Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01305
• Subject: XM_017027002.2
• Aligned Length: 1283
• Identities: 909
• Gaps: 310

Alignment

Query    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAATCCGCCCACAACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||...||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATTTGGTACAAAGGGCAAATGACATAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAAGAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACGCAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCTAAG  444
            ||||||||.||...|||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  TCATAAAGCGACGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCCAAG  444

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||
Sbjct  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGATCTTAACCTGTGATCCTGCGAC  518

Query  519  TCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAGCTGTCCGAAA  592
            |||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.|||
Sbjct  519  TCCAGCCGCAAGCTACCAGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  592

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            |||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTTTATATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCC-------------------------------  709

Query  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  963  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
                                      |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  --------------------------ATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  757

Query 1037  CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGA  1109
            ||||||||..||||||||||||||| ||| ||.||.||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct  758  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTC-GCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGG  830

Query 1110  AAAGTTTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCT  1183
            .||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|||.||.||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct  831  GAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCT  904

Query 1184  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTG---ACTGGACAGTT  1254
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||   |.||||    |
Sbjct  905  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTGGTAAGTGGA----T  974

Query 1255  CCC----------------------  1257
            |||                      
Sbjct  975  CCCAGCATCCTTGGCAATAGGGATT  999