Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_01789
Subject:
NM_001178031.3
Aligned Length:
643
Identities:
503
Gaps:
125

Alignment

Query   1  MATGANATPLDFPSKKRKRSRWNQDTMEQKTVIPGMPTVIPPGLTREQERAYIVQLQIEDLTRKLRTGDLGIPP  74
                                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  --------------------------MEQKTVIPGMPTVIPPGLTREQERAYIVQLQIEDLTRKLRTGDLGIPP  48

Query  75  NPEDRSPSPEPIYNSEGKRLNTREFRTRKKLEEERHNLITEMVALNPDFKPPADYKPPATRVSDKVMIPQDEYP  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  49  NPEDRSPSPEPIYNSEGKRLNTREFRTRKKLEEERHNLITEMVALNPDFKPPADYKPPATRVSDKVMIPQDEYP  122

Query 149  EINFVGLLIGPRGNTLKNIEKECNAKIMIRGKGSVKEGKVGRKDGQMLPGEDEPLHALVTANTMENVKKAVEQI  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 123  EINFVGLLIGPRGNTLKNIEKECNAKIMIRGKGSVKEGKVGRKDGQMLPGEDEPLHALVTANTMENVKKAVEQI  196

Query 223  RNILKQGIETPEDQNDLRKMQLRELARLNGTLREDDNRILRPWQSSETRSITNTTVCTKCGGAGHIASDCKFQR  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197  RNILKQGIETPEDQNDLRKMQLRELARLNGTLREDDNRILRPWQSSETRSITNTTVCTKCGGAGHIASDCKFQR  270

Query 297  PGDPQSAQDKARMDKEYLSLMAELGEAPVPASVGSTSGPATTPLASAPRPAAPANNPPPPSLMSTTQSRPPWMN  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 271  PGDPQSAQDKARMDKEYLSLMAELGEAPVPASVGSTSGPATTPLASAPRPAAPANNPPPPSLMSTTQSRPPWMN  344

Query 371  SGPSESRPYHGMHGGGPGGPGGGPHSFPHPLPSLTGGHGGHPMQHNPNGPPPPWMQPPPPPMNQGPHPPGHHGP  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 345  SGPSESRPYHGMHGGGPGGPGGGPHSFPHPLPSLTGGHGGHPMQHNPNGPPPPWMQPPPPPMNQGPHPPGHHGP  418

Query 445  PPMDQYLGSTPVGSGVYRLHQGKGMMPPPPMGMMPPPPPPPSGQPPPPPSGPLPPWQQQQQQPPPPPPPSSSMA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419  PPMDQYLGSTPVGSGVYRLHQGKGMMPPPPMGMMPPPPPPPSGQPPPPPSGPLPPWQQQQQQPPPPPPPSSSMA  492

Query 519  SSTPLPWQQRSLPAAAMARAMRVRTFRAHW--------------------------------------------  548
           |||||||||........|.....    ..|                                            
Sbjct 493  SSTPLPWQQNTTTTTTSAGTGSI----PPWQQQQAAAAASPGAPQMQGNPTMVPLPPGVQPPLPPGAPPPPPPP  562

Query 549  ---------------------------------------------------  548
                                                              
Sbjct 563  PPGSAGMMYAPPPPPPPPMDPSNFVTMMGMGVAGMPPFGMPPAPPPPPPQN  613