Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02021
• Subject: NM_183294.2
• Aligned Length: 1074
• Identities: 907
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGATGGAGAAGTATGAAAAAATTGGGAAAATTGGAGAAGGATCCTATGGAGTTGTTTTCAAATGTAGAAACAG  74
               |||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct    1  ---ATGGAAAAATATGAAAAAATTGGAAAGATTGGAGAAGGCTCCTATGGGGTAGTGTTCAAGTGCAGAAACAG  71

Query   75  GGACACGGGTCAGATTGTGGCCATCAAGAAGTTTCTGGAATCAGAAGATGACCCTGTCATAAAGAAAATTGCCC  148
            |||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct   72  GGACACGGGTCAGATCGTGGCCATCAAGAGGTTTCTGGAAACCGAAGATGACCCTGTCATAAAGAAAATCGCCC  145

Query  149  TTCGGGAAATCCGAATGCTCAAGCAACTCAAGCATCCCAACCTTGTTAACCTCCTGGAAGTCTTCAGGAGGAAA  222
            ||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct  146  TTCGAGAAATCCGCATGCTCAAGCAACTCAAGCACCCCAACCTGGTCAACCTCCTGGAAGTCTTCCGGAGGAAG  219

Query  223  CGGAGGCTTCACCTGGTGTTTGAATATTGTGACCACACAGTTCTCCATGAGTTGGACAGATACCAAAGAGGGGT  296
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.||.|||.||||..|.||.||.||.|||||
Sbjct  220  CGGAGGCTTCACCTGGTGTTCGAGTACTGCGACCACACGGTGCTTCACGAGCTGGATCGGTATCAGAGGGGGGT  293

Query  297  ACCAGAACATCTCGTGAAGAGCATAACTTGGCAGACACTGCAAGCTGTAAATTTTTGCCATAAACACAATTGCA  370
            ||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  294  ACCAGAGCCTCTCGTGAAGAACATAACTTGGCAGACACTGCAGGCTGTAAATTTCTGCCATAAACATAACTGCA  367

Query  371  TACATAGAGACGTGAAGCCAGAAAATATCCTCATCACGAAACATTCCGTGATTAAGCTTTGTGACTTTGGATTT  444
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|..||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  368  TACACAGAGACGTGAAGCCGGAAAATATTCTCATCACCAAACAGTCAGCCATTAAGCTCTGTGACTTTGGGTTC  441

Query  445  GCTCGGCTTTTGACTGGACCGAGTGACTACTATACAGACTACGTGGCTACCAGGTGGTACCGCTCCCCTGAGCT  518
            ||.||||||.|.||||||||..||||||||||.||.|||||||||||.|||.|||||||||||||.||.|||||
Sbjct  442  GCACGGCTTCTCACTGGACCAGGTGACTACTACACGGACTACGTGGCCACCCGGTGGTACCGCTCACCCGAGCT  515

Query  519  GCTGGTGGGGGACACGCAGTACGGCCCCCCGGTGGATGTTTGGGCAATTGGCTGTGTCTTTGCTGAGCTGCTGT  592
            |||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||.|.||||
Sbjct  516  GCTAGTGGGAGACACGCAGTATGGTCCCCCTGTAGATGTCTGGGCAATTGGCTGTGTGTTTGCTGAGTTACTGT  589

Query  593  CAGGAGTGCCTCTGTGGCCAGGAAAATCGGATGTGGATCAGCTGTATCTGATTAGGAAGACCTTGGGGGATCTC  666
            |.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||.|||||||.|||
Sbjct  590  CCGGAGTGCCTCTATGGCCAGGAAAATCTGACGTGGATCAGCTCTACCTGATAAGGAAAACCCTGGGGGACCTC  663

Query  667  ATTCCTAGGCACCAGCAAGTGTTTAGCACGAATCAGTACTTCAGTGGAGTGAAAATTCCAGACCCTGAAGATAT  740
            |||||.||||||||||||||.|||||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  664  ATTCCCAGGCACCAGCAAGTATTTAGCATGAATCAATACTTCAGTGGGGTGAAAATTCCAGACCCTGAAGACAT  737

Query  741  GGAACCACTTGAATTAAAATTCCCAAACATCTCTTATCCTGCCCTGGGGCTCCTAAAGGGCTGTCTCCACATGG  814
            ||||.|||||||.||.|||||.|||||||||||.||..||||.|||||..||.||||||||||.||||||||||
Sbjct  738  GGAAACACTTGAGTTGAAATTTCCAAACATCTCCTACTCTGCACTGGGCTTCTTAAAGGGCTGCCTCCACATGG  811

Query  815  ACCCTACTCAAAGGCTGACATGTGAACAGCTGTTGCATCACCCATATTTTGAAAACATCAGAGAAATAGAGGAT  888
            |.|||.||.|.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|.|||..|||||.|.|.|||.
Sbjct  812  ATCCTGCTGAGAGGCTGACATGCGAACAGCTGTTGCAGCATCCATATTTTGACAGCATTCGAGAAGTTGGGGAG  885

Query  889  TTGGCAAAAGAACACAACAAACCAACAAGGAAGACCCTAAGAAAGAGCCGAAAGCACCACTGCTTTACAGAAAC  962
            |||.|.|.|.||||..||||||||.|.||||||||.||.||..||||..|||||||      |||.||.|    
Sbjct  886  TTGACGAGACAACATGACAAACCAGCGAGGAAGACTCTGAGGCAGAGTAGAAAGCA------CTTGACTG----  949

Query  963  ATCCAAGTTGCAGTACCTACCCCAGCTAACTGGCAGCAGCATCCTTCCAGCTTTGGATAATAAGAAGTACTACT  1036
                 .|.|||||||||||||.||||||||..|||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||.|||
Sbjct  950  -----GGCTGCAGTACCTACCTCAGCTAACCAGCAGCCGCATCCTTCCAGCTTTGGACAATAAGAAGTACCACT  1018

Query 1037  GTGATACCAAGAAACTTAACTACCGTTTTCCAAACATT  1074
            ||..||||||||.|.|||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 1019  GTAGTACCAAGAGATTTAACTACCATTTTCCAAATATT  1056