Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02025
• Subject: NM_201264.1
• Aligned Length: 2785
• Identities: 1656
• Gaps: 1127

Alignment

Query    1  ATGGATATGTTTCCTCTCACCTGGGTTTTCTTAGCCCTCTACTTTTCAAGACACCAAGTGAGAGGCCAACCAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATATGTTTCCTCTCACCTGGGTTTTCTTAGCCCTCTACTTTTCAAGACACCAAGTGAGAGGCCAACCAGA  74

Query   75  CCCACCGTGCGGAGGTCGTTTGAATTCCAAAGATGCTGGCTATATCACCTCTCCCGGTTACCCCCAGGACTACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCACCGTGCGGAGGTCGTTTGAATTCCAAAGATGCTGGCTATATCACCTCTCCCGGTTACCCCCAGGACTACC  148

Query  149  CCTCCCACCAGAACTGCGAGTGGATTGTTTACGCCCCCGAACCCAACCAGAAGATTGTCCTCAACTTCAACCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTCCCACCAGAACTGCGAGTGGATTGTTTACGCCCCCGAACCCAACCAGAAGATTGTCCTCAACTTCAACCCT  222

Query  223  CACTTTGAAATCGAGAAGCACGACTGCAAGTATGACTTTATCGAGATTCGGGATGGGGACAGTGAATCCGCAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACTTTGAAATCGAGAAGCACGACTGCAAGTATGACTTTATCGAGATTCGGGATGGGGACAGTGAATCCGCAGA  296

Query  297  CCTCCTGGGCAAACACTGTGGGAACATCGCCCCGCCCACCATCATCTCCTCGGGCTCCATGCTCTACATCAAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTCCTGGGCAAACACTGTGGGAACATCGCCCCGCCCACCATCATCTCCTCGGGCTCCATGCTCTACATCAAGT  370

Query  371  TCACCTCCGACTACGCCCGGCAGGGGGCAGGCTTCTCTCTGCGCTACGAGATCTTCAAGACAGGCTCTGAAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCACCTCCGACTACGCCCGGCAGGGGGCAGGCTTCTCTCTGCGCTACGAGATCTTCAAGACAGGCTCTGAAGAT  444

Query  445  TGCTCAAAAAACTTCACAAGCCCCAACGGGACCATCGAATCTCCTGGGTTTCCTGAGAAGTATCCACACAACTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCTCAAAAAACTTCACAAGCCCCAACGGGACCATCGAATCTCCTGGGTTTCCTGAGAAGTATCCACACAACTT  518

Query  519  GGACTGCACCTTTACCATCCTGGCCAAACCCAAGATGGAGATCATCCTGCAGTTCCTGATCTTTGACCTGGAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGACTGCACCTTTACCATCCTGGCCAAACCCAAGATGGAGATCATCCTGCAGTTCCTGATCTTTGACCTGGAGC  592

Query  593  ATGACCCTTTGCAGGTGGGAGAGGGGGACTGCAAGTACGATTGGCTGGACATCTGGGATGGCATTCCACATGTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGACCCTTTGCAGGTGGGAGAGGGGGACTGCAAGTACGATTGGCTGGACATCTGGGATGGCATTCCACATGTT  666

Query  667  GGCCCCCTGATTGGCAAGTACTGTGGGACCAAAACACCCTCTGAACTTCGTTCATCGACGGGGATCCTCTCCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCCCCCTGATTGGCAAGTACTGTGGGACCAAAACACCCTCTGAACTTCGTTCATCGACGGGGATCCTCTCCCT  740

Query  741  GACCTTTCACACGGACATGGCGGTGGCCAAGGATGGCTTCTCTGCGCGTTACTACCTGGTCCACCAAGAGCCAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GACCTTTCACACGGACATGGCGGTGGCCAAGGATGGCTTCTCTGCGCGTTACTACCTGGTCCACCAAGAGCCAC  814

Query  815  TAGAGAACTTTCAGTGCAATGTTCCTCTGGGCATGGAGTCTGGCCGGATTGCTAATGAACAGATCAGTGCCTCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAGAGAACTTTCAGTGCAATGTTCCTCTGGGCATGGAGTCTGGCCGGATTGCTAATGAACAGATCAGTGCCTCA  888

