Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02025
- Subject:
- NM_018534.4
- Aligned Length:
- 2851
- Identities:
- 2602
- Gaps:
- 206
Alignment
Query 1 ATGGATATGTTTCCTCTCACCTGGGTTTTCTTAGCCCTCTACTTTTCAAGACACCAAGTGAGAGGCCAACCAGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATATGTTTCCTCTCACCTGGGTTTTCTTAGCCCTCTACTTTTCAAGACACCAAGTGAGAGGCCAACCAGA 74
Query 75 CCCACCGTGCGGAGGTCGTTTGAATTCCAAAGATGCTGGCTATATCACCTCTCCCGGTTACCCCCAGGACTACC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCCACCGTGCGGAGGTCGTTTGAATTCCAAAGATGCTGGCTATATCACCTCTCCCGGTTACCCCCAGGACTACC 148
Query 149 CCTCCCACCAGAACTGCGAGTGGATTGTTTACGCCCCCGAACCCAACCAGAAGATTGTCCTCAACTTCAACCCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCTCCCACCAGAACTGCGAGTGGATTGTTTACGCCCCCGAACCCAACCAGAAGATTGTCCTCAACTTCAACCCT 222
Query 223 CACTTTGAAATCGAGAAGCACGACTGCAAGTATGACTTTATCGAGATTCGGGATGGGGACAGTGAATCCGCAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CACTTTGAAATCGAGAAGCACGACTGCAAGTATGACTTTATCGAGATTCGGGATGGGGACAGTGAATCCGCAGA 296
Query 297 CCTCCTGGGCAAACACTGTGGGAACATCGCCCCGCCCACCATCATCTCCTCGGGCTCCATGCTCTACATCAAGT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCTCCTGGGCAAACACTGTGGGAACATCGCCCCGCCCACCATCATCTCCTCGGGCTCCATGCTCTACATCAAGT 370
Query 371 TCACCTCCGACTACGCCCGGCAGGGGGCAGGCTTCTCTCTGCGCTACGAGATCTTCAAGACAGGCTCTGAAGAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCACCTCCGACTACGCCCGGCAGGGGGCAGGCTTCTCTCTGCGCTACGAGATCTTCAAGACAGGCTCTGAAGAT 444
Query 445 TGCTCAAAAAACTTCACAAGCCCCAACGGGACCATCGAATCTCCTGGGTTTCCTGAGAAGTATCCACACAACTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGCTCAAAAAACTTCACAAGCCCCAACGGGACCATCGAATCTCCTGGGTTTCCTGAGAAGTATCCACACAACTT 518
Query 519 GGACTGCACCTTTACCATCCTGGCCAAACCCAAGATGGAGATCATCCTGCAGTTCCTGATCTTTGACCTGGAGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGACTGCACCTTTACCATCCTGGCCAAACCCAAGATGGAGATCATCCTGCAGTTCCTGATCTTTGACCTGGAGC 592
Query 593 ATGACCCTTTGCAGGTGGGAGAGGGGGACTGCAAGTACGATTGGCTGGACATCTGGGATGGCATTCCACATGTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGACCCTTTGCAGGTGGGAGAGGGGGACTGCAAGTACGATTGGCTGGACATCTGGGATGGCATTCCACATGTT 666
Query 667 GGCCCCCTGATTGGCAAGTACTGTGGGACCAAAACACCCTCTGAACTTCGTTCATCGACGGGGATCCTCTCCCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGCCCCCTGATTGGCAAGTACTGTGGGACCAAAACACCCTCTGAACTTCGTTCATCGACGGGGATCCTCTCCCT 740
Query 741 GACCTTTCACACGGACATGGCGGTGGCCAAGGATGGCTTCTCTGCGCGTTACTACCTGGTCCACCAAGAGCCAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GACCTTTCACACGGACATGGCGGTGGCCAAGGATGGCTTCTCTGCGCGTTACTACCTGGTCCACCAAGAGCCAC 814
Query 815 TAGAGAACTTTCAGTGCAATGTTCCTCTGGGCATGGAGTCTGGCCGGATTGCTAATGAACAGATCAGTGCCTCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TAGAGAACTTTCAGTGCAATGTTCCTCTGGGCATGGAGTCTGGCCGGATTGCTAATGAACAGATCAGTGCCTCA 888
Query 889 TCTACCTACTCTGATGGGAGGTGGACCCCTCAACAAAGCCGGCTCCATGGTGATGACAATGGCTGGACCCCCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCTACCTACTCTGATGGGAGGTGGACCCCTCAACAAAGCCGGCTCCATGGTGATGACAATGGCTGGACCCCCAA 962
