Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_01209
Subject:
XM_006517158.3
Aligned Length:
945
Identities:
862
Gaps:
3

Alignment

Query   1  ATGGACGCCTTCAAGGGGGGCATGAGCCTGGAGCGGCTGCCGGAGGGGCTCCGGCCGCCGCCGCCGCCACCCCA  74
           |||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct   1  ATGGACGCCTTCAAGGGAGGCATGAGCCTGGAGAGGCTACCGGAGGGGCTGCGGCCACCGCCACCACCACCGCA  74

Query  75  TGACATGGGGCCCGCCTTCCACCTGGCCCGGCCCGCCGACCCCCGCGAGCCGCTCGAGAACTCCGCCAGCGAGT  148
           .||||||||||||..|||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  75  CGACATGGGGCCCAGCTTCCACCTGGCCCGCGCCGCCGACCCCCGGGAGCCGCTGGAGAACTCCGCCAGCGAAT  148

Query 149  CGTCTGACACGGAGCTGCCAGAGAAGGAGCGCGGCGGGGAACCCAAGGGGCCCGAGGACAGTGGTGCGGGAGGC  222
           ||||.|||.|.||.||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||.|||||..||||.|||||..|.
Sbjct 149  CGTCCGACGCTGATCTGCCAGACAAGGAGCGCGGTGGGGAAGCCAAGGGGCCAGAGGATGGTGGCGCGGGCAGT  222

Query 223  ACGGGCTGCGGCGGC---GCAGACGACCCAGCCAAGAAGAAGAAGCAGCGGCGGCAACGTACGCACTTCACAAG  293
           .|.||||||||||||   |||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 223  GCTGGCTGCGGCGGCGGTGCAGAGGACCCAGCTAAGAAGAAGAAACAGCGGCGGCAACGCACTCACTTCACAAG  296

Query 294  CCAGCAGTTGCAAGAGCTAGAGGCCACGTTCCAGAGGAACCGCTACCCCGACATGAGCATGAGGGAGGAGATCG  367
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Sbjct 297  CCAGCAGTTGCAAGAGCTGGAGGCCACGTTCCAAAGGAACCGCTACCCCGACATGAGCATGAGAGAGGAGATCG  370

Query 368  CCGTGTGGACCAACCTCACCGAGCCGCGCGTGCGGGTCTGGTTCAAGAACCGGCGAGCCAAGTGGCGTAAGCGC  441
           |.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 371  CGGTGTGGACCAACCTCACTGAACCGCGAGTGCGGGTCTGGTTCAAGAACCGGCGAGCCAAATGGCGCAAGCGG  444

Query 442  GAGCGTAACCAGCAGCTGGACCTGTGCAAGGGTGGCTACGTGCCGCAGTTCAGCGGCCTAGTGCAGCCCTACGA  515
           |||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 445  GAGCGGAACCAGCAGTTGGACCTGTGCAAGGGCGGCTATGTGCCGCAGTTCAGCGGCCTGGTGCAGCCCTACGA  518

Query 516  GGACGTGTACGCCGCCGGCTACTCCTACAACAACTGGGCCGCCAAGAGCCTGGCGCCAGCGCCGCTCTCCACCA  589
           ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||
Sbjct 519  GGACGTGTACGCTGCCGGCTACTCCTACAACAACTGGGCGGCCAAGAGCCTGGCCCCGGCGCCGCTGTCTACCA  592

Query 590  AGAGCTTCACCTTCTTCAACTCCATGAGCCCGCTGTCGTCGCAGTCCATGTTCTCAGCACCCAGCTCCATCTCC  663
           |||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 593  AGAGCTTTACCTTCTTCAACTCCATGAGCCCGCTCTCCTCTCAATCCATGTTCTCGGCCCCCAGCTCCATCTCT  666

Query 664  TCCATGACCATGCCGTCCAGCATGGGCCCAGGCGCCGTGCCTGGCATGCCCAACTCGGGCCTCAACAACATCAA  737
           |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  TCCATGACCATGCCGTCCAGCATGGGCCCGGGCGCCGTGCCCGGCATGCCCAACTCGGGCCTCAACAACATCAA  740

Query 738  CAACCTCACCGGCTCCTCGCTCAACTCGGCCATGTCGCCGGGCGCTTGCCCGTACGGCACTCCCGCCTCGCCCT  811
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Sbjct 741  CAACCTCACCGGCTCCTCGCTCAACTCGGCCATGTCGCCGGGCGCCTGCCCCTACGGCACCCCAGCCTCGCCCT  814

Query 812  ACAGCGTCTACCGGGACACGTGCAACTCGAGCCTAGCCAGCCTGCGGCTCAAGTCCAAACAGCACTCGTCGTTT  885
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Sbjct 815  ACAGCGTCTACCGGGACACGTGCAACTCGAGCCTTGCCAGCCTGCGGCTCAAGTCCAAGCAGCACTCGTCGTTT  888

Query 886  GGCTACGGCGGCCTGCAGGGCCCGGCCTCGGGCCTCAACGCGTGCCAGTACAACAGC  942
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Sbjct 889  GGCTATGGCGGTCTGCAGGGTCCGGCGTCGGGGCTCAACGCTTGCCAGTACAACAGC  945