Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02087
• Subject: NM_001244926.1
• Aligned Length: 1566
• Identities: 1563
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGCTTCCTCGCGAGCCTCTTCCACGCAGGCAACCAAAACTAAAGCACCCGACGACTTAGTTGCTCCGGTCGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTCCTCGCGAGCCTCTTCCAC---GGCAACCAAAACTAAAGCACCCGACGACTTAGTTGCTCCGGTCGT  71

Query   75  GAAGAAACCACACATCTATTATGGAAGTTTGGAAGAGAAGGAGAGGGAGCGTCTGGCCAAAGGAGAGTCTGGGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   72  GAAGAAACCACACATCTATTATGGAAGTTTGGAAGAGAAGGAGAGGGAGCGTCTGGCCAAAGGAGAGTCTGGGA  145

Query  149  TTTTGGGGAAAGACGGACTTAAAGCAGