Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01621
• Subject: XM_017023604.1
• Aligned Length: 903
• Identities: 836
• Gaps: 18

Alignment

Query   1  ATGGAGCTGATCCAGGACACCTCCCGCCCGCCACTGGAGTACGTGAAGGGGGTCCCGCTCATCAAGTACTTTGC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGAGCTGATCCAGGACACCTCCCGCCCGCCACTGGAGTACGTGAAGGGGGTCCCGCTCATCAAGTACTTTGC  74

Query  75  AGAGGCACTGGGGCCCCTGCAGAGCTTCCAAGCCCGACCTGATGACCTGCTCATCAACACCTACCCCAAGTCTG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct  75  AGAGGCACTGGGGCCCCTGCAGAGCTTCCAGGCCCGGCCTGATGACCTGCTCATCAGCACCTACCCCAAGTCCG  148

Query 149  GCACCACCTGGGTGAGCCAGATACTGGACATGATCTACCAGGGCGGCGACCTAGAGAAGTGTAACCGGGCTCCC  222
           ||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.||||.||||||
Sbjct 149  GCACTACCTGGGTAAGCCAGATTCTGGACATGATCTACCAGGGTGGTGACCTGGAGAAGTGTCACCGAGCTCCC  222

Query 223  ATCTACGTACGGGTGCCCTTCCTTGAGGTCAATGATCCAGGGGAACCCTCAGGGCTGGAGACTCTGAAAGACAC  296
           ||||.|.|.||||||||||||||||||.||||.|..||||||...|||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 223  ATCTTCATGCGGGTGCCCTTCCTTGAGTTCAAAGCCCCAGGGATTCCCTCAGGGATGGAGACTCTGAAAGACAC  296

Query 297  ACCGCCCCCACGGCTCATCAAGTCACACCTGCCCCTGGCTCTGCTCCCTCAGACTCTGTTGGATCAGAAGGTCA  370
           ||||.|||||||.|||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  ACCGGCCCCACGACTCCTGAAGACACACCTGCCCCTGGCTCTGCTCCCCCAGACTCTGTTGGATCAGAAGGTCA  370

Query 371  AGGTGGTCTATGTTGCCCGAAACCCAAAGGACGTGGCGGTCTCCTACTACCATTTCCACCGTATGGAAAAGGCG  444
           |||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.|||.|||..||||..||||.|
Sbjct 371  AGGTGGTCTATGTTGCCCGCAACGCAAAGGATGTGGCAGTTTCCTACTACCACTTCTACCACATGGCCAAGGTG  444

Query 445  CACCCTGAGCCTGGGACCTGGGACAGCTTCCTGGAAAAGTTCATGGCTGGAGAAGTGTCCTACGGGTCCTGGTA  518
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445  CACCCTGAGCCTGGGACCTGGGACAGCTTCCTGGAGAAGTTCATGGTCGGAGAAGTGTCCTACGGATCCTGGTA  518

Query 519  CCAGCACGTGCAGGAGTGGTGGGAGCTGAGCCGCACCCACCCTGTTCTCTACCTCTTCTATGAAGACATGAAGG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CCAGCACGTGCAGGAGTGGTGGGAGCTGAGCCGCACCCACCCTGTTCTCTACCTCTTCTATGAAGACATGAAGG  592

Query 593  ------------------AGAACCCCAAAAGGGAGATTCAAAAGATCCTGGAGTTTGTGGGGCGCTCCCTGCCA  648
                             |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  AGGGGCCCTCTGCTGCTCAGAACCCGAAAAGGGAGATTCAAAAGATCCTGGAGTTTGTGGGGCGCTCCCTGCCA  666

Query 649  GAGGAGACCATGGACTTCATGGTTCAGCACACGTCGTTCAAGGAGATGAAGAAGAACCCTATGACCAACTACAC  722
           |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GAGGAGACCGTGGACTTCGTGGTTCAGCACACGTCGTTCAAGGAGATGAAGAAGAACCCTATGACCAACTACAC  740

Query 723  CACCGTCCCCCAGGAGCTCATGGACCACAGCATCTCCCCCTTCATGAGGAAAGGCATGGCTGGGGACTGGAAGA  796
           ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  CACCGTCCCCCAGGAGTTCATGGACCACAGCATCTCCCCCTTCATGAGGAAAGGCATGGCTGGGGACTGGAAGA  814

Query 797  CCACCTTCACCGTGGCGCAGAATGAGCGCTTCGATGCGGACTATGCGGAGAAGATGGCAGGCTGCAGCCTCAGC  870
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  CCACCTTCACCGTGGCGCAGAATGAGCGCTTCGATGCGGACTATGCGGAGAAGATGGCAGGCTGCAGCCTCAGC  888

Query 871  TTCCGCTCTGAGCTG  885
           |||||||||||||||
Sbjct 889  TTCCGCTCTGAGCTG  903