Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01287
- Subject:
- XM_030254519.1
- Aligned Length:
- 1290
- Identities:
- 887
- Gaps:
- 147
Alignment
Query 1 ATGAGCAGAAGCAAGCGT-GACAACAATTTTTATAGTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTGAAAC 73
|||||||.||||||| || ||||||.|.||.||.|||||.||..|.||.||.||.||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 1 ATGAGCAAAAGCAAG-GTGGACAACCAGTTCTACAGTGTGGAAGTGGGGGACTCAACCTTCACCGTTCTTAAGC 73
Query 74 GATATCAGAATTTAAAACCTATAGGCTCAGGAGCTCAAGGAATAGTATGCGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAA 147
|.||.|||||..|.||.||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||.||.||.||..|.|||||.
Sbjct 74 GCTACCAGAACCTGAAGCCAATTGGCTCTGGGGCTCAGGGAATAGTCTGTGCTGCGTACGACGCTGTCCTTGAC 147
Query 148 AGAAATGTTGCAATCAAGAAGCTAAGCCGACCATTTCAGAATCAGACTCATGCCAAGCGGGCCTACAGAGAGCT 221
||||||||.||.||.||||||||.|||.||||.||.|||||.||.|||||.||||||.||||.|||.|.|||||
Sbjct 148 AGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTTCCAGAACCAAACTCACGCCAAGAGGGCTTACCGGGAGCT 221
Query 222 AGTTCTTATGAAATGTGTTAATCACAAAAATATAATTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAG 295
.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.|||.||.|.||.||||||||.|||||.||||||.|.||.|
Sbjct 222 GGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTATTAGCTTATTAAATGTTTTTACACCCCAGAAAACACTGG 295
Query 296 AAGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTCATGGATGCAAATCTTTGCCAAGTGATTCAGATGGAGCTA 369
|.||.||.||||||||.|||.||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 296 AGGAGTTCCAAGATGTCTACTTAGTGATGGAACTGATGGACGCCAACCTGTGTCAGGTGATTCAGATGGAGCTG 369
Query 370 GATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAGATGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCATTCTGCTGGAATTAT 443
||.||.||..|.|||||.|||.|.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct 370 GACCACGAGCGGATGTCTTACTTGCTGTACCAGATGCTGTGTGGCATCAAGCACCTCCACTCCGCTGGGATCAT 443
Query 444 TCATCGGGACTTAAAGCCCAGTAATATAGTAGTAAAATCTGATTGCACTTTGAAGATTCTTGACTTCGGTCTGG 517
.||..||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||..||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct 444 CCACAGGGACTTAAAACCCAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACACTGAAAATCCTCGACTTCGGACTGG 517
Query 518 CCAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCCTTATGTAGTGACTCGCTACTACAGAGCACCCGAGGTCATC 591
|||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 518 CCAGGACAGCGGGTACAAGCTTCATGATGACTCCGTATGTGGTGACGCGATATTACAGAGCCCCTGAGGTCATC 591
Query 592 CTTGGCATGGGCTACAAGGAAAACGTTGACATTTGGTCAGTTGGGTGCATCATGGGAGAAATGATCAAAGGTGG 665
||.|||||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||...
Sbjct 592 CTGGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACCTGTGGTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATGGTAAAAGGCAC 665
Query 666 TGTTTTGTTCCCAGGTACAGATCATATTGATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTTGGAACACCATGTCCTG 739
.||..|||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct 666 AGTGCTGTTCCCTGGCACTGATCATATTGACCAGTGGAACAAAGTCATCGAGCAGCTAGGAACTCCGTGTCCAG 739
Query 740 AATTCATGAAGAAACTGCAACCAACAGTAAGGACTTACGTTGAAAACAGACCTAAATATGCTGGATATAGCTTT 813
|.||||||||||||.||||.||.|||||.||.|..|||||.||.||..|.||.||.||.||.|||...|.|||.
Sbjct 740 AGTTCATGAAGAAATTGCAGCCCACAGTCAGAAACTACGTGGAGAATCGGCCCAAGTACGCAGGACTCACCTTC 813
Query 814 GAGAAACTCTTCCCTGATGTCCTTTTCCCAGCTGACTCAGAACACAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCAAGGGA 887
...||.|||||.||.|||..|||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 814 CCCAAGCTCTTTCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGATTCTGAGCACAATAAACTTAAAGCCAGCCAAGCCAGGGA 887
Query 888 TTTGTTATCCAAAATGCTGGTAATAGATGCATCTAAAAGGATCTCTGTAGATGAAGCTCTCCAACACCCGTACA 961
||||||.||.||.|||.|.||.||.||..||.|.||.|||||.||.||.||.||.||.||.||.||.|||||||
Sbjct 888 TTTGTTGTCTAAGATGTTAGTGATTGACCCAGCGAAGAGGATATCGGTGGACGACGCACTGCAGCATCCGTACA 961
Query 962 TCAATGTCTGGTATGATCCTTCTGAAGCAGAAGCTCCACCACCAAAGATCCCTGACAAGCAGTTAGATGAAAGG 1035
||||.||.|||||.||.||..||||||..||.||.||.||.||..||||...|||.||||||.|.|||||||||
Sbjct 962 TCAACGTTTGGTACGACCCGGCTGAAGTGGAGGCGCCTCCGCCTCAGATATATGATAAGCAGCTGGATGAAAGG 1035
Query 1036 GAACACACAATAGAAGAGTGGAAAGAATTGATATATAAGGAAGTTATGGACTTGGAGGAGAGAACCAAGAATGG 1109
||.|||||.||.|||||.|||||||||.|.||.||.|||||.||.|||.|||..||.||||..||.||||||||
Sbjct 1036 GAGCACACCATCGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAGGTAATGAACTCAGAAGAGAAGACTAAGAATGG 1109
Query 1110 ---AGTTATACGGGGGCAGCCCTCTCCTT-----TAGGTGCAGCAGTGATCAATGGCTCTCAGCATCCATCATC 1175
|||.|.| ||.||||||||.|||| .|||||||||||
Sbjct 1110 CGTAGTCAAA---GGCCAGCCCTCGCCTTCAGCACAGGTGCAGCAG---------------------------- 1152
Query 1176 ATCGTCGTCTGTCAATGATGTGTCTTCAATGTCAACAGATCCGACTTTGGCCTCTGATACAGACAGCAGTCTAG 1249
Sbjct 1153 -------------------------------------------------------------------------- 1152
Query 1250 AAGCAGCAGCTGGGCCTCTGGGCTGCTGTAGA 1281
Sbjct 1153 -------------------------------- 1152