENNVDAVHPGYGFLSERADFAQACQDAGVRFIGPSPEVVRK  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  MHRQKADEAYLIGRGLAPVQAYLHIPDIIKVAKENGVDAVHPGYGFLSERADFAQACQDAGVRFIGPSPEVVRK  148

Query  149  MGDKVEARAIAIAAGVPVVPGTDAPITSLHEAHEFSNTYGFPIIFKAAYGGGGRGMRVVHSYEELEENYTRAYS  222
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  MGDKVEARAIAIAAGVPVVPGTDSPISSLHEAHEFSNTYGFPIIFKAAYGGGGRGMRVVHSYEELEENYTRAYS  222

Query  223  EALAAFGNGALFVEKFIEKPRHIEVQILGDQYGNILHLYERDCSIQRRHQKVVEIAPAAHLDPQLRTRLTSDSV  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||
Sbjct  223  EALAAFGNGALFVEKFIEKPRHIEVQILGDQYGNILHLYERDCSIQRRHQKVVEIAPATHLDPQLRSRLTSDSV  296

Query  297  KLAKQVGYENAGTVEFLVDRHGKHYFIEVNSRLQVEHTVTEEITDVDLVHAQIHVAEGRSLPDLGLRQENIRIN  370
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Sbjct  297  KLAKQVGYENAGTVEFLVDKHGKHYFIEVNSRLQVEHTVTEEITDVDLVHAQIHVSEGRSLPDLGLRQENIRIN  370

Query  371  GCAIQCRVTTEDPARSFQPDTGRIEVFRSGEGMGIRLDNASAFQGAVISPHYDSLLVKVIAHGKDHPTAATKMS  444
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Sbjct  371  GCAIQCRVTTEDPARSFQPDTGRIEVFRSGEGMGIRLDNASAFQGAVISPHYDSLLVKVIAHGKDHPTAATKMS  444

Query  445  RALAEFRVRGVKTNIAFLQNVLNNQQFLAGTVDTQFIDENPELFQLRPAQNRAQKLLHYLGHVMVNGPTTPIPV  518
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Sbjct  445  RALAEFRVRGVKTNIPFLQNVLNNQQFLAGTVDTQFIDENPELFQLRPAQNRAQKLLHYLGHVMVNGPTTPIPV  518

Query  519  KASPSPTDPVVPAVPIGPPPAGFRDILLREGPEGFARAVRNHPGLLLMDTTFRDAHQSLLATRVRTHDLKKIAP  592
            ..||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  NVSPSPVDPAVPVVPIGPPPAGFRDILLREGPEGFARAVRNHQGLLLMDTTFRDAHQSLLATRVRTHDLKKIAP  592

Query  593  YVAHNFSKLFSMENWGGATFDVAMRFLYECPWRRLQELRELIPNIPFQMLLRGANAVGYTNYPDNVVFKFCEVA  666
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Sbjct  593  YVAHNFNKLFSMENWGGATFDVAMRFLYECPWRRLQELRELIPNIPFQMLLRGANAVGYTNYPDNVVFKFCEVA  666

Query  667  KENGMDVFRVFDSLNYLPNMLLGMEAAGSAGGVVEAAISYTGDVADPSRTKYSLQYYMGLAEELVRAGTHILCI  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  667  KENGMDVFRVFDSLNYLPNMLLGMEAAGSAGGVVEAAISYTGDVADPSRTKYSLEYYMGLAEELVRAGTHILCI  740

Query  741  KDMAGLLKPTACTMLVSSLRDRFPDLPLHIHTHDTSGAGVAAMLACAQAGADVVDVAADSMSGMTSQPSMGALV  814
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Sbjct  741  KDMAGLLKPAACTMLVSSLRDRFPDLPLHIHTHDTSGAGVAAMLACAQAGADVVDVAVDSMSGMTSQPSMGALV  814

Query  815  ACTRGTPLDTEVPMERVFDYSEYWEGARGLYAAFDCTATMKSGNSDVYENEIPGGQYTNLHFQAHSMGLGSKFK  888
            |||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTKGTPLDTEVPLERVFDYSEYWEGARGLYAAFDCTATMKSGNSDVYENEIPGGQYTNLHFQAHSMGLGSKFK  888

Query  889  EVKKAYVEANQMLGDLIKVTPSSKIVGDLAQFMVQNGLSRAEAEAQAEELSFPRSVVEFLQGYIGVPHGGFPEP  962
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Sbjct  889  EVKKAYVEANQMLGDLIKVTPSSKIVGDLAQFMVQNGLSRAEAEAQAEELSFPRSVVEFLQGYIGIPHGGFPEP  962

Query  963  FRSKVLKDLPRVEGRPGASLPPLDLQALEKELVDRHGEEVTPEDVLSAAMYPDVFAHFKDFTATFGPLDSLNTR  1036
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Sbjct  963  FRSKVLKDLPRIEGRPGASLPPLNLKELEKDLIDRHGEEVTPEDVLSAAMYPDVFAQFKDFTATFGPLDSLNTR  1036

Query 1037  LFLQGPKIAEEFEVELERGKTLHIKALAVSDLNRAGQRQVFFELNGQLRSILVKDTQAMKEMHFHPKALKDVKG  1110
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Sbjct 1037  LFLQGPKIAEEFEVELERGKTLHIKALAVSDLNRAGQRQVFFELNGQLRSILVKDTQAMKEMHFHPKALKDVKG  1110

Query 1111  QIGAPMPGKVIDIKVVAGAKVAKGQPLCVLSAMKMETVVTSPMEGTVRKVHVTKDMTLEGDDLILEIE  1178
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Sbjct 1111  QIGAPMPGKVIDIKVAAGDKVAKGQPLCVLSAMKMETVVTSPMEGTIRKVHVTKDMTLEGDDLILEIE  1178