Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01355
- Subject:
- NM_133198.2
- Aligned Length:
- 2553
- Identities:
- 2266
- Gaps:
- 15
Alignment
Query 1 ATGGCGAAGCCCCTGACGGACCAGGAGAAGCGGCGGCAGATCAGCATCCGCGGCATCGTGGGCGTGGAGAACGT 74
|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1 ATGGCAAAGCCCCTGACCGACCAGGAGAAGCGACGGCAGATCAGCATCCGAGGCATCGTGGGCGTAGAGAATGT 74
Query 75 GGCAGAGCTGAAGAAGAGTTTCAACCGGCACCTGCACTTCACGCTGGTCAAGGACCGCAACGTGGCCACCACCC 148
|||.||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 75 GGCCGAGCTGAAAAAGGGTTTCAACCGTCACCTGCACTTCACTCTGGTCAAGGACCGCAATGTGGCCACCCCCC 148
Query 149 GCGACTACTACTTCGCGCTGGCGCACACGGTGCGCGACCACCTGGTGGGGCGCTGGATCCGCACGCAGCAGCAC 222
||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 149 GCGACTACTACTTCGCCCTTGCGCACACAGTGCGCGACCACCTGGTGGGGCGCTGGATCCGTACACAGCAGCAC 222
Query 223 TACTACGACAAGTGCCCCAAGAGGGTATATTACCTCTCTCTGGAATTTTACATGGGCCGAACATTACAGAACAC 296
||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TACTACGACAAGTGTCCCAAGAGGGTGTATTACCTCTCTCTGGAATTTTACATGGGCCGAACATTACAGAACAC 296
Query 297 CATGATCAACCTCGGTCTGCAAAATGCCTGTGATGAGGCCATTTACCAGCTTGGATTGGATATAGAAGAGTTAG 370
||||||||||||.||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 297 CATGATCAACCTTGGCTTACAAAATGCCTGCGATGAGGCCATTTACCAGCTTGGATTGGACATGGAAGAGTTAG 370
Query 371 AAGAAATTGAAGAAGATGCTGGACTTGGCAATGGTGGTCTTGGGAGACTTGCTGCCTGCTTCTTGGATTCCATG 444
|||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||||||
Sbjct 371 AAGAAATTGAAGAAGATGCCGGCCTTGGCAATGGCGGTCTTGGGAGGCTTGCTGCCTGCTTCCTGGACTCCATG 444
Query 445 GCAACCCTGGGACTTGCAGCCTATGGATACGGCATTCGGTATGAATATGGGATTTTCAATCAGAAGATCCGAGA 518
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCAACCCTGGGACTTGCAGCCTATGGCTACGGCATTCGTTATGAATACGGAATCTTCAATCAGAAGATCCGAGA 518
Query 519 TGGATGGCAGGTAGAAGAAGCAGATGATTGGCTCAGATATGGAAACCCTTGGGAGAAGTCCCGCCCAGAATTCA 592
.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||..||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct 519 GGGATGGCAGGTAGAAGAGGCAGATGACTGGCTCAGGCATGGAAACCCTTGGGAGAAGGCTCGCCCTGAATTCA 592
Query 593 TGCTGCCTGTGCACTTCTATGGAAAAGTAGAACACACCAACACCGGGACCAAGTGGATTGACACTCAAGTGGTC 666
|||||||.|||||.|||||.||||.||||||.||||||.|.||.|||||.||||||.|.|||||.||.||||||
Sbjct 593 TGCTGCCCGTGCATTTCTACGGAAGAGTAGAGCACACCCAGACGGGGACAAAGTGGGTCGACACCCAGGTGGTC 666
Query 667 CTGGCTCTGCCATATGACACCCCCGTGCCCGGCTACATGAATAACACTGTCAACACCATGCGCCTCTGGTCTGC 740
|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct 667 CTGGCTCTGCCTTACGACACCCCCGTGCCTGGATATATGAACAACACTGTGAACACTATGCGCCTCTGGTCGGC 740
Query 741 TCGGGCACCAAATGACTTTAACC-TCAGAGACTTTAATGTTGGAGACTACATTCAGGCTGTGCTGGACCGAAAC 813
|||.||||||||||||||||||| ||| |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 741 TCGAGCACCAAATGACTTTAACCTTCA-AGATTTTAATGTTGGAGACTACATTCAGGCTGTGCTGGACCGGAAC 813
Query 814 CTGGCCGAGAACATCTCCCGGGTCCTCTATCCCAATGACAATTTTTTTGAAGGGAAGGAGCTAAGATTGAAGCA 887
|||||.|||||.||||||.|.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||.|..|..||||.||
Sbjct 814 CTGGCTGAGAATATCTCCAGAGTGCTCTACCCCAATGATAACTTCTTTGAAGGGAAGGAGTTGCGGCTGAAACA 887
Query 888 GGAATACTTTGTGGTGGCTGCAACCTTGCAAGATATCATCCGCCGTTTCAAAGCCTCCAAGTTTGGCTCCACCC 961
|||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||.|||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||...
