Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02053
Subject:
NM_003939.5
Aligned Length:
605
Identities:
569
Gaps:
36

Alignment

Query   1  MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLADSMPSLRCLYNPGTGALTAFQNSSEREDCNNGEPPRKIIPEKN  74
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Sbjct   1  MDPAEAVLQEKALKFM------------------------------------NSSEREDCNNGEPPRKIIPEKN  38

Query  75  SLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESD  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  39  SLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESD  112

Query 149  QVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 113  QVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDG  186

Query 223  MLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRI  296
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Sbjct 187  MLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRI  260

Query 297  HCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDV  370
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Sbjct 261  HCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDV  334

Query 371  NTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASG  444
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Sbjct 335  NTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASG  408

Query 445  DRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKR  518
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Sbjct 409  DRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKR  482

Query 519  IVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEP  592
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Sbjct 483  IVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEP  556

Query 593  PRSPSRTYTYISR  605
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Sbjct 557  PRSPSRTYTYISR  569