Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01789
• Subject: XM_006531736.1
• Aligned Length: 1928
• Identities: 1370
• Gaps: 433

Alignment

Query    1  ATGGCGACCGGAGCGAACGCCACGCCGTTGGACTTCCCAAGTAAGAAGCGGAAGAGGAGCCGCTGGAACCAAGA  74
                                                                          .|||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------ATGGAACCAAGA  12

Query   75  CACAATGGAACAGAAGACAGTGATTCCAGGAATGCCTACAGTTATTCCCCCTGGACTTACTCGAGAACAAGAAA  148
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct   13  CACAATGGAGCAGAAGACAGTGATTCCAGGCATGCCTACAGTTATACCCCCTGGACTGACTCGGGAACAGGAAA  86

Query  149  GAGCTTATATAGTGCAACTGCAGATAGAAGACCTGACTCGTAAACTGCGCACAGGAGACCTGGGCATCCCCCCT  222
            |||||||.||                                                                
Sbjct   87  GAGCTTACAT----------------------------------------------------------------  96

Query  223  AACCCTGAGGACAGGTCCCCTTCCCCTGAGCCCATCTACAATAGCGAGGGGAAGCGGCTTAACACCCGAGAGTT  296
                        |||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct   97  ------------AGGTCCCCTTCCCCTGAACCAATCTACAACAGCGAGGGGAAGCGGCTTAACACTCGAGAGTT  158

Query  297  CCGCACCCGCAAAAAGCTGGAAGAGGAGCGGCACAACCTCATCACAGAGATGGTTGCACTCAATCCGGATTTCA  370
            |||.||||||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  159  CCGTACCCGCAAAAAGCTTGAAGAGGAGCGGCACACCCTTATTACAGAGATGGTTGCTCTCAACCCAGACTTTA  232

Query  371  AGCCACCTGCAGATTACAAACCTCCAGCAACACGTGTGAGTGATAAAGTCATGATTCCACAAGATGAGTACCCA  444
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||
Sbjct  233  AACCACCTGCAGATTACAAGCCTCCAGCAACACGTGTGAGCGATAAAGTAATGATCCCCCAAGACGAATATCCA  306

Query  445  GAAATCAACTTTGTGGGGCTGCTCATCGGGCCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACATAGAGAAGGAGTGCAATGC  518
            ||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  307  GAAATCAATTTTGTGGGGCTCCTAATTGGACCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACATTGAGAAGGAATGCAACGC  380

Query  519  CAAGATTATGATCCGGGGGAAAGGGTCTGTGAAAGAAGGGAAGGTTGGGCGCAAAGATGGCCAGATGTTGCCAG  592
            ||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  381  CAAGATCATGATTCGGGGGAAAGGATCAGTGAAAGAAGGGAAAGTTGGGCGTAAAGATGGTCAGATGTTGCCAG  454

Query  593  GAGAAGATGAGCCACTTCATGCCCTGGTTACTGCCAATACAATGGAGAACGTCAAAAAGGCAGTGGAACAGATA  666
            |.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  455  GCGAAGATGAGCCTCTTCATGCTCTAGTCACTGCCAATACGATGGAGAATGTCAAAAAGGCAGTAGAACAGATC  528

Query  667  AGAAACATCCTGAAGCAGGGTATCGAGACTCCAGAGGACCAGAATGATCTACGGAAGATGCAGCTTCGGGAGTT  740
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  529  AGAAACATCCTGAAGCAGGGTATTGAGACCCCAGAGGACCAGAACGATCTACGGAAAATGCAGCTTCGAGAGTT  602

Query  741  GGCTCGCTTAAATGGGACCCTTCGGGAAGACGATAACAGGATCTTAAGACCCTGGCAGAGCTCAGAGACCCGCA  814
            |||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  603  GGCTCGCTTGAATGGCACTCTACGGGAAGATGATAATAGGATCTTAAGGCCCTGGCAGAGCTCAGAGACGCGCA  676

Query  815  GCATTACCAACACCACAGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGCCACATTGCTTCAGACTGTAAATTCCAAAGG  888
            ||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||
Sbjct  677  GCATTACCAATACTACTGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGTCACATTGCTTCTGATTGCAAATTTCAGAGG  750

