Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01980
- Subject:
- NM_021542.4
- Aligned Length:
- 1519
- Identities:
- 1282
- Gaps:
- 35
Alignment
Query 1 ATGGTGGACCGGGGCCCTCTGCTCACCTCGGCCATCATCTTCTACCTGGCCATCGGGGCGGCGATCTTCGAAGT 74
||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTGGACCGGGGTCCTTTACTCACCTCGGCCATCATATTCTACCTGGCCATCGGGGCAGCGATCTTCGAAGT 74
Query 75 GCTGGAGGAGCCACACTGGAAGGAGGCCAAGAAAAACTACTACACACAGAAGCTGCATCTGCTCAAGGAGTTCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 75 GCTGGAGGAGCCACACTGGAAGGAGGCCAAGAAAAACTACTATACACAGAAACTGCATCTACTCAAGGAGTTTC 148
Query 149 CGTGCCTGGGTCAGGAGGGCCTGGACAAGATCCTAGAGGTGGTATCTGATGCTGCAGGA-CAGGGTGTGGCCAT 221
||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 149 CGTGCCTGAGTCAGGAGGGACTGGACAAGATCCTACAGGTGGTGTCTGATGCTGC-GGATCAGGGTGTGGCCAT 221
Query 222 CACAGGGAACCAGACCTTCAACAACTGGAACTGGCCCAATGCAATGATTTTTGCAGCGACCGTCATTACCACCA 295
|||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||
Sbjct 222 CACCGGGAACCAGACTTTCAACAACTGGAACTGGCCCAATGCAATGATTTTTGCTGCCACAGTCATCACCACCA 295
Query 296 TTGGATATGGCAATGTGGCTCCCAAGACCCCCGCCGGTCGCCTCTTCTGTGTTTTCTATGGTCTCTTCGGGGTG 369
|.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 296 TCGGTTATGGCAATGTGGCTCCCAAGACCCCAGCTGGGCGCCTCTTCTGTGTCTTCTACGGCCTCTTCGGGGTG 369
Query 370 CCGCTCTGCCTGACGTGGATCAGTGCCCTGGGCAAGTTCTTCGGGGGACGTGCCAAGAGACTAGGGCAGTTCCT 443
|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.||.|||||.||
Sbjct 370 CCGCTGTGCCTGACATGGATCAGTGCCCTGGGCAAGTTCTTCGGGGGACGTGCAAAGAGGTTGGGCCAGTTTCT 443
Query 444 TACCAAGAGAGGTGTGAGTCTGCGGAAGGCGCAGATCACGTGCACAGTCATCTTCATCGTGTGGGGCGTCCTAG 517
|||||.||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 444 TACCAGGAGAGGAGTGAGCCTGAGGAAGGCTCAGATCACGTGTACAGCCATCTTCATCGTGTGGGGTGTCCTGG 517
Query 518 TCCACCTGGTGATCCCACCCTTCGTATTCATGGTGACTGAGGGGTGGAACTACATCGAGGGCCTCTACTACTCC 591
||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|..|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 518 TCCATCTGGTGATCCCGCCCTTTGTGTTCATGGTGACAGAAGAATGGAACTACATTGAGGGCCTCTACTATTCC 591
Query 592 TTCATCACCATCTCCACCATCGGCTTCGGTGACTTTGTGGCCGGTGTGAACCCCAGCGCCAACTACCACGCCCT 665
||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 592 TTCATCACCATCTCCACCATTGGCTTTGGGGACTTTGTGGCCGGTGTGAACCCCAGTGCCAACTACCACGCCCT 665
Query 666 GTACCGCTACTTCGTGGAGCTCTGGATCTACTTGGGGCTGGCCTGGCTGTCCCTTTTTGTCAACTGGAAGGTGA 739
.|||||.|||||.||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 666 ATACCGATACTTTGTGGAGCTTTGGATCTACCTGGGGCTGGCTTGGCTGTCCCTCTTTGTCAACTGGAAGGTGA 739
Query 740 GCATGTTTGTGGAAGTCCACAAAGCCATTAAGAAGCGGCGGCGGCGACGGAAGGAGTCCTTTGAGAGCTCCCCA 813
||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 740 GCATGTTTGTGGAAGTACACAAAGCCATTAAAAAGAGGCGGCGGCGGCGCAAGGAATCCTTTGAGAGCTCTCCA 813
Query 814 CACTCCCGGAAGGCCCTGCAGGTGAAGGGGAGCACAGCCTCCAAGGACGTCAACATCTTCAGCTTTCTTTCCAA 887
|||||||||||||||||.|||.||...||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 814 CACTCCCGGAAGGCCCTACAGATGGCTGGAAGTACAGCATCCAAGGACGTCAACATCTTCAGCTTCCTATCCAA 887
Query 888 GAAGGAAGAGACCTACAACGACCTCATCAAGCAGATCGGGAAGAAGGCCATGAAGACAAGCGGGGGTGGGGAGA 961
.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 888 AAAGGAGGAGACCTACAATGACCTCATCAAACAGATTGGGAAGAAGGCAATGAAAACAAGTGGGGGAGGGGAGA 961
Query 962 CGGGCCCGGGCCC------AGGGCTGGGGCCTCAAGGCGGTGGGCT-CCCAGCACTGCCCCCTTCCCTGGTGCC 1028
.||.|||.||.|| .||||||||.||||||||.|.|.|.|| ||||.|| |.||..|.|||||||..||
Sbjct 962 GGGTCCCAGGACCTGGACACGGGCTGGGACCTCAAGGGGATAGACTACCCACCA-TCCCTGCATCCCTGGCACC 1034
Query 1029 CCTGGTAGTCTACTCCAAGAACCGGGTGCCCACCTTGGAAGAGGTGTCACAGACACTGAGGAGCAAAGGCCACG 1102
..||||.|||||.||||||||.||||||||||.||||||||||||.||.|||||.||.|..|.|||.||.||.|
Sbjct 1035 TTTGGTGGTCTATTCCAAGAATCGGGTGCCCAGCTTGGAAGAGGTATCTCAGACTCTAAAAAACAAGGGACATG 1108
Query 1103 TATCAAGGTCCCCAGATGAGGAGGCTGTGGCACGGGCCCCTGAAGACAGCTCCCCTGCCCCCGAGGTGTTCATG 1176
|.||||||.|.|..|.|||||||||||.|||||.||||||..|.||.||.|.||...||.|.||.|||||.||.
Sbjct 1109 TGTCAAGGCCACTTGGTGAGGAGGCTGGGGCACAGGCCCCCAAGGATAGTTACCAAACCTCTGAAGTGTTTATT 1182
Query 1177 AACCAGCTGGACCGCATCAGCGAGGAATGCGAGCCATGGGACGCCCAGGACTACCACCCACTCATCTTCCAGGA 1250
|||||.||||||||.|||||.|||||..|.|||||.|||||.||||.||||||||||||.|||||||||||..|
Sbjct 1183 AACCAACTGGACCGTATCAGTGAGGAGGGAGAGCCGTGGGAAGCCCTGGACTACCACCCGCTCATCTTCCAAAA 1256
Query 1251 CGCCAGCATCACCTTCGTGAACACG--GAGGCTGGCCTCTCAGACGAGGAGACCTCCAAGTCCTCGCTAGAGGA 1322
.||||.|||.||||| ||||.|.| ||..|.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..|.|||||
Sbjct 1257 TGCCAACATTACCTT--TGAAAATGAAGAAACCGGCCTCTCAGACGAGGAGACCTCTAAGTCTTCTGTGGAGGA 1328
Query 1323 CAACTTG---GCAGGGGAGGAGAGCCCCCAGCAGGG------GGCTGAAGCCAAGGCGCCCCTG---AACATGG 1384
||||.|| .||..||||.|| ||..|.||||| ||||| ||||.|||.|| |.||.||
Sbjct 1329 CAACCTGACCTCAAAGGAGCAG---CCTGAACAGGGACCCATGGCTG------AGGCACCCTTGAGCAGCACGG 1393
Query 1385 GCGAGTTCCCCTCCTCCTCCGAGTCCACCTTCACCAGCACTGAGTCTGAGCTCTCTGTGCCTTACGAACAGCTG 1458
|.||.|||||.||.|||...||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1394 GTGAATTCCCTTCATCCGATGAGTCCACCTTCACCAGCACCGAGTCAGAGCTCTCCGTGCCTTACGAGCAGCTG 1467
Query 1459 ATGAATGAGTACAACAAGGCTAACAGCCCCAAGGGCACA 1497
|||||.||.|||||||||||..|.|.|||||.||||||.
Sbjct 1468 ATGAACGAATACAACAAGGCAGATAACCCCAGGGGCACG 1506