Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01568
• Subject: NM_013670.4
• Aligned Length: 720
• Identities: 558
• Gaps: 27

Alignment

Query   1  ATGACGGTGGGCAAGAGCAGCAAGATGCTGCAGCATATTGATTACAGGATGAGGTGCATCCTGCAGGACGGCCG  74
           |||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||..|
Sbjct   1  ATGACTGTGGGTAAGAGTAGCAAGATGCTGCAGCACATTGACTATAGGATGAGATGTATCCTGCAAGATGGGAG  74

Query  75  GATCTTCATTGGCACCTTCAAGGCTTTTGACAAGCACATGAATTTGATCCTCTGTGACTGTGATGAGTTCAGAA  148
           .|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  75  AATCTTCATTGGCACCTTCAAGGCTTTTGACAAGCATATGAATTTGATCCTCTGTGATTGTGATGAGTTCAGGA  148

Query 149  AGATCAAGCCAAAGAACTCCAAACAAGCAGAAAGGGAAGAGAAGCGAGTCCTCGGTCTGGTGCTGCTGCGAGGG  222
           ||||||||||||||||..|.|||||..|||||.|.|||||.||.||.||..|.||||||||..||||.||.|||
Sbjct 149  AGATCAAGCCAAAGAATGCAAAACAGCCAGAACGTGAAGAAAAACGGGTTTTGGGTCTGGTCTTGCTACGTGGG  222

Query 223  GAGAATCTGGTCTCAATGACAGTAGAGGGACCTCCTCCCAAAGATACTGGTATTGCTCGAGTTCCACTTGCTGG  296
           |||||..||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 223  GAGAACTTGGTTTCAATGACTGTGGAGGGCCCACCTCCTAAAGATACTGGCATTGCTCGTGTGCCTCTTGCTGG  296

Query 297  AGCTGCCGGGGGCCCAGGGATCGGCAGGGCTGCTGGCAGAGGAATCCCAGCTGGGGTTCCCATGCCCCAGGCTC  370
           .|||||.||.|||||.|||.|.||.||.||.||||||||||||.|.|||||.||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 297  CGCTGCAGGTGGCCCTGGGGTTGGAAGAGCAGCTGGCAGAGGAGTGCCAGCAGGTGTACCTATTCCCCAGGCTC  370

Query 371  CTGCAGGACTTGCTGGGCCAGTCCGTGGGGTTGGCGGGCCATCCCAACAGGTGATGACCCCACAAGGAAGAGGT  444
           ||||.|||.|.||.||.||.|||.|.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 371  CTGCTGGATTAGCAGGCCCTGTCAGAGGAGTTGGAGGCCCATCCCAGCAGGTCATGACCCCACAGGGAAGAGGC  444

Query 445  ACTGTTGCAGCCGCTGCAGCTGCTGCCACAGCCAGTATTGCCGGGGCTCCAACCCAGTACCCACCTGGCCGTGG  518
           |||||||||||.|||||.|.||||||.||.||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 445  ACTGTTGCAGCTGCTGCTGTTGCTGCTACTGCTAGCATTGCAGGAGCCCCAACCCAGTACCCGCCAGGACGGGG  518

Query 519  GGGTCCTCCCCCACCTATGGGCCGAGGAGCACCCCCTCCAGGCATGATGGGCCCACCTCCTGGTATGAGACCTC  592
           ...|||.||.||||||.|.|||.|||.|.|.||.|||||||||||.||||..||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 519  AACTCCACCTCCACCTGTAGGCAGAGCAACCCCACCTCCAGGCATTATGGCTCCTCCACCTGGTATGAGACCAC  592

Query 593  CTATGGGTCCCCCAATGGGGATCCCCCCTGGAAGAGGGACTCCAATGGGCATGCCCCCTCCGGGAATGCGGCCT  666
           |.|||||.||.||.||.|||.|.|||||||...|.|||||.||.||.||||||||.|||||.||||||.|.||.
Sbjct 593  CCATGGGCCCACCCATTGGGCTTCCCCCTGCTCGTGGGACACCTATAGGCATGCCTCCTCCAGGAATGAGACCC  666

Query 667  CCTCCCCCTGGGATGCGAGGCCTTCTT---------------------------  693
           |||||.||.||.||..||||||..|.|                           
Sbjct 667  CCTCCACCAGGAATTAGAGGCCCACCTCCCCCAGGAATGCGCCCACCAAGACCC  720