Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02030
• Subject: NM_001202516.3
• Aligned Length: 1440
• Identities: 1335
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGTCTGCTGAAGTCATCCATCAGGTTGAAGAAGCACTTGATACAGATGAGAAGGAGATGCTGCTCTTTTTGTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGCTGAAGTCATCCATCAGGTTGAAGAAGCACTTGATACAGATGAGAAGGAGATGCTGCTCTTTTTGTG  74

Query   75  CCGGGATGTTGCTATAGATGTGGTTCCACCTAATGTCAGGGACCTTCTGGATATTTTACGGGAAAGAGGTAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGGGATGTTGCTATAGATGTGGTTCCACCTAATGTCAGGGACCTTCTGGATATTTTACGGGAAAGAGGTAAGC  148

Query  149  TGTCTGTCGGGGACTTGGCTGAACTGCTCTACAGAGTGAGGCGATTTGACCTGCTCAAACGTATCTTGAAGATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTCTGTCGGGGACTTGGCTGAACTGCTCTACAGAGTGAGGCGATTTGACCTGCTCAAACGTATCTTGAAGATG  222

Query  223  GACAGAAAAGCTGTGGAGACCCACCTGCTCAGGAACCCTCACCTTGTTTCGGACTATAGAGTGCTGATGGCAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACAGAAAAGCTGTGGAGACCCACCTGCTCAGGAACCCTCACCTTGTTTCGGACTATAGAGTGCTGATGGCAGA  296

Query  297  GATTGGTGAGGATTTGGATAAATCTGATGTGTCCTCATTAATTTTCCTCATGAAGGATTACATGGGCCGAGGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATTGGTGAGGATTTGGATAAATCTGATGTGTCCTCATTAATTTTCCTCATGAAGGATTACATGGGCCGAGGCA  370

Query  371  AGATAAGCAAGGAGAAGAGTTTCTTGGACCTTGTGGTTGAGTTGGAGAAACTAAATCTGGTTGCCCCAGATCAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGATAAGCAAGGAGAAGAGTTTCTTGGACCTTGTGGTTGAGTTGGAGAAACTAAATCTGGTTGCCCCAGATCAA  444

Query  445  CTGGATTTATTAGAAAAATGCCTAAAGAACATCCACAGAATAGACCTGAAGACAAAAATCCAGAAGTACAAGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGATTTATTAGAAAAATGCCTAAAGAACATCCACAGAATAGACCTGAAGACAAAAATCCAGAAGTACAAGCA  518

Query  519  GTCTGTTCAAGGAGCAGGGACAAGTTACAGGAATGTTCTCCAAGCAGCAATCCAAAAGAGTCTCAAGGATCCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTCTGTTCAAGGAGCAGGGACAAGTTACAGGAATGTTCTCCAAGCAGCAATCCAAAAGAGTCTCAAGGATCCTT  592

Query  593  CAAATAACTTCAGGCTCCATAATGGGAGAAGTAAAGAACAAAGACTTAAGGAACAGCTTGGCGCTCAACAAGAA  666
            |||||||||||||                                                             
Sbjct  593  CAAATAACTTCAG-------------------------------------------------------------  605

Query  667  CCAGTGAAGAAATCCATTCAGGAATCAGAAGCTTTTTTGCCTCAGAGCATACCTGAAGAGAGATACAAGATGAA  740
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  606  --------------------------------------------GAGCATACCTGAAGAGAGATACAAGATGAA  635

Query  741  GAGCAAGCCCCTAGGAATCTGCCTGATAATCGATTGCATTGGCAATGAGACAGAGCTTCTTCGAGACACCTTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636  GAGCAAGCCCCTAGGAATCTGCCTGATAATCGATTGCATTGGCAATGAGACAGAGCTTCTTCGAGACACCTTCA  709

Query  815  CTTCCCTGGGCTATGAAGTCCAGAAATTCTTGCATCTCAGTATGCATGGTATATCCCAGATTCTTGGCCAATTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  CTTCCCTGGGCTATGAAGTCCAGAAATTCTTGCATCTCAGTATGCATGGTATATCCCAGATTCTTGGCCAATTT  783

Query  889  GCCTGTATGCCCGAGCACCGAGACTACGACAGCTTTGTGTGTGTCCTGGTGAGCCGAGGAGGCTCCCAGAGTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  784  GCCTGTATGCCCGAGCACCGAGACTACGACAGCTTTGTGTGTGTCCTGGTGAGCCGAGGAGGCTCCCAGAGTGT  857

Query  963  GTATGGTGTGGATCAGACTCACTCAGGGCTCCCCCTGCATCACATCAGGAGGATGTTCATGGGAGATTCATGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  GTATGGTGTGGATCAGACTCACTCAGGGCTCCCCCTGCATCACATCAGGAGGATGTTCATGGGAGATTCATGCC  931

Query 1037  CTTATCTAGCAGGGAAGCCAAAGATGTTTTTTATTCAGAACTATGTGGTGTCAGAGGGCCAGCTGGAGGACAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  CTTATCTAGCAGGGAAGCCAAAGATGTTTTTTATTCAGAACTATGTGGTGTCAGAGGGCCAGCTGGAGGACAGC  1005

Query 1111  AGCCTCTTGGAGGTGGATGGGCCAGCGATGAAGAATGTGGAATTCAAGGCTCAGAAGCGAGGGCTGTGCACAGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  AGCCTCTTGGAGGTGGATGGGCCAGCGATGAAGAATGTGGAATTCAAGGCTCAGAAGCGAGGGCTGTGCACAGT  1079

Query 1185  TCACCGAGAAGCTGACTTCTTCTGGAGCCTGTGTACTGCGGACATGTCCCTGCTGGAGCAGTCTCACAGCTCAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080  TCACCGAGAAGCTGACTTCTTCTGGAGCCTGTGTACTGCGGACATGTCCCTGCTGGAGCAGTCTCACAGCTCAC  1153

Query 1259  CATCCCTGTACCTGCAGTGCCTCTCCCAGAAACTGAGACAAGAAAGAAAACGCCCACTCCTGGATCTTCACATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154  CATCCCTGTACCTGCAGTGCCTCTCCCAGAAACTGAGACAAGAAAGAAAACGCCCACTCCTGGATCTTCACATT  1227

Query 1333  GAACTCAATGGCTACATGTATGATTGGAACAGCAGAGTTTCTGCCAAGGAGAAATATTATGTCTGGCTGCAGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228  GAACTCAATGGCTACATGTATGATTGGAACAGCAGAGTTTCTGCCAAGGAGAAATATTATGTCTGGCTGCAGCA  1301

Query 1407  CACTCTGAGAAAGAAACTTATCCTCTCCTACACA  1440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302  CACTCTGAGAAAGAAACTTATCCTCTCCTACACA  1335