Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01279
- Subject:
- XM_005269019.4
- Aligned Length:
- 1214
- Identities:
- 883
- Gaps:
- 331
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACCCTCGCCGTCAGCCGGATCCGTGCGGTCCGCGAGGACCCGGGGGAGGGCGGTTACCGAGGCCCGCCACC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCCGGAAGGGTGGGTTCCTTGCCTTCCGCCCCAGTCTGGCGACTGCCATGACGTGGGCGGAAGTGGCGTCGCCG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------A 1
|
Sbjct 149 CACCGGATGTGGGGCGGGGCCTGCCCCAAGAGAGTTTCCTAAAGCGAGGAAACCAAGCCGGGCGCCTCTTGCAA 222
Query 2 TGGAGACGGTCATTTCTTCAGATAGCTCCCCAGCTGTGGAAAATGAGCATCCTCAAGAGACCCCAGAATCCAAC 75
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGGAGACGGTCATTTCTTCAGATAGCTCCCCAGCTGTGGAAAATGAGCATCCTCA------------------- 277
Query 76 AATAGCGTGTATACTTCCTTCATGAAGTCTCATCGCTGCTATGACCTGATTCCCACAAGCTCCAAATTGGTTGT 149
Sbjct 278 -------------------------------------------------------------------------- 277
Query 150 ATTTGATACGTCCCTGCAGGTGAAGAAAGCTTTTTTTGCTTTGGTGACTAACGGTGTACGAGCTGCCCCTTTAT 223
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 278 -----------------AGGTGAAGAAAGCTTTTTTTGCTTTGGTGACTAACGGTGTACGAGCTGCCCCTTTAT 334
Query 224 GGGATAGTAAGAAGCAAAGTTTTGTGGGCATGCTGACCATCACTGATTTCATCAATATCCTGCACCGCTACTAT 297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 GGGATAGTAAGAAGCAAAGTTTTGTGGGCATGCTGACCATCACTGATTTCATCAATATCCTGCACCGCTACTAT 408
Query 298 AAATCAGCCTTGGTACAGATCTATGAGCTAGAAGAACACAAGATAGAAACTTGGAGAGAGGTGTATCTCCAGGA 371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 AAATCAGCCTTGGTACAGATCTATGAGCTAGAAGAACACAAGATAGAAACTTGGAGAGAGGTGTATCTCCAGGA 482
Query 372 CTCCTTTAAACCGCTTGTCTGCATTTCTCCTAATGCCAGCTTGTTTGATGCTGTCTCTTCATTAATTCGGAACA 445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 CTCCTTTAAACCGCTTGTCTGCATTTCTCCTAATGCCAGCTTGTTTGATGCTGTCTCTTCATTAATTCGGAACA 556
Query 446 AGATCCACAGGCTGCCAGTTATTGACCCAGAATCAGGCAATACTTTGTACATCCTCACCCACAAGCGCATTCTG 519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 AGATCCACAGGCTGCCAGTTATTGACCCAGAATCAGGCAATACTTTGTACATCCTCACCCACAAGCGCATTCTG 630
Query 520 AAGTTCCTCAAATTGTTTATCACTGAGTTCCCCAAGCCAGAGTTCATGTCCAAGTCTCTGGAAGAGCTACAGAT 593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 AAGTTCCTCAAATTGTTTATCACTGAGTTCCCCAAGCCAGAGTTCATGTCCAAGTCTCTGGAAGAGCTACAGAT 704
Query 594 TGGCACCTATGCCAATATTGCTATGGTTCGCACTACCACCCCCGTCTATGTGGCTCTGGGGATTTTTGTACAGC 667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 TGGCACCTATGCCAATATTGCTATGGTTCGCACTACCACCCCCGTCTATGTGGCTCTGGGGATTTTTGTACAGC 778
Query 668 ATCGAGTCTCAGCCCTGCCAGTGGTGGATGAGAAGGGGCGTGTGGTGGACATCTACTCCAAGTTTGATGTTATC 741
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 ATCGAGTCTCAGCCCTGCCAGTGGTGGATGAGAAGGGGCGTGTGGTGGACATCTACTCCAAGTTTGATGTTATC 852
Query 742 AATCTGGCAGCAGAAAAGACCTACAACAACCTAGATGTATCTGTGACTAAAGCCTTGCAACATCGATCACATTA 815
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 853 AATCTGGCAGCAGAAAAGACCTACAACAACCTAGATGTATCTGTGACTAAAGCCTTGCAACATCGATCACATTA 926
Query 816 CTTTGAGGGTGTTCTCAAGTGCTACCTGCATGAGACTCTGGAGACCATCATCAACAGGCTAGTGGAAGCAGAGG 889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 927 CTTTGAGGGTGTTCTCAAGTGCTACCTGCATGAGACTCTGGAGACCATCATCAACAGGCTAGTGGAAGCAGAGG 1000
Query 890 TTCACCGACTTGTAGTGGTGGATGAAAATGATGTGGTCAAGGGAATTGTATCACTGTCTGACATCCTGCAGGCC 963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 TTCACCGACTTGTAGTGGTGGATGAAAATGATGTGGTCAAGGGAATTGTATCACTGTCTGACATCCTGCAGGCC 1074
Query 964 CTGGTGCTCACAGGTGGAGAGAAGAAGCCC 993
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 CTGGTGCTCACAGGTGGAGAGAAGAAGCCC 1104