Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01305
• Subject: XM_011526987.3
• Aligned Length: 1268
• Identities: 853
• Gaps: 361

Alignment

Query    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTC----ACCCGGGAGGACGCAG-GATCCTACACCTT  365
                                               |||||    .|..||||.|..|||| ||....|.|||||
Sbjct    1  -----------------------------------ATGTCCTTGGCAAGGGAAGCTGCAGAGAAAACATACCTT  39

Query  366  ACACATCATAAAGGGAGA-TGATGGGACT-AGAGGAGT----AACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGG  433
            ...|..|  ||||..||| |||   .||| |||.||.|    .||||.|.|.|.||              .|||
Sbjct   40  GGGCGGC--AAAGTAAGACTGA---AACTAAGAAGATTCCAGCACTGCATGCTCCA--------------ATGG  94

Query  434  AGACTCCTAAGCCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGT  507
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   95  AGACTCCCAAGCCCTCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGT  168

Query  508  GACCCTGAGACTCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAA  581
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|
Sbjct  169  GATCCTGAGACTCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGGTTGCA  242

Query  582  GCTGTCCGAAACCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAA  655
            |.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  243  GTTGTCTGAAACCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAA  316

Query  656  TACGGAACCCAGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTAC  729
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  317  TACGGAACCCAGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTAC  390

Query  730  ATCACCATCAACAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAA  803
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  391  ATCACCATCAACAACTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAA  464

Query  804  CTACACCTACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACA  877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  465  CTACACCTACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACA  538

Query  878  GGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGT  951
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct  539  GGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGT  612

Query  952  GGCATCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCAC  1025
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  613  GGCATCCGCAGTTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCAC  686

Query 1026  CTATTACCGTTCAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGA  1099
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  687  CTATTACCGTTCAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGA  760

Query 1100  CAATTAATGAAAAGTTTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCATAGCGGGCTC  1173
            |||||||||..||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  761  CAATTAATGGGAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTC  834

Query 1174  TATGTTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGACTG  1247
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct  835  TATGCTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTGACTG  908

Query 1248  GACAGTTCCC  1257
            ||||.|.|||
Sbjct  909  GACATTACCC  918