Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01719
- Subject:
- NM_201357.2
- Aligned Length:
- 1162
- Identities:
- 1011
- Gaps:
- 5
Alignment
Query 1 ATGGAGGACGATGCACCAGTGATCTACGGGCTGGAGTTCCAGGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAAC 74
|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGGAAGACGACGCCCCGGTGATTTACGGGCTGGAATTCCAGGCACGTGCTCTAACACCTCAAACTGCGGAAAC 74
Query 75 AGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCTTAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACG 148
||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 75 AGATGCCATTCGCTTCTTGGTTGGGACGCAGTCTCTTAAATATGATAATCAGATCCACATCATAGACTTTGATG 148
Query 149 ATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCT 222
|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.
Sbjct 149 ACGAAAATAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAGATCTGGCACATCAGTGCCAGCCCG 222
Query 223 GCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGAACTTCAGACAGCAAAGTCCTGACATGTGCAGCCGTGTG 296
|||||.|.||||||||||.|.|||||||||||||.||||.|||||||...|||||.|.|.||||||||.|||||
Sbjct 223 GCAGATAAAGGTGTGCTGGCCACCTGCTACAACAAAACTACAGACAGTCGAGTCCAGGCGTGTGCAGCTGTGTG 296
Query 297 GAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGAGTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAGACCCTGG 370
|||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||..|..|.||||||||.||||||||||
Sbjct 297 GAGGATGCCCAAGGAATTAGAATCCGGTAGCCACGAGTCCCCTGACGACCCTGCAAGCACTGCTCAGACCCTGG 370
Query 371 AGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCAACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGGAGATGGG 444
|||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 371 AGCTGCTCTGTCACCTTGACAACTCGGCCCAAGGCAACGTGGCCTGTGTCGTGTGGGAACCGATGGGGGATGGG 444
Query 445 AAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTGCTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGGCTGTGCT 518
|||||..||||||||.||||.||||.|||.||||||||||||||..|.|||...||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGAAGGTCATTTCCCTGGCCGATAGCCACATCCTGCTGTGGGACCTCCAGCCCAGCTCGAGCCAGGCTGTGCT 518
Query 519 GGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGACAACTGAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACT 592
||||||||||||..|.||||||||.|.||||||.||||||||||||.|.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 519 GGCCAGCTCAGCAACACTGGAAGGAAGGGGACAGCTGAAGTTCACCGCGGGGCGGTGGAGCCCACACCACAACT 592
Query 593 GCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACCACCCTCCGTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGC 666
|.|||||||||||||||||.|..|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 593 GTACCCAGGTGGCCACAGCAAGTGACACGACCCTCCGAGGATGGGACACACGGAGCATGAGCCAGATATACTGC 666
Query 667 ATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCGGGACCTTGACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTG 740
||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||.|.||||||||
Sbjct 667 ATAGAGAACGCTCATGGGCAGCTGGTGCGTGACCTAGACTTCAACCCCAACAAGCAGTATTACCTCGCCAGCTG 740
Query 741 CGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGGACACCCGAAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACT 814
.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGAGATGACTGCAAGGTGAAGTTCTGGGACACACGGAATGTCACCGAGCCTGTGAAGACCCTGGAGGAGCACT 814
Query 815 CCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAACCACTCTCATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGA 888
|||||||||||||||..||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 815 CCCACTGGGTGTGGAGTGTGCGCTACAACCACTCTCACGACCAGCTGGTCCTCACTGGCAGCAGCGACAGCAGA 888
Query 889 GTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTCGTCGGAGCCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGA 962
||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||.||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 889 GTCATCCTGTCCAACATGGTATCTATCTCCTCAGAGCCCTTTGGTCACCTGGTGGACGACGGTGACATCAGTGA 962
Query 963 -CCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGAGCAAGGAGCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAG 1035
||| ||.||.||||.|.||||| |||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 963 TCCA-GAAGAGCACCATGCTGAA---AAGAGCAAGGAACCCCTGCAGGACAACGTTATTGCCACCTATGAGGAG 1032
Query 1036 CACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGGTCCTCGGCTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGG 1109
||.|||||||||||.|||||.|||||||||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 1033 CATGAGGACAGCGTGTATGCAGTGGACTGGGCCTCAGCTGACCCATGGCTGTTTGCTTCCCTAAGTTACGACGG 1106
Query 1110 GAGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGCCCTGAAGTACCACATCCTGCTA 1161
|||.||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1107 GAGACTGGTTATCAACAGAGTTCCCAGGGCACTGAAGTACCACATACTGCTC 1158