Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_01789
Subject:
NM_001178030.1
Aligned Length:
677
Identities:
540
Gaps:
133

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MATGANATPLGKLGPPGLPPLPGPKGGFEPGPPPAPGPGAGLLAPGPPPPPPVGSMGALTAAFPFAALPPPPPP  74

Query   1  -------------------------------------------------------MATGANATPLDFPSKKRKR  19
                                                                  .|.|..    |||||||||
Sbjct  75  PPPPPPQQPPPPPPPPSPGASYPPPQPPPPPPLYQRVSPPQPPPPQPPRKDQQPGPAGGGG----DFPSKKRKR  144

Query  20  SRWNQDTMEQKTVIPGMPTVIPPGLTREQERAYIVQLQIEDLTRKLRTGDLGIPPNPEDRSPSPEPIYNSEGKR  93
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 145  SRWNQDTMEQKTVIPGMPTVIPPGLTREQERAYIVQLQIEDLTRKLRTGDLGIPPNPEDRSPSPEPIYNSEGKR  218

Query  94  LNTREFRTRKKLEEERHNLITEMVALNPDFKPPADYKPPATRVSDKVMIPQDEYPEINFVGLLIGPRGNTLKNI  167
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 219  LNTREFRTRKKLEEERHNLITEMVALNPDFKPPADYKPPATRVSDKVMIPQDEYPEINFVGLLIGPRGNTLKNI  292

Query 168  EKECNAKIMIRGKGSVKEGKVGRKDGQMLPGEDEPLHALVTANTMENVKKAVEQIRNILKQGIETPEDQNDLRK  241
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 293  EKECNAKIMIRGKGSVKEGKVGRKDGQMLPGEDEPLHALVTANTMENVKKAVEQIRNILKQGIETPEDQNDLRK  366

Query 242  MQLRELARLNGTLREDDNRILRPWQSSETRSITNTTVCTKCGGAGHIASDCKFQRPGDPQSAQDKARMDKEYLS  315
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367  MQLRELARLNGTLREDDNRILRPWQSSETRSITNTTVCTKCGGAGHIASDCKFQRPGDPQSAQDKARMDKEYLS  440

Query 316  LMAELGEAPVPASVGSTSGPATTPLASAPRPAAPANNPPPPSLMSTTQSRPPWMNSGPSESRPYHGMHGGGPGG  389
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441  LMAELGEAPVPASVGSTSGPATTPLASAPRPAAPANNPPPPSLMSTTQSRPPWMNSGPSESRPYHGMHGGGPGG  514

Query 390  PGGGPHSFPHPLPSLTGGHGGHPMQHNPNGPPPPWMQPPPPPMNQGPHPPGHHGPPPMDQYLGSTPVGSGVYRL  463
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 515  PGGGPHSFPHPLPSLTGGHGGHPMQHNPNGPPPPWMQPPPPPMNQGPHPPGHHGPPPMDQYLGSTPVGSGVYRL  588

Query 464  HQGKGMMPPPPMGMMPPPPPPPSGQPPPPPSGPLPPWQQQQQQPPPPPPPSSSMASSTPLPWQQRSLPAAAMAR  537
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589  HQGKGMMPPPPMGMMPPPPPPPSGQPPPPPSGPLPPWQQQQQQPPPPPPPSSSMASSTPLPWQQRSLPAAAMAR  662

Query 538  AMRVRTFRAHW  548
           |||||||||||
Sbjct 663  AMRVRTFRAHW  673