Query  889  CCTGGTGATCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGTCCCTCATGGCTGAACTGGG  962
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  751  CCTGGCGACCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGTCCCTTATGGCTGAGCTAGG  824

Query  963  TGAAGCACCTGTCCCAGCATCTGTGGGCTCCACCTCTGGGCCTGCCACCACACCCCTGGCCAGCGCACCTCGTC  1036
            .|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||..|.|
Sbjct  825  GGAAGCTCCTGTCCCTGCATCTGTGGGCTCTACCTCTGGGCCTGCCACCACGCCCCTGGCTAGTGCACCAAGAC  898

Query 1037  CTGCTGCTCCCGCCAACAACCCACCTCCACCGTCTCTCATGTCTACCACCCAGAGCCGCCCACCCTGGATGAAT  1110
            ||||||||||.||||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  899  CTGCTGCTCCTGCCAGCAACCCACCACCACCGTCTCTCATGTCTACAACTCAGAGCCGCCCACCCTGGATGAAT  972

Query 1111  TCTGGCCCTTCAGAGAGTCGGCCCTACCACGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTGGGCCCGGAGGTGGCCCCCA  1184
            |||||.||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  973  TCTGGTCCTTCAGAGAATCGGCCCTACCATGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTGGTCCTGGAGGTGGCCCCCA  1046

Query 1185  CAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGACATCCCATGCAGCACAACCCCAATGGAC  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1047  CAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGGCATCCCATGCAGCACAACCCAAATGGAC  1120

Query 1259  CCCCACCCCCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCCTCCTGGGCACCATGGCCCT  1332
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1121  CACCACCACCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCCACCTGGGCACCATGGCCCT  1194

Query 1333  CCTCCAATGGATCAGTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCCTGCATCAAGGAAAAGGTAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195  CCTCCAATGGATCAGTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCCTGCATCAAGGAAAAGGTAT  1268

Query 1407  GATGCCGCCACCACCTATGGGCATGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCCAGTGGGCAGCCCCCACCCCCTCCCT  1480
            |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1269  GATGCCGCCGCCGCCTATGGGCATGATGCCGCCGCCTCCGCCACCTCCCAGTGGGCAGCCCCCGCCTCCTCCCT  1342

Query 1481  CTGGTCCTCTTCCCCCATGGCAACAACAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCCGCCCAGCAGCAGTATGGCT  1554
            |||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1343  CTGGTCCTCTTCCTCCATGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCCGCCCAGCAGCAGTATGGCT  1416

Query 1555  TCCAGTACCCCCTTGCCATGGCAGCAAA----GA----TCCCTCCCCGCGGCGGCGATGG------------CC  1608
            |||||.||||||||||||||||||||||    ||    |.||.||.||    .|||.|||            ||
Sbjct 1417  TCCAGCACCCCCTTGCCATGGCAGCAAAATACGACGACTACCACCACG----AGCGCTGGCACAGGGTCCATCC  1486

Query 1609  CGAGCCATG-----AG----AGTGAGGACTTTCCGC-GC----CCATTGG------------------------  1644
            |  ||||||     ||    || |.||  .|.|||| ||    |||  ||                        
Sbjct 1487  C--GCCATGGCAACAGCAGCAG-GCGG--CTGCCGCAGCTTCTCCA--GGAACCCCTCAGATGCAAGGCAACCC  1553

Query 1645  --------------------------------------------------------------------------  1644
                                                                                      
Sbjct 1554  CACTATGGTGCCCCTGCCCCCCGGGGTCCAGCCGCCTCTGCCGCCCGGGGCCCCTCCCCCTCCGCCGCCTCCGC  1627

Query 1645  --------------------------------------------------------------------------  1644
                                                                                      
Sbjct 1628  CACCTGGTTCCGCCGGCATGATGTATGCCCCACCCCCTCCTCCTCCGCCTCCCATGGACCCTTCTAACTTTGTC  1701

Query 1645  --------------------------------------------------------------------------  1644
                                                                                      
Sbjct 1702  ACCATGATGGGCATGGGGGTGGCGGGCATGCCGCCCTTCGGGATGCCTCCAGCTCCCCCACCGCCTCCACCACA  1775

Query 1645  ----  1644
                
Sbjct 1776  GAAC  1779