Sbjct 888 GGAGTACTTTGTGGTGGCTGCCACCCTGCAGGATGTCATCCGGCGCTTCAAGGCCTCCAAGTTCGGCTCCAAGG 961
Query 962 GTGGTGCA--GGAACTGTGTTTGATGCCTTCCCGGATCAGGTGGCCATCCAGCTGAATGACACTCACCCTGCAC 1033
.|| ||| |||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 962 ATG--GCATGGGAACCGTGTTTGATGCCTTTCCAGATCAGGTAGCCATCCAGCTGAATGACACACATCCTGCAC 1033
Query 1034 TCGCGATCCCTGAGCTGATGAGGATTTTTGTGGATATTGAAAAACTGCCCTGGTCCAAGGCATGGGAGCTCACC 1107
||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||.
Sbjct 1034 TCGCCATTCCAGAGCTGATGAGGATTTTTGTGGACATTGAAAAACTGCCCTGGGCCAAGGCATGGGAGATCACG 1107
Query 1108 CAGAAGACCTTCGCCTACACCAACCACACAGTGCTCCCGGAAGCCCTGGAGCGCTGGCCCGTGGACCTGGTGGA 1181
.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1108 AAGAAGACCTTCGCCTACACCAACCACACGGTGCTCCCGGAGGCCCTGGAGCGCTGGCCGGTGGAACTGGTGGA 1181
Query 1182 GAAGCTGCTCCCTCGACATTTGGAAATCATTTATGAGATAAATCAGAAGCATTTAGATAGAATTGTGGCCTTGT 1255
|||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1182 GAAGCTGCTGCCTCGACACTTGGAGATCATTTATGAGATCAATCAGAAACATTTAGACAGAATTGTGGCCTTGT 1255
Query 1256 TTCCTAAAGATGTGGACCGTCTGAGAAGGATGTCTCTGATAGAAGAGGAAGGAAGCAAAAGGATCAACATGGCC 1329
||||||||||..|...|||..||.|.||.||||||||.||.||.|||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1256 TTCCTAAAGACATCAGCCGCATGCGGAGAATGTCTCTCATTGAGGAGGAAGGAGGCAAACGGATCAACATGGCC 1329
Query 1330 CATCTCTGCATTGTCGGTTCCCATGCTGTGAATGGCGTGGCTAAAATCCACTCAGACATCGTGAAGACTAAAGT 1403
||.||||||||.||.||.|.|||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||..||||
Sbjct 1330 CACCTCTGCATCGTGGGCTGCCACGCGGTGAACGGTGTAGCAAAGATCCACTCGGACATCGTGAAGACCCAAGT 1403
Query 1404 ATTCAAGGACTTCAGTGAGCTAGAACCTGACAAGTTTCAGAATAAAACCAATGGGATCACTCCAAGGCGCTGGC 1477
|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||
Sbjct 1404 ATTCAAGGACTTCAGCGAGCTAGAACCAGACAAGTTCCAGAATAAAACCAACGGGATTACCCCGAGGCGCTGGC 1477
Query 1478 TCCTACTCTGCAACCCAGGACTTGCAGAGCTCATAGCAGAGAAAATTGGAGAAGACTATGTGAAAGACCTGAGC 1551
|||||||||||||||||||.||.||.||..|.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1478 TCCTACTCTGCAACCCAGGGCTGGCTGACTTGATAGCGGAGAAAATTGGAGAGGATTATGTGAAAGACCTGAGC 1551
Query 1552 CAGCTGACGAAGCTCCACAGCTTCCTGGGTGATGATGTCTTCCTCCGGGAACTCGCCAAGGTGAAGCAGGAGAA 1625
||||||||||||||||||||.||..||.|||||||..||||||||||||||.|.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1552 CAGCTGACGAAGCTCCACAGTTTTGTGAGTGATGACATCTTCCTCCGGGAAATAGCCAAAGTGAAACAGGAAAA 1625
Query 1626 TAAGCTGAAGTTTTCTCAGTTCCTGGAGACGGAGTACAAAGTGAAGATCAACCCATCCTCCATGTTTGATGTCC 1699
|||||||||.||.||.|||||||||||||.|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 TAAGCTGAAATTCTCCCAGTTCCTGGAGAAGGAATACAAGGTGAAGATCAACCCATCCTCCATGTTTGATGTCC 1699
Query 1700 AGGTGAAGAGGATACATGAGTACAAGCGACAGCTCTTGAACTGTCTGCATGTGATCACGATGTACAACCGCATT 1773
