Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01376
- Subject:
- NM_001290300.1
- Aligned Length:
- 1347
- Identities:
- 1206
- Gaps:
- 135
Alignment
Query 1 ATGTTTGACTGTATGGATGTTCTGTCAGTGAGTCCTGGGCAAATCCTGGATTTCTACACTGCGAGTCCGTCTTC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTGCATGCTCCAGGAGAAAGCTCTCAAAGCATGCTTCAGTGGATTGACCCAAACCGAATGGCAGCATCGGCACA 148
||| ||.|.|| |.||.||
Sbjct 1 ------------------------------ATG-----------------AAGCTGA---GTAGAAT------- 17
Query 149 CTGC---TCAATCAATTGAAACACAGAGCACCAGCTCTGAGGAACTCGTCCCAAGCCCCCCATCTCCACTTCCT 219
||| ||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18 -TGCCTTTCCAGCAATTGAAACACAGAGCACCAGCTCTGAGGAACTCGTCCCAAGCCCCCCATCTCCACTTCCT 90
Query 220 CCCCCTCGAGTGTACAAACCCTGCTTCGTCTGCCAGGACAAATCATCAGGGTACCACTATGGGGTCAGCGCCTG 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 91 CCCCCTCGAGTGTACAAACCCTGCTTCGTCTGCCAGGACAAATCATCAGGGTACCACTATGGGGTCAGCGCCTG 164
Query 294 TGAGGGATGTAAGGGCTTTTTCCGCAGAAGTATTCAGAAGAATATGATTTACACTTGTCACCGAGATAAGAACT 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 165 TGAGGGATGTAAGGGCTTTTTCCGCAGAAGTATTCAGAAGAATATGATTTACACTTGTCACCGAGATAAGAACT 238
Query 368 GTGTTATTAATAAAGTCACCAGGAATCGATGCCAATACTGTCGACTCCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGAATGTCC 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 GTGTTATTAATAAAGTCACCAGGAATCGATGCCAATACTGTCGACTCCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGAATGTCC 312
Query 442 AAAGAATCTGTCAGGAATGACAGGAACAAGAAAAAGAAGGAGACTTCGAAGCAAGAATGCACAGAGAGCTATGA 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 313 AAAGAATCTGTCAGGAATGACAGGAACAAGAAAAAGAAGGAGACTTCGAAGCAAGAATGCACAGAGAGCTATGA 386
Query 516 AATGACAGCTGAGTTGGACGATCTCACAGAGAAGATCCGAAAAGCTCACCAGGAAACTTTCCCTTCACTCTGCC 589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 387 AATGACAGCTGAGTTGGACGATCTCACAGAGAAGATCCGAAAAGCTCACCAGGAAACTTTCCCTTCACTCTGCC 460
Query 590 AGCTGGGTAAATACACCACGAATTCCAGTGCTGACCATCGAGTCCGACTGGACCTGGGCCTCTGGGACAAATTC 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 461 AGCTGGGTAAATACACCACGAATTCCAGTGCTGACCATCGAGTCCGACTGGACCTGGGCCTCTGGGACAAATTC 534
Query 664 AGTGAACTGGCCACCAAGTGCATTATTAAGATCGTGGAGTTTGCTAAACGTCTGCCTGGTTTCACTGGCTTGAC 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 535 AGTGAACTGGCCACCAAGTGCATTATTAAGATCGTGGAGTTTGCTAAACGTCTGCCTGGTTTCACTGGCTTGAC 608
Query 738 CATCGCAGACCAAATTACCCTGCTGAAGGCCGCCTGCCTGGACATCCTGATTCTTAGAATTTGCACCAGGTATA 811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 609 CATCGCAGACCAAATTACCCTGCTGAAGGCCGCCTGCCTGGACATCCTGATTCTTAGAATTTGCACCAGGTATA 682
Query 812 CCCCAGAACAAGACACCATGACTTTCTCAGACGGCCTTACCCTAAATCGAACTCAGATGCACAATGCTGGATTT 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 683 CCCCAGAACAAGACACCATGACTTTCTCAGACGGCCTTACCCTAAATCGAACTCAGATGCACAATGCTGGATTT 756
Query 886 GGTCCTCTGACTGACCTTGTGTTCACCTTTGCCAACCAGCTCCTGCCTTTGGAAATGGATGACACAGAAACAGG 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 757 GGTCCTCTGACTGACCTTGTGTTCACCTTTGCCAACCAGCTCCTGCCTTTGGAAATGGATGACACAGAAACAGG 830
Query 960 CCTTCTCAGTGCCATCTGCTTAATCTGTGGAGACCGCCAGGACCTTGAGGAACCGACAAAAGTAGATAAGCTAC 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 831 CCTTCTCAGTGCCATCTGCTTAATCTGTGGAGACCGCCAGGACCTTGAGGAACCGACAAAAGTAGATAAGCTAC 904
Query 1034 AAGAACCATTGCTGGAAGCACTAAAAATTTATATCAGAAAAAGACGACCCAGCAAGCCTCACATGTTTCCAAAG 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 905 AAGAACCATTGCTGGAAGCACTAAAAATTTATATCAGAAAAAGACGACCCAGCAAGCCTCACATGTTTCCAAAG 978
Query 1108 ATCTTAATGAAAATCACAGATCTCCGTAGCATCAGTGCTAAAGGTGCAGAGCGTGTAATTACCTTGAAAATGGA 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 979 ATCTTAATGAAAATCACAGATCTCCGTAGCATCAGTGCTAAAGGTGCAGAGCGTGTAATTACCTTGAAAATGGA 1052
Query 1182 AATTCCTGGATCAATGCCACCTCTCATTCAAGAAATGCTGGAGAATTCTGAAGGACATGAACCCTTGACCCCAA 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1053 AATTCCTGGATCAATGCCACCTCTCATTCAAGAAATGCTGGAGAATTCTGAAGGACATGAACCCTTGACCCCAA 1126
Query 1256 GTTCAAGTGGGAACACAGCAGAGCACAGTCCTAGCATCTCACCCAGCTCAGTGGAAAACAGTGGGGTCAGTCAG 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1127 GTTCAAGTGGGAACACAGCAGAGCACAGTCCTAGCATCTCACCCAGCTCAGTGGAAAACAGTGGGGTCAGTCAG 1200
Query 1330 TCACCACTCGTGCAA 1344
|||||||||||||||
Sbjct 1201 TCACCACTCGTGCAA 1215