Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_01575
Subject:
NM_003091.4
Aligned Length:
720
Identities:
566
Gaps:
27

Alignment

Query   1  ATGACTGTTGGCAAGAGTAGCAAGATGCTGCAGCACATTGACTATAGAATGAGATGTATCCTGCAAGATGGCCG  74
           |||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct   1  ATGACGGTGGGCAAGAGCAGCAAGATGCTGCAGCATATTGATTACAGGATGAGGTGCATCCTGCAGGACGGCCG  74

Query  75  AATCTTCATTGGCACCTTTAAGGCTTTTGACAAGCATATGAATTTGATCCTCTGTGATTGTGATGAGTTCAGAA  148
           .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  75  GATCTTCATTGGCACCTTCAAGGCTTTTGACAAGCACATGAATTTGATCCTCTGTGACTGTGATGAGTTCAGAA  148

Query 149  AGATCAAGCCAAAGAATGCGAAGCAACCAGAGCGTGAAGAAAAGCGGGTTTTGGGTCTGGTGTTGCTGCGTGGG  222
           ||||||||||||||||..|.||.|||.||||..|.|||||.|||||.||..|.|||||||||.|||||||.|||
Sbjct 149  AGATCAAGCCAAAGAACTCCAAACAAGCAGAAAGGGAAGAGAAGCGAGTCCTCGGTCTGGTGCTGCTGCGAGGG  222

Query 223  GAGAACTTGGTATCCATGACTGTGGAGGGGCCACCCCCCAAAGATACTGGCATTGCTCGGGTACCACTTGCTGG  296
           |||||..||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 223  GAGAATCTGGTCTCAATGACAGTAGAGGGACCTCCTCCCAAAGATACTGGTATTGCTCGAGTTCCACTTGCTGG  296

Query 297  AGCTGCTGGAGGCCCTGGGGTTGGTAGGGCAGCTGGTAGAGGAGTACCAGCTGGTGTGCCAATTCCCCAGGCCC  370
           ||||||.||.|||||.|||.|.||.|||||.|||||.||||||.|.||||||||.||.||.||.||||||||.|
Sbjct 297  AGCTGCCGGGGGCCCAGGGATCGGCAGGGCTGCTGGCAGAGGAATCCCAGCTGGGGTTCCCATGCCCCAGGCTC  370

Query 371  CTGCTGGATTGGCAGGCCCTGTCCGAGGAGTTGGGGGACCATCCCAGCAGGTAATGACTCCACAGGGAAGAGGC  444
           ||||.|||.|.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct 371  CTGCAGGACTTGCTGGGCCAGTCCGTGGGGTTGGCGGGCCATCCCAACAGGTGATGACCCCACAAGGAAGAGGT  444

Query 445  ACTGTAGCAGCTGCTGCTGTTGCTGCGACTGCCAGTATTGCTGGAGCCCCAACACAGTACCCACCAGGACGGGG  518
           |||||.|||||.|||||.|.||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 445  ACTGTTGCAGCCGCTGCAGCTGCTGCCACAGCCAGTATTGCCGGGGCTCCAACCCAGTACCCACCTGGCCGTGG  518

Query 519  CACTCCGCCCCCACCCGTCGGCAGAGCAACCCCACCTCCAGGCATTATGGCTCCTCCACCTGGTATGAGACCAC  592
           ...|||.||||||||..|.|||.|||.|.|.||.|||||||||||.||||..||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 519  GGGTCCTCCCCCACCTATGGGCCGAGGAGCACCCCCTCCAGGCATGATGGGCCCACCTCCTGGTATGAGACCTC  592

Query 593  CCATGGGCCCACCAATTGGGCTTCCCCCTGCTCGAGGGACGCCAATAGGCATGCCGCCTCCGGGAATGAGACCC  666
           |.|||||.||.|||||.|||.|.|||||||...|||||||.|||||.||||||||.||||||||||||.|.||.
Sbjct 593  CTATGGGTCCCCCAATGGGGATCCCCCCTGGAAGAGGGACTCCAATGGGCATGCCCCCTCCGGGAATGCGGCCT  666

Query 667  CCTCCACCAGGCATTAGAGGTCCACCTCCCCCAGGAATGCGTCCACCAAGACCT  720
           |||||.||.||.||..||||.|..|.|                           
Sbjct 667  CCTCCCCCTGGGATGCGAGGCCTTCTT---------------------------  693