Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01719
• Subject: XM_006515121.3
• Aligned Length: 1283
• Identities: 857
• Gaps: 298

Alignment

Query    1  ATGGAGGACGATGCACCAGTGATCTACGGGCTGGAGTTCCAGGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCTTAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCT  222
                                    |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.
Sbjct    1  ------------------------ATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAGATCTGGCACATCAGTGCCAGCCCG  50

Query  223  GCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGAA-------------------------CTTCAGACAGCA  271
            |||||.|.||||||||||.|.|||||||||||||.||                         ||||.|.|||||
Sbjct   51  GCAGATAAAGGTGTGCTGGCCACCTGCTACAACAAAAGAAAGCATGAAGCAGCTGGTCTCAGCTTCTGCCAGCA  124

Query  272  A---------------------------------------------------------AGTCCTGACATGTGCA  288
            |                                                         |||||.|.|.||||||
Sbjct  125  AGTGTGGGTGCTGTGGAGGCTGCAGCATGCCTTCACTCAATCAAGCTACAGACAGTCGAGTCCAGGCGTGTGCA  198

Query  289  GCCGTGTGGAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGAGTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACA  362
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||..|..|.||||||||.||
Sbjct  199  GCTGTGTGGAGGATGCCCAAGGAATTAGAATCCGGTAGCCACGAGTCCCCTGACGACCCTGCAAGCACTGCTCA  272

Query  363  GACCCTGGAGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCAACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGG  436
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  273  GACCCTGGAGCTGCTCTGTCACCTTGACAACTCGGCCCAAGGCAACGTGGCCTGTGTCGTGTGGGAACCGATGG  346

Query  437  GAGATGGGAAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTGCTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAG  510
            |.|||||||||||..||||||||.||||.||||.|||.||||||||||||||..|.|||...||||||||||||
Sbjct  347  GGGATGGGAAGAAGGTCATTTCCCTGGCCGATAGCCACATCCTGCTGTGGGACCTCCAGCCCAGCTCGAGCCAG  420

Query  511  GCTGT---------------------------------------GCTGGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAA  545
            |||||                                       |||||||||||||||..|.||||||||.|.
Sbjct  421  GCTGTGATCTTTCTTCTCTCCTTTGAACAATACCCGTTCTACCAGCTGGCCAGCTCAGCAACACTGGAAGGAAG  494

Query  546  GGGACAACTGAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACTGCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACA  619
            ||||||.||||||||||||.|.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|..||||
Sbjct  495  GGGACAGCTGAAGTTCACCGCGGGGCGGTGGAGCCCACACCACAACTGTACCCAGGTGGCCACAGCAAGTGACA  568

Query  620  CCACCCTCCGTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGCATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTG  693
            |.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct  569  CGACCCTCCGAGGATGGGACACACGGAGCATGAGCCAGATATACTGCATAGAGAACGCTCATGGGCAGCTGGTG  642

Query  694  CGGGACCTTGACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTGCGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTG  767
            ||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||.|.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  643  CGTGACCTAGACTTCAACCCCAACAAGCAGTATTACCTCGCCAGCTGTGGAGATGACTGCAAGGTGAAGTTCTG  716

Query  768  GGACACCCGAAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACTCCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACA  841
            ||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.|||||||
Sbjct  717  GGACACACGGAATGTCACCGAGCCTGTGAAGACCCTGGAGGAGCACTCCCACTGGGTGTGGAGTGTGCGCTACA  790

Query  842  ACCACTCTCATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGAGTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATC  915
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  791  ACCACTCTCACGACCAGCTGGTCCTCACTGGCAGCAGCGACAGCAGAGTCATCCTGTCCAACATGGTATCTATC  864

Query  916  TCGTCGGAGCCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGA-CCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGA  988
            ||.||.||||||||.||.|||.||||.|||||||.|||||||||||| ||| ||.||.||||.|.|||||   |
Sbjct  865  TCCTCAGAGCCCTTTGGTCACCTGGTGGACGACGGTGACATCAGTGATCCA-GAAGAGCACCATGCTGAA---A  934

Query  989  AGAGCAAGGAGCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAGCACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGAC  1062
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  935  AGAGCAAGGAACCCCTGCAGGACAACGTTATTGCCACCTATGAGGAGCATGAGGACAGCGTGTATGCAGTGGAC  1008

Query 1063  TGGTCCTCGGCTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGGGAGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAG  1136
            |||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1009  TGGGCCTCAGCTGACCCATGGCTGTTTGCTTCCCTAAGTTACGACGGGAGACTGGTTATCAACAGAGTTCCCAG  1082

Query 1137  GGCCCTGAAGTACCACATCCTGCTA  1161
            |||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1083  GGCACTGAAGTACCACATACTGCTC  1107