Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01257
• Subject: XM_011238772.2
• Aligned Length: 1457
• Identities: 1112
• Gaps: 184

Alignment

Query    1  ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCATCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGTGAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAATTAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCT-  221
            |||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.||||||| 
Sbjct    1  ATGGTGCGATCTTTGAACTTGGACCTCGAGGGATTAGGCCGGCTGGAGCCCTGGGAGCCCGGACCCTGCTCCTG  74

Query  222  ---------------GGTTTCTGAGCTTGGCTTGGATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTG  280
                           |||||||||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct   75  GGCTTGTGGAGAACAGGTTTCTGAACTTGGCTTGGAGTCTGAAGTCTTGCCTGTCCGAGGGGATCACCCAGCTG  148

Query  281  CCCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTGCATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCT  354
            ||||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||..|.||||||.|.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  CCCAGAACAGGTTCCTGTATGTAGGCGGTACCCTGCACCCTCTACCCTCCGGCCTCAGGGGGCTACTCCGTCCT  222

Query  355  TCACCCCCCTTCTCCAAACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGA  428
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||...||||||.||||||||||||||||
Sbjct  223  TCACCCCCCTTCTCAAAACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGTTGCTGAAGCCCAGGGGCAAAGAGCCTGA  296

Query  429  TGAGACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCC  502
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  TGAAACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGGTGGCATCTTTAGCCATGGACAGTCTTTGCC  370

Query  503  GTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGCATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAA  576
            |.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  GAGGAGTATTTGCTGGCAACAGCCGGGAGCTCAGCATCCGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAACAA  444

Query  577  ACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGGGGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCG  650
            |||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|.||..||.|||||.||.||..||||.|||||
Sbjct  445  ACCCACCGGTCCATATTGCTGGGGCTGCTGCTGGGCGCAGGACAGAGTCCCCAGCCGGATTCCTCACTAATTCG  518

Query  651  CCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCACTTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAA  724
            .||||||..|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||.|||||||.|||||.|||.|.|
Sbjct  519  TCAGGCCCGGGCTGAGCGATGGAGCCAGTGGTCACTCCGTGGAGGGCTGGAGGTGTTGCCCCAGGCTCTTCACA  592

Query  725  CCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGAGGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGG  798
            ..|||||..|.||||..|||||||.|||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct  593  ATCACCTAGCAAGTAAAGGGGTCACTGTCCTCAGTGGGCAGCCAGTCTGTGGGCTCAGCCTTCAGCCAGAAGGG  666

Query  799  CGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCT  872
            |||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||.|||
Sbjct  667  CGCTGGAAGGTGTCTCTAGGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACATTATAAGTGCCATTCCAGCTTCAGAGCT  740

Query  873  CAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGGCTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTG  946
            |||..|||||||||||||.||||||||.|||||.|||||...|||||||.||||||..|||||||||||.||||
Sbjct  741  CAGCAAGCTGCTCCCTGCCGAGGCTGCACCTCTAGCTCGAATCCTGAGTACCATCAAGGCAGTGTCTGTTGCTG  814

Query  947  TGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGAT  1020
            ||||||||||||||||||.||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  815  TGGTGAATCTGCAGTACCGAGGAGCTTGTCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCGTCAGAAGAC  888

Query 1021  CCAGGA--GTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGCTTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGA  1092
            ||  ||  |||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||.||||||..||||||||
Sbjct  889  CC--GACTGTCCTGGGAATTGTGTACGACTCGGTGGCTTTTCCTGAACAGGATGGGAACCCCCCAAGCCTCAGA  960

Query 1093  GTGACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACACTGGAGGCTAGTGG--------CTGTGTCTTATCTCAG  1158
            ||||||||||||.|||||||||.||||.||||||..||..|.||| |.||        |||       ||||..
Sbjct  961  GTGACTGTGATGTTGGGAGGTTACTGGCTACAGAAGCTAAAAGCT-GCGGGCCACCAACTG-------TCTCCA  1026

Query 1159  GAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTAGGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTT  1232
            ||||||||.||.||.|..||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||....|||||.||||||.|
Sbjct 1027  GAGCTGTTCCAGCAACAAGCCCAGGAGGCAGCCGCCACACAGTTAGGACTGAAAGAACCACCGAGTCACTGCCT  1100

Query 1233  GGTCCATCTACACAAGAACTGCATTCCCCAGTATACACTAGGTCACTGGCAAAAACTAGAGTCAGCTAGGCAAT  1306
            |||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1101  GGTCCATCTACACAAGAACTGTATCCCTCAGTATACAATAGGCCACTGGCAAAAACTAGACTCAGCTATGCAAT  1174

Query 1307  TCCTGACTGCTCACAGGTTGCCCCTGACTCTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGAGTTGCTGTTAATGACTGTATA  1380
            |||||||.||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1175  TCCTGACGGCCCAGAGGTTGCCCCTGACTTTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGGGTTGCTGTCAATGACTGTATA  1248

Query 1381  GAGAGTGGGCGCCAGGCAGCAGTCAGTGTCCTGGGCACAGAACCTAACAGC  1431
            |||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1249  GAGAGTGGGCGCCAGGCAGCAGTTGCTGTCCTGGGCACAGAATCTAACAGC  1299