Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01821
• Subject: XM_017027233.1
• Aligned Length: 2125
• Identities: 1452
• Gaps: 455

Alignment

Query    1  ATGACCACGTTGAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGACGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAAGAGCTGAGGCTGCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGACCTTGCCCAGAGGAAACTGTACCGAGAAGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC  148
                                              |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||
Sbjct    1  ----------------------------------ATGCTAGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTAGGGAATC  40

Query  149  AATCACTCCACAGAGATACTTTCCACTTCCTAAAGGAA-GAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAG  221
            ||.||.|||||..||||||||||||||| ||.|.|||| |||||||||||||.||||.|||||.|||.||||||
Sbjct   41  AACCATTCCACCAAGATACTTTCCACTT-CTTAGGGAAGGAAAAGTTTTGGAAGATGAAGACAACAAGCCAAAG  113

Query  222  AGAAGGGAATTTAGGAGGCAAGATCCAAATGGAGATGGAGACTGTTTCAGAATCAGGAACACATGAAGGCTTGT  295
            |||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||..|.||
Sbjct  114  AGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAATTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGAGTGGT  187

Query  296  TCAGTCATCAAACCTGGGAACAAATTTCAAGTGACTTAACCAGGTTTCAAGACTCCAT--GGTAAACAGCTTTC  367
            .|.||||.||||..||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.|||||||  ||  |||||||.||
Sbjct  188  CCTGTCAGCAAATATGGGAACAAATTGCAAGTGACCTAACCAGGTCTCAAAACTCCATAAGG--AACAGCTCTC  259

Query  368  AGTTCTCCAAACAAGATGATATGCCCTGCCAGGTTGATGCAGGACTATCTATAATTCACGTAAGACAGAAACCT  441
            ||||||.||||.|||.||||.|.|||||||||.||||.|||.||||||||||||.||||||...||||||||||
Sbjct  260  AGTTCTTCAAAGAAGGTGATGTCCCCTGCCAGATTGAGGCAAGACTATCTATAAGTCACGTGCAACAGAAACCT  333

Query  442  T-CTGAGGGTAGGACGTGTAAAAAGTCCTTTAGTGATGTCTCCGTCCTTGATCTTCATCAACAACTACAGTCAA  514
            | |.|..|..|.|| .||||||.|||||||.||||||||.||.|||.|||||||||||||||||..|||.|||.
Sbjct  334  TACCGTTGTAATGA-ATGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTTCTGTCTTTGATCTTCATCAACAATCACACTCAG  406

Query  515  GAGAGAAGTCTCATACATGTGATGAATGTGGAAAGAGTTTCTGTTATAGCTCAGCTCTTCGTATTCATCAGAGA  588
            |||||||.|||||||||||||.|||.||||||||.||.||||||||.|||.||||.||||.|||||||||||||
Sbjct  407  GAGAGAAATCTCATACATGTGGTGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACAGCCCAGCCCTTCATATTCATCAGAGA  480

Query  589  GTTCACATGGGGGAGAAACTCTATAATTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTCAATCAGAGCTCACATCTGCAAAT  662
            ||.||.|||||.||.|||..||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct  481  GTCCATATGGGAGAAAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAATCAGAGCTCACATCTGCAAAC  554

Query  663  TCATCAGAGAATCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTTAGTCGTAGATCAG  736
            ||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||...|.|||||||||
Sbjct  555  TCATCAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGGGCAATGTGGGAAAGGCTTCCATAGTAGATCAG  628

Query  737  GACTTTATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGTGAAACCTCATATTTGTGAGAAATGTGGGAAGGCCTTCATT  810
            .||||.||||||||.|.|||||.||||||||||.|||||||.|||.|||||||.||||||||||.|||||||||
Sbjct  629  CACTTAATGTTCATTGCAAATTGCACACAGGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGGAATGTGGGAAAGCCTTCATT  702

Query  811  CATGATTCCCAGCTTCAGGAACATCAAAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTTGTAA  884
            ||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  703  CATGATTCACAGCTTCAAGAACATCAGAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTGGTAA  776

Query  885  GAGCTTCCGTAGTAGAGCAAATCTTAATAGGCATTCCATGGTTCACATGCGAGAGAAACCATTCAGATGTGATA  958
            ||||||||||..||||.|||..|||||||||||||||||||||||||...||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  777  GAGCTTCCGTGTTAGATCAAGACTTAATAGGCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTCAGATGTGATA  850

Query  959  CATGTGGTAAGAGCTTTGGTCTGAAATCAGCACTTAATAGTCATCGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACGGTAC  1032
            |||||||.||||.||||.|||.||.|||||||||||||||||||..|||||||||||.||.||||||.|..|||
Sbjct  851  CATGTGGCAAGAACTTTCGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATTCCATGGTCCACATAGAAGAGAAGCCATAC  924

