Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01823
- Subject:
- XM_005259209.3
- Aligned Length:
- 1452
- Identities:
- 1192
- Gaps:
- 102
Alignment
Query 1 ATGACCACATTCA----------------------------AGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGT 46
||||.| .||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1 ATGATC-GATTCAGGAGAAAAGAAGCCTGGGCGGAGAGCAGAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGA 73
Query 47 TCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTGAGAAC 120
||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 74 TCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAAC 147
Query 121 TTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATCAACCATTCCACCCTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGAT 194
||||.|||||||||.|||||||| |||.|||
Sbjct 148 TTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGG-------------------------------AGGCAAG------------- 177
Query 195 GATGGAGACAGCAACCCAAA--GAGAAGGAAATTCAGGCGGCAAGACTATTGCGGAAGCAGGACCACATGAAGA 266
|.||||| ||||.|| |||||.||.|.|||||||||.||||||||||
Sbjct 178 -------------ATCCAAACTGAGATGG--------------AGACTGTTCCAGAAGCAGGAACACATGAAGA 224
Query 267 CTGCCCTTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGACTTAACCCAGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATT 340
.|...|.|||.|||||||.||||||||||.||||||||||||||||..|||||||||..|||.|||||.|||.|
Sbjct 225 ATTTTCCTGCAAGCAAATTTGGGAACAAATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCTCAAGATACCACCATAAGTAACT 298
Query 341 CTCACTTCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAGGCAGGACTATCTATAATTCATACAGGACAGAAA 414
||||.||.||||||||||.|||...||||||||||.||.|.|||.|||||||||.|.||||.|||.||.|.|||
Sbjct 299 CTCAGTTATTTGAACAAGATGACAACCCCTCCCAGATTAAAGCAAGACTATCTACAGTTCACACAAGAGAAAAA 372
Query 415 CCTTCACAGAATGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTGCCATCTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTC 488
||||..|||..||..||.||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||..|.||
Sbjct 373 CCTTTCCAGGGTGAAAATTGTAAACAGTTCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATATTC 446
Query 489 AGGAGAGAAGTCTCATACATGCAATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCTCTTCGTATTCACCAGA 562
||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||
Sbjct 447 AGGAGAGAAGTCTCATACCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCCCTTCATATTCATCAGA 520
Query 563 GAGTTCACTTGAGAGAGAAACTCTCTAAGTGTGACATGCGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGCTCATGTCTGCAA 636
|.||.|||.||.|||.||||..||.|||||||||..||.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct 521 GGGTCCACATGGGAGTGAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAGTCAGAGCTCACGTCTGCAA 594
Query 637 ACTCGTGAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGAGC 710
||||.|.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 595 ACTCATCAAAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGATC 668
Query 711 GATACTTCAAGTTCACTGCAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATATTTGTGAGAAATGTGGGAGGGCCTTCA 784
...||||.|||||||.|||||||||||||...|||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 669 AGCACTTAAAGTTCATTGCAAATTACACATGAGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGAAATGTGGGAAGGCTTTCA 742
Query 785 TTCACGATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGATAATTCATACTGGGGAGAAGCCGTTCAAATGTGAAATATGTGGT 858
|.|||.||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 743 TGCACAATTTCCAGCTTCAGAAACATCACAGAATTCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAAATATGTGGT 816
Query 859 AAGAGCTTCTGCCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAATCTGA 932
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 817 AAGAGCTTCTGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAATCTGA 890
Query 933 GGAGTGTGGAAAAGGCTTCACTGATAGCCTAGATTTGCATAAGCATCAGATAATTCACACAGGACAGAAACCGT 1006
..|||.|||||.|||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|..|||||||||||.|
Sbjct 891 AAAGTATGGAAGAGGTTTCATTGATAGGCTAGATTTGCATAAGCATCAGATGATTCATATGGGACAGAAACCAT 964
Query 1007 ACAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATATCTTTTGATCCATCAGCGAATCCACAGTGGA 1080
|.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||.|||.||||||.||||
Sbjct 965 ATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAAATGGTCCTCATATCTTTTGGTCCATCAACGAGTCCACACTGGA 1038
Query 1081 GAAAAACCATACAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTAACTTGCACCAGAGGGT 1154
|||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||...
Sbjct 1039 GAAAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTGACTTCCACCATAGAAC 1112
Query 1155 CCATACTGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCTTCAAGTATTTTGAATC 1228
|||.||.|||||||||.|||||||.|||.|..|.||.||||||||||||||.|..|||||.|||||||||||||
Sbjct 1113 CCACACGGGAGAGAGATCTTATAACTGTGATAACTGCGGGAAGAGCTTTAGACATGCTTCTAGTATTTTGAATC 1186
Query 1229 ATAAGAAACTCCACTGCCGGAAAAAACCCTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAGGCTTGTACACCGGTCTTTC 1302
||||||||||||||||||..|.|||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||..||||||.|.|
Sbjct 1187 ATAAGAAACTCCACTGCCAAAGAAAGCCATTGAAATGTGAAGACTGTGGAAAGAGGCTTGTATGCCGGTCATAC 1260
Query 1303 TGTAAAGACCAACAAGGAGACCACAATGGAGAAAACTCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAG 1376
|||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 TGTAAAGACCAACAAAGAGACCACAGTGGAGAAAACCCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAG 1334
Query 1377 GCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGATATG 1422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1335 GCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACATA 1380