Query 963 CTTGGATTCCAACAAGGAGTATCTCCAGGTGGACCTGCGCTTTTTAACCATGCTCACGGCCATCGCAACACAGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTTGGATTCCAACAAGGAGTATCTCCAGGTGGACCTGCGCTTTTTAACCATGCTCACGGCCATCGCAACACAGG 1036
Query 1037 GAGCGATTTCCAGGGAAACACAGAATGGCTACTATGTCAAATCCTACAAGCTGGAAGTCAGCACTAATGGAGAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GAGCGATTTCCAGGGAAACACAGAATGGCTACTATGTCAAATCCTACAAGCTGGAAGTCAGCACTAATGGAGAG 1110
Query 1111 GACTGGATGGTGTACCGGCATGGCAAAAACCACAAGGTATTTCAAGCCAACAACGATGCAACTGAGGTGGTTCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GACTGGATGGTGTACCGGCATGGCAAAAACCACAAGGTATTTCAAGCCAACAACGATGCAACTGAGGTGGTTCT 1184
Query 1185 GAACAAGCTCCACGCTCCACTGCTGACAAGGTTTGTTAGAATCCGCCCTCAGACCTGGCACTCAGGTATCGCCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAACAAGCTCCACGCTCCACTGCTGACAAGGTTTGTTAGAATCCGCCCTCAGACCTGGCACTCAGGTATCGCCC 1258
Query 1259 TCCGGCTGGAGCTCTTCGGCTGCCGGGTCACAGATGCTCCCTGCTCCAACATGCTGGGGATGCTCTCAGGCCTC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCGGCTGGAGCTCTTCGGCTGCCGGGTCACAGATGCTCCCTGCTCCAACATGCTGGGGATGCTCTCAGGCCTC 1332
Query 1333 ATTGCAGACTCCCAGATCTCCGCCTCTTCCACCCAGGAATACCTCTGGAGCCCCAGTGCAGCCCGCCTGGTCAG 1406
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1333 ATTGCAGACTCCCAGATCTCCGCCTCTTCCACCCAGGAATACCTCTGGAGCCCCAGTGCAGCCCGCCTGGTTAG 1406
Query 1407 CAGCCGCTCGGGCTGGTTCCCTCGAATCCCTCAGGCCCAGCCCGGTGAGGAGTGGCTTCAGGTAGATCTGGGAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAGCCGCTCGGGCTGGTTCCCTCGAATCCCTCAGGCCCAGCCCGGTGAGGAGTGGCTTCAGGTAGATCTGGGAA 1480
Query 1481 CACCCAAGACAGTGAAAGGTGTCATCATCCAGGGAGCCCGCGGAGGAGACAGTATCACTGCTGTGGAAGCCAGA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CACCCAAGACAGTGAAAGGTGTCATCATCCAGGGAGCCCGCGGAGGAGACAGTATCACTGCTGTGGAAGCCAGA 1554
Query 1555 GCATTTGTGCGCAAGTTCAAAGTCTCCTACAGCCTAAACGGCAAGGACTGGGAATACATTCAGGACCCCAGGAC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCATTTGTGCGCAAGTTCAAAGTCTCCTACAGCCTAAACGGCAAGGACTGGGAATACATTCAGGACCCCAGGAC 1628
Query 1629 CCAGCAGCCAAAGCTGTTCGAAGGGAACATGCACTATGACACCCCTGACATCCGAAGGTTTGACCCCATTCCGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCAGCAGCCAAAGCTGTTCGAAGGGAACATGCACTATGACACCCCTGACATCCGAAGGTTTGACCCCATTCCGG 1702
Query 1703 CACAGTATGTGCGGGTATACCCGGAGAGGTGGTCGCCGGCGGGGATTGGGATGCGGCTGGAGGTGCTGGGCTGT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CACAGTATGTGCGGGTATACCCGGAGAGGTGGTCGCCGGCGGGGATTGGGATGCGGCTGGAGGTGCTGGGCTGT 1776
Query 1777 GACTGGACAGACTCCAAGCCCACGGTAGAGACGCTGGGACCCACTGTGAAGAGCGAAGAGACAACCACCCCCTA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GACTGGACAGACTCCAAGCCCACGGTAGAGACGCTGGGACCCACTGTGAAGAGCGAAGAGACAACCACCCCCTA 1850
Query 1851 CCCCACCGAAGAGGAGGCCACAGAGTGTGGGGAGAACTGCAGCTTTGAGGATGACAAAGATTTGCAGCTCCCTT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CCCCACCGAAGAGGAGGCCACAGAGTGTGGGGAGAACTGCAGCTTTGAGGATGACAAAGATTTGCAGCTCCCTT 1924