Query  889  TCTACCTACTCTGATGGGAGGTGGACCCCTCAACAAAGCCGGCTCCATGGTGATGACAATGGCTGGACCCCCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTACCTACTCTGATGGGAGGTGGACCCCTCAACAAAGCCGGCTCCATGGTGATGACAATGGCTGGACCCCCAA  962

Query  963  CTTGGATTCCAACAAGGAGTATCTCCAGGTGGACCTGCGCTTTTTAACCATGCTCACGGCCATCGCAACACAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTGGATTCCAACAAGGAGTATCTCCAGGTGGACCTGCGCTTTTTAACCATGCTCACGGCCATCGCAACACAGG  1036

Query 1037  GAGCGATTTCCAGGGAAACACAGAATGGCTACTATGTCAAATCCTACAAGCTGGAAGTCAGCACTAATGGAGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAGCGATTTCCAGGGAAACACAGAATGGCTACTATGTCAAATCCTACAAGCTGGAAGTCAGCACTAATGGAGAG  1110

Query 1111  GACTGGATGGTGTACCGGCATGGCAAAAACCACAAGGTATTTCAAGCCAACAACGATGCAACTGAGGTGGTTCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACTGGATGGTGTACCGGCATGGCAAAAACCACAAGGTATTTCAAGCCAACAACGATGCAACTGAGGTGGTTCT  1184

Query 1185  GAACAAGCTCCACGCTCCACTGCTGACAAGGTTTGTTAGAATCCGCCCTCAGACCTGGCACTCAGGTATCGCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAACAAGCTCCACGCTCCACTGCTGACAAGGTTTGTTAGAATCCGCCCTCAGACCTGGCACTCAGGTATCGCCC  1258

Query 1259  TCCGGCTGGAGCTCTTCGGCTGCCGGGTCACAGATGCTCCCTGCTCCAACATGCTGGGGATGCTCTCAGGCCTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCGGCTGGAGCTCTTCGGCTGCCGGGTCACAGATGCTCCCTGCTCCAACATGCTGGGGATGCTCTCAGGCCTC  1332

Query 1333  ATTGCAGACTCCCAGATCTCCGCCTCTTCCACCCAGGAATACCTCTGGAGCCCCAGTGCAGCCCGCCTGGTCAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATTGCAGACTCCCAGATCTCCGCCTCTTCCACCCAGGAATACCTCTGGAGCCCCAGTGCAGCCCGCCTGGTCAG  1406

Query 1407  CAGCCGCTCGGGCTGGTTCCCTCGAATCCCTCAGGCCCAGCCCGGTGAGGAGTGGCTTCAGGTAGATCTGGGAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAGCCGCTCGGGCTGGTTCCCTCGAATCCCTCAGGCCCAGCCCGGTGAGGAGTGGCTTCAGGTAGATCTGGGAA  1480

Query 1481  CACCCAAGACAGTGAAAGGTGTCATCATCCAGGGAGCCCGCGGAGGAGACAGTATCACTGCTGTGGAAGCCAGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CACCCAAGACAGTGAAAGGTGTCATCATCCAGGGAGCCCGCGGAGGAGACAGTATCACTGCTGTGGAAGCCAGA  1554

Query 1555  GCATTTGTGCGCAAGTTCAAAGTCTCCTACAGCCTAAACGGCAAGGACTGGGAATACATTCAGGACCCCAGGAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCATTTGTGCGCAAGTTCAAAGTCTCCTACAGCCTAAACGGCAAGGACTGGGAATACATTCAGGACCCCAGGAC  1628

Query 1629  CCAGCAGCCAAA-----GCTGTTC--GAAGGGAACATGCACTATGACACCCCTGACATCCGAAGGTTTGACCCC  1695
            ||||||||||||     |||||||  |.|||                 ||.|||                    
Sbjct 1629  CCAGCAGCCAAAGGTAGGCTGTTCTTGGAGG-----------------CCTCTG--------------------  1665

