Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_01486
Subject:
NM_001199305.1
Aligned Length:
824
Identities:
709
Gaps:
34

Alignment

Query   1  MKSNQERSNECLPPKKREIPATSRSSEEKAPTLPSDNHRVEGTAWLPGNPGGRGHGGGRHGPAGTSVELGLQQG  74
           ||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||.|||.||||..||.|||||||||.||||.|.|| ||
Sbjct   1  MKSNQERSNECLPPKKREIPATSRPSEEKATALPSDNHCVEGVAWLPSTPGIRGHGGGRHGSAGTSGEHGL-QG  73

Query  75  IGLHKALSTGLDYSPPSAPRSVPVATTLPAAYATPQPGTPVSPVQYAHLPHTFQFIGSSQYSGTYASFIPSQLI  148
           .|||||||.||||||||||||||.|.|||..|..||.||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  74  MGLHKALSAGLDYSPPSAPRSVPTANTLPTVYPPPQSGTPVSPVQYAHLSHTFQFIGSSQYSGPYAGFIPSQLI  147

Query 149  PPTANPVTSAVASAAGATTPSQRSQLEAYSTLLANMGSLSQTPGHKAEQQQQQQQQQQQQHQHQQQQQQQQQQQ  222
           .|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|                        ..
Sbjct 148  SPSGNPVTSAVASAAGATTPSQRSQLEAYSTLLANMGSLSQAPGHKVE------------------------PP  197

Query 223  QQQHLSRAPGLITPGS-PPPAQQNQYVHISSSPQNTGRTASPPAIPVHLHPHQTMIPHTLTLGPPSQVVMQYAD  295
           .|||||||.||..||| |||.|||||.|||||||..||..|||.||||||||||||||||||||.||||.||.|
Sbjct 198  PQQHLSRAAGLVNPGSPPPPTQQNQYIHISSSPQSSGRATSPPPIPVHLHPHQTMIPHTLTLGPSSQVVVQYSD  271

Query 296  SGSHFVPREATKKAESSRLQQAIQAKEVLNGEMEKSRRYGAPSSADLGLGKAGGKSVPHPYESRHVVVHPSPSD  369
           .|.||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||.||..|.||||..||||||||||||||||||.|
Sbjct 272  AGGHFVPRESTKKAESSRLQQAMQAKEVLNGEMEKSRRYGASSSVELSLGKASSKSVPHPYESRHVVVHPSPAD  345

Query 370  YSSRDPSGVRASVMVLPNSNTPAADLEVQQATHREASPSTLNDKSGLHLGKPGHRSYALSPHTVIQTTHSASEP  443
           |||||.||||.||||||||.||.||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 346  YSSRDTSGVRGSVMVLPNSSTPSADLEAQQTTHREASPSTLNDKSGLHLGKPGHRSYALSPHTVIQTTHSASEP  419

Query 444  LPVGLPATAFYAGTQPPVIGYLSGQQQAITYAGSLPQHLVIPGTQPLLIPVGSTDMEASGAAPAIVTSSPQFAA  517
           |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||.||...|||.|||||||||||
Sbjct 420  LPVGLPATAFYAGTQPPVIGYLSGQQQAITYAGGLPQHLVIPGNQPLLIPVGSPDMDTPGAASAIVTSSPQFAA  493

Query 518  VPHTFVTTALPKSENFNPEALVTQAAYPAMVQAQIHLPVVQSVASPAAAPPTLPPYFMKGSIIQLANGELKKVE  591
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494  VPHTFVTTALPKSENFNPEALVTQAAYPAMVQAQIHLPVVQSVASPTTASPTLPPYFMKGSIIQLANGELKKVE  567

Query 592  DLKTEDFIQSAEISNDLKIDSSTVERIEDSHSPGVAVIQFAVGEHRA--------QVSVEVLVEYPFFVFGQGW  657
           ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||
Sbjct 568  DLKTEDFIQSAEISNDLKIDSSTVERIEESHSPGVAVIQFAVGEHRAQVTLTRVIQVSVEVLVEYPFFVFGQGW  641

Query 658  SSCCPERTSQLFDLPCSKLSVGDVCISLTLKNLKNGSVKKGQPVDPASVLLKHSKADGLAGSRHRYAEQENGIN  731
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|.||||||||||||||||
Sbjct 642  SSCCPERTSQLFDLPCSKLSVGDVCISLTLKNLKNGSVKKGQPVDPASVLLKQAKTDSLAGSRHRYAEQENGIN  715

Query 732  QGSAQMLSENGELKFPEKMGLPAAPFLTKIEPSKPAATRKRRWSAPESRKLEKSEDEPPLTLPKPSLIPQEVKI  805
           |||||.||||||||||||.||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 716  QGSAQVLSENGELKFPEKIGLPAAPFLSKIEPSKPTATRKRRWSAPETRKLEKSEDEPPLTLPKPSLIPQEVKI  789

Query 806  CIEGRSNVGK  815
           ||||||||||
Sbjct 790  CIEGRSNVGK  799