Query 1925 CGGGATTCAATTGCAACTTCGATTTCCTCGAGGAGCCCTGTGGTTGGATGTATGACCATGCCAAGTGGCTCCGG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CGGGATTCAATTGCAACTTCGATTTCCTCGAGGAGCCCTGTGGTTGGATGTATGACCATGCCAAGTGGCTCCGG 1998
Query 1999 ACCACCTGGGCCAGCAGCTCCAGCCCAAACGACCGGACGTTTCCAGATGACAGGAATTTCTTGCGGCTGCAGAG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ACCACCTGGGCCAGCAGCTCCAGCCCAAACGACCGGACGTTTCCAGATGACAGGAATTTCTTGCGGCTGCAGAG 2072
Query 2073 TGACAGCCAGAGAGAGGGCCAGTATGCCCGGCTCATCAGCCCCCCTGTCCACCTGCCCCGAAGCCCGGTGTGCA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGACAGCCAGAGAGAGGGCCAGTATGCCCGGCTCATCAGCCCCCCTGTCCACCTGCCCCGAAGCCCGGTGTGCA 2146
Query 2147 TGGAGTTCCAGTACCAGGCCACGGGCGGCCGCGGGGTGGCGCTGCAGGTGGTGCGGGAAGCCAGCCAGGAGAGC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGGAGTTCCAGTACCAGGCCACGGGCGGCCGCGGGGTGGCGCTGCAGGTGGTGCGGGAAGCCAGCCAGGAGAGC 2220
Query 2221 AAGTTGCTGTGGGTCATCCGTGAGGACCAGGGCGGCGAGTGGAAGCACGGGCGGATCATCCTGCCCAGCTACGA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AAGTTGCTGTGGGTCATCCGTGAGGACCAGGGCGGCGAGTGGAAGCACGGGCGGATCATCCTGCCCAGCTACGA 2294
Query 2295 CATGGAGTACCAGATTGTGTTCGAGGGAGTGATAGGGAAAGGACGTTCCGGAGAGATTGCCATTGATGACATTC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CATGGAGTACCAGATTGTGTTCGAGGGAGTGATAGGGAAAGGACGTTCCGGAGAGATTGCCATTGATGACATTC 2368
Query 2369 GGATAAGCACTGATGTCCCACTGGAGAACTGCATGGAACCCATCTCGGCTTTTGCAGTGGACATCCCAGAAATA 2442
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GGATAAGCACTGATGTCCCACTGGAGAACTGCATGGAACCCATCTCGGCTTTTGCAG----------------- 2425
Query 2443 CATGAGAGAGAAGGATATGAAGATGAAATTGATGATGAATACGAGGTGG-ACTGGAGCAATTCTTCTTCTGCAA 2515
.||||| ||.|.|| |||.|| || .||.||||
Sbjct 2426 -GTGAGA-------ATTTTAA----------------------AGGGGGCAC------------CCTCCTGC-- 2455
Query 2516 CCTCAGGGTCTGGCGCCCCCTCGACCGA---CAAAGAAAAGAGCTGGCTGTACACCCTGGATCCCATCCTCATC 2586
|||| |||||| ||.|| ||.|||| ||..||||| .||.|
Sbjct 2456 ---CAGG---------------GACCGAGCCCACAG------------TGGACAC---GGTGCCCAT--GCAGC 2494
Query 2587 ACCATCATCGCCATGAGCTCACTGG----GCGT-----CCTCCTGGGGGCCACCT----GTGCAGGCCTCC--- 2644
||||| || |||..||||| .||| ||.|| ||||||..|.| ||||.||.||||
Sbjct 2495 -CCATC----CC---AGCCTACTGGTATTACGTAATGGCCGCC-GGGGGCGCCGTGCTGGTGCTGGTCTCCGTC 2559
Query 2645 -------------TGCTCTACT-GCACCTGTTC--CTACTCGGGCCTGAGCTCCC--GAAG--------CTGCA 2692
|||||.||| .||||.|||| |||..||| || |||| ||.||
Sbjct 2560 GCGCTGGCCCTGGTGCTCCACTACCACCGGTTCCGCTATGCGG----------CCAAGAAGACCGATCACTCCA 2623
Query 2693 CCACACTGGAGA-------ACTACAACTTCGAG----CTCT-ACGATGG------CCTTAAGCA-----CAAGG 2743
.||| ||..|.| ||||||.|..||.| |||| .||.||| ||.|||.|| |.||.
Sbjct 2624 TCAC-CTACAAAACCTCCCACTACACCAACGGGGCCCCTCTGGCGGTGGAGCCCACCCTAACCATTAAGCTAGA 2696
Query 2744 TCAAGATGAACCACCAAAAGTGCTGCTCCGAGGCA---- 2778
.|||| ||| ||| |||| |||
Sbjct 2697 GCAAG----ACC-------GTG--GCTC----GCACTGC 2718