Query 1696  ATTCCGGCACAGTATGTGCGGGTATACCCGGAGAGGTGGTCGCCGGCGGGGATTGGGATGCGGCTGGAGGTGCT  1769
                                                                                      
Sbjct 1666  --------------------------------------------------------------------------  1665

Query 1770  GGGCTGTGACTGGACAGACTCCAAGCCCACGGTAGAGACGCTGGGACCCACTGTGAAGAGCGAAGAGACAACCA  1843
                                                                                      
Sbjct 1666  --------------------------------------------------------------------------  1665

Query 1844  CCCCCTACCCCACCGAAGAGGAGGCCACAGAGTGTGGGGAGAACTGCAGCTTTGAGGATGACAAAGATTTGCAG  1917
                                                                                      
Sbjct 1666  --------------------------------------------------------------------------  1665

Query 1918  CTCCCTTCGGGATTCAATTGCAACTTCGATTTCCTCGAGGAGCCCTGTGGTTGGATGTATGACCATGCCAAGTG  1991
                                                                                      
Sbjct 1666  --------------------------------------------------------------------------  1665

Query 1992  GCTCCGGACCACCTGGGCCAGCAGCTCCAGCCCAAACGACCGGACGTTTCCAGATGACAGGAATTTCTTGCGGC  2065
                                                                                      
Sbjct 1666  --------------------------------------------------------------------------  1665

Query 2066  TGCAGAGTGACAGCCAGAGAGAGGGCCAGTATGCCCGGCTCATCAGCCCCCCTGTCCACCTGCCCCGAAGCCCG  2139
                                                                                      
Sbjct 1666  --------------------------------------------------------------------------  1665

Query 2140  GTGTGCATGGAGTTCCAGTACCAGGCCACGGGCGGCCGCGGGGTGGCGCTGCAGGTGGTGCGGGAAGCCAGCCA  2213
                                                                                      
Sbjct 1666  --------------------------------------------------------------------------  1665

Query 2214  GGAGAGCAAGTTGCTGTGGGTCATCCGTGAGGACCAGGGCGGCGAGTGGAAGCACGGGCGGATCATCCTGCCCA  2287
                                                                                      
Sbjct 1666  --------------------------------------------------------------------------  1665

Query 2288  GCTACGACATGGAGTACCAGATTGTGTTCGAGGGAGTGATAGGGAAAGGACGTTCCGGAGAGATTGCCATTGAT  2361
                                                                                      
Sbjct 1666  --------------------------------------------------------------------------  1665

Query 2362  GACATTCGGATAAGCACTGATGTCCCACTGGAGAACTGCATGGAACCCATCTCGGCTTTTGCAGTGGACATCCC  2435
                                                                                      
Sbjct 1666  --------------------------------------------------------------------------  1665

Query 2436  AGAAATACATGAGAGAGAAGGATATGAAGATGAAATTGATGATGAATACGAGGTGGACTGGAGCAATTCTTCTT  2509
                                                                                      
Sbjct 1666  --------------------------------------------------------------------------  1665

Query 2510  CTGCAACCTCAGGGTCTGGCGCCCCCTCGACCGACAAAGAAAAGAGCTGGCTGTACACCCTGGATCCCATCCTC  2583
                                                                                      
Sbjct 1666  --------------------------------------------------------------------------  1665

Query 2584  ATCACCATCATCGCCATGAGCTCACTGGGCGTCCTCCTGGGGGCCACCTGTGCAGGCCTCCTGCTCTACTGCAC  2657
                                                                                      
Sbjct 1666  --------------------------------------------------------------------------  1665

Query 2658  CTGTTCCTACTCGGGCCTGAGCTCCCGAAGCTGCACCACACTGGAGAACTACAACTTCGAGCTCTACGATGGCC  2731
                                                                                      
Sbjct 1666  --------------------------------------------------------------------------  1665

Query 2732  TTAAGCACAAGGTCAAGATGAACCACCAAAAGTGCTGCTCCGAGGCA  2778
                                                           
Sbjct 1666  -----------------------------------------------  1665