|.||||||.||||.||.|||||.||..|.|||||..|||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1700 ATGTGAAGCGGATCCACGAGTATAAAAGGCAGCTTCTGAACTGCCTGCATGTGATCACCATGTACAATCGCATC 1773
Query 1774 AAGAAAGACCCTAAGAAGTTATTCGTGCCAAGGACAGTTATCATTGGTGGTAAAGCTGCCCCAGGATATCACAT 1847
|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 AAGAAAGACCCTAAGAAATTCTTCGTGCCAAGGACAGTCATAATTGGTGGCAAAGCTGCCCCAGGATATCACAT 1847
Query 1848 GGCCAAAATGATCATAAAGCTGATCACTTCAGTGGCAGATGTGGTGAACAATGACCCTATGGTTGGAAGCAAGT 1921
|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 1848 GGCCAAAATGATCATAAAGCTGATCACCTCTGTGGCAGAAGTGGTGAACAATGACCCCATGGTCGGCAGCAAGT 1921
Query 1922 TGAAAGTCATCTTCTTGGAGAACTACAGAGTATCTCTTGCTGAAAAAGTCATTCCAGCCACAGATCTGTCAGAG 1995
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1922 TGAAAGTCATCTTCTTGGAGAACTACAGAGTGTCTCTTGCCGAAAAAGTCATTCCAGCCACAGACCTATCGGAG 1995
Query 1996 CAGATTTCCACTGCAGGCACCGAAGCCTCGGGGACAGGCAATATGAAGTTCATGCTAAATGGGGCCCTAACTAT 2069
|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct 1996 CAGATCTCCACGGCAGGCACGGAAGCCTCCGGGACAGGCAACATGAAGTTCATGCTGAACGGGGCCCTGACCAT 2069
Query 2070 CGGGACCATGGATGGGGCCAATGTGGAAATGGCAGAAGAAGCTGGGGAAGAGAACCTGTTCATCTTTGGCATGA 2143
||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 CGGGACTATGGATGGGGCCAATGTGGAGATGGCAGAGGAAGCTGGGGAGGAGAACCTGTTCATCTTTGGCATGA 2143
Query 2144 GGATAGATGATGTGGCTGCTTTGGACAAGAAAGGGTACGAGGCAAAAGAATACTATGAGGCACTTCCAGAGCTG 2217
|..||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 2144 GAGTAGATGATGTGGCTGCTTTGGATAAGAAGGGGTATGAGGCCAAAGAATATTACGAGGCCCTTCCAGAACTG 2217
Query 2218 AAGCTGGTCATTGATCAAATTGACAATGGCTTTTTTTCTCCCAAGCAGCCTGACCTCTTCAAAGATATCATCAA 2291
|||.|||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2218 AAGTTGGTCATCGACCAAATCGACAATGGCTTCTTTTCTCCCAATCAGCCAGACCTCTTCAAAGACATCATCAA 2291
Query 2292 CATGCTATTTTATCATGACAGGTTTAAAGTCTTTGCAGACTACGAAGCCTATGTCAAGTGTCAAGATAAAGTGA 2365
||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 2292 CATGTTATTTTATCATGACAGATTTAAAGTCTTTGCAGACTACGAAGCCTATGTCAAGTGTCAAGAAAAAGTCA 2365
Query 2366 GTCAGCTGTACATGAATCCAAAGGCCTGGAACACAATGGTACTCAAAAACATAGCTGCCTCGGGGAAATTCTCC 2439
||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2366 GTCAGCTGTATATGAATCAAAAAGCCTGGAACACAATGGTACTCAAAAACATAGCTGCCTCAGGGAAGTTCTCC 2439
Query 2440 AGTGACCGAACAATTAAAGAATATGCCCAAAACATCTGGAACGTGGAACCTTCAGATCTAAAGATTTCTCTATC 2513
|||||||||||||||||.||.||||||.|..|||||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 2440 AGTGACCGAACAATTAAGGAGTATGCCAAGGACATCTGGAACATGGAGCCTTCGGATCTGAAGATTTCCCTATC 2513
Query 2514 CAATGAATCTAACAA-------AGT--CAATGGAAAT 2541
|||.||.||.|.||| ||| ||||||.||.
Sbjct 2514 CAACGAGTCCAGCAATGGGGTCAGTGCCAATGGGAAG 2550