Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01719
• Subject: XM_011243879.2
• Aligned Length: 1201
• Identities: 746
• Gaps: 344

Alignment

Query    1  ATGGAGGACGATGCACCAGTGATCTACGGGCTGGAGTTCCAGGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCTTAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGAACTTCAGACAGCAAAGTCCTGACATGTGCAGCCGTGTG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGAGTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAGACCCTGG  370
                |||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||..|..|.||||||||.||||||||||
Sbjct    1  ----ATGCCCAAGGAATTAGAATCCGGTAGCCACGAGTCCCCTGACGACCCTGCAAGCACTGCTCAGACCCTGG  70

Query  371  AGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCAACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGGAGATGGG  444
            |||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct   71  AGCTGCTCTGTCACCTTGACAACTCGGCCCAAGGCAACGTGGCCTGTGTCGTGTGGGAACCGATGGGGGATGGG  144

Query  445  AAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTGCTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGGCTGT---  515
            |||||..||||||||.||||.||||.|||.||||||||||||||..|.|||...|||||||||||||||||   
Sbjct  145  AAGAAGGTCATTTCCCTGGCCGATAGCCACATCCTGCTGTGGGACCTCCAGCCCAGCTCGAGCCAGGCTGTGAT  218

Query  516  ------------------------------------GCTGGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGACAAC  553
                                                |||||||||||||||..|.||||||||.|.||||||.|
Sbjct  219  CTTTCTTCTCTCCTTTGAACAATACCCGTTCTACCAGCTGGCCAGCTCAGCAACACTGGAAGGAAGGGGACAGC  292

Query  554  TGAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACTGCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACCACCCTC  627
            |||||||||||.|.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|..|||||.||||||
Sbjct  293  TGAAGTTCACCGCGGGGCGGTGGAGCCCACACCACAACTGTACCCAGGTGGCCACAGCAAGTGACACGACCCTC  366

Query  628  CGTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGCATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCGGGACCT  701
            ||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct  367  CGAGGATGGGACACACGGAGCATGAGCCAGATATACTGCATAGAGAACGCTCATGGGCAGCTGGTGCGTGACCT  440

Query  702  TGACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTGCGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGGACACCC  775
            .|||||.||.|||||.||||||||.|||.|.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  441  AGACTTCAACCCCAACAAGCAGTATTACCTCGCCAGCTGTGGAGATGACTGCAAGGTGAAGTTCTGGGACACAC  514

Query  776  GAAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACTCCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAACCACTCT  849
            |.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||
Sbjct  515  GGAATGTCACCGAGCCTGTGAAGACCCTGGAGGAGCACTCCCACTGGGTGTGGAGTGTGCGCTACAACCACTCT  588

Query  850  CATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGAGTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTCGTCGGA  923
            ||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct  589  CACGACCAGCTGGTCCTCACTGGCAGCAGCGACAGCAGAGTCATCCTGTCCAACATGGTATCTATCTCCTCAGA  662

Query  924  GCCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGA-CCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGAGCAAG  996
            ||||||.||.|||.||||.|||||||.|||||||||||| ||| ||.||.||||.|.|||||   |||||||||
Sbjct  663  GCCCTTTGGTCACCTGGTGGACGACGGTGACATCAGTGATCCA-GAAGAGCACCATGCTGAA---AAGAGCAAG  732

Query  997  GAGCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAGCACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGGTCCTC  1070
            ||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.||||
Sbjct  733  GAACCCCTGCAGGACAACGTTATTGCCACCTATGAGGAGCATGAGGACAGCGTGTATGCAGTGGACTGGGCCTC  806

Query 1071  GGCTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGGGAGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGCCCTGA  1144
            .||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct  807  AGCTGACCCATGGCTGTTTGCTTCCCTAAGTTACGACGGGAGACTGGTTATCAACAGAGTTCCCAGGGCACTGA  880

Query 1145  AGTACCACATCCTGCTA  1161
            ||||||||||.|||||.
Sbjct  881  AGTACCACATACTGCTC  897