Query 1033  AAATGTGAGGAATGTGGAAAACGCTTCATTTATAGGCAAGATCTTTATAAGCATCAGATAGACCACACAGGGGA  1106
            |||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||.||||.|||.||||||||||||.|.|||||||||.||
Sbjct  925  AAATGTGAGCAATGTGGAAAAGGCTTCATTTGTAGGCGAGATTTTTGTAAGCATCAGATGGTCCACACAGGAGA  998

Query 1107  GAAGCCATATAATTGTAAAGAATGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAGGTCTTTCAAGACATGTGCGAGTCC  1180
            |||.|||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||.|||||.||||||..|..|||..||.|||||
Sbjct  999  GAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGACCTTCAGATGGTCCTCATGTCTTTTGAACCATCAGCAAGTCC  1072

Query 1181  ACAGTGGAGAGACAACATTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACGTTATTCTCAC  1254
            ||||||||.|.|.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||.||.
Sbjct 1073  ACAGTGGACAAAAATCCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACGACGATCTTCCCAT  1146

Query 1255  CAGAGAGCGCACAGTGGAGAAAAGCCATATAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACAAAAGGAGGTTGGATCT  1328
            ||||||.|.||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||.||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1147  CAGAGATCCCACAATGGAGAAAAGCCATATAACTGTGAGGAGTGTGGTAAGGACTATAAAAGGAGGTTGGATCT  1220

Query 1329  TGACTTTCATCAGAGGGTCCACAGAGGAGAGAAACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTGGCTGGG  1402
            |||.|||||.|||||||||||||..||.||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1221  TGAGTTTCACCAGAGGGTCCACACGGGTGAGAGACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGCAAGAGCTTTGGCTGGG  1294

Query 1403  CCTCGTGTCTTTTGAATCATCAGAGAATCCACAGTGGAGAAAAACCATTTAAATGTGAAGAATGTGGGAAAAGA  1476
            ||||.|||||||||||.||||||                                                   
Sbjct 1295  CCTCCTGTCTTTTGAAACATCAG---------------------------------------------------  1317

Query 1477  TTTACTCAGAATTCACAACTTTATACCCATCGTAGAGTCCACAGTGGAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTG  1550
                                             |||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1318  ---------------------------------AGACTCCACAGTGGGGAAAAACCTTTCAAATGTGAAGAGTG  1358

Query 1551  TGGGAAAAGATTTACTCAGAATTCACAACTTTATTCTCATCGCAGAGTCCACACTGGAGTAAAGCCATACAAAT  1624
            |||.||.|||||||||||||.||||||||||.||||.||||..|.|..|||.|||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1359  TGGAAAGAGATTTACTCAGAGTTCACAACTTCATTCCCATCAGACATGCCATACTGGAGAAAAGCTATACAAAT  1432

Query 1625  GTGAAGAGTGTGGGAAGGGCTTCAACAGTAAGTTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACACCGGAGAGAGA  1698
            ||||..||||||.||||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||...||||||.||
Sbjct 1433  GTGAGCAGTGTGAGAAGGGGTACAACAGTAAATTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACGGGGGAGAGCGA  1506

Query 1699  CCTTATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATGG  1772
            ||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||.||||.|||.||.|||||||.|||.||||||||||..|
Sbjct 1507  CCCTATAATTGTAAGGAATGTGGAAAGAGCTTTGGCTGGGCTTCATGTCTTTTGAAACATCAGAGACTCCACAG  1580

Query 1773  TGATGAAAAGCCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAGAGATTTACTGAGAATTCACAGCTTCATTCCCATCAG-  1845
            ||..|||||||||||.||||.||  ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||..|||||| 
Sbjct 1581  TGGAGAAAAGCCATTGAAATCTG--GAGTGTGGGAAGAGATCTACTCAGAATTCACAGCTTCATTTACATCAGT  1652

Query 1846  -AGGGTTCACACTGGG-GAAAAGCCATACAAATGTGAGAAGTGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAACTCAT  1917
             ||   ||....|||| |||||||||||                                              
Sbjct 1653  AAG---TCTATGTGGGAGAAAAGCCATA----------------------------------------------  1677

Query 1918  CTAACCCATCAGAGACTCCACAGTAGAGAAAAACTACTTCAATGTGAGGACTGTGGGAAGAGCATTGTGCACAG  1991
                                                                                      
Sbjct 1678  --------------------------------------------------------------------------  1677

Query 1992  TTCATGCCTTAAAGACCAACAAAGAGACCAAAGTGGAGAGAAAACATCTAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCT  2065
                                                                                      
Sbjct 1678  --------------------------------------------------------------------------  1677

Query 2066  ACAAGAGGCGCTTGAATCTTGATACGCTTTTGTCATTATTTTTAAATGACACA  2118
                                                                 
Sbjct 1678  -----------------------------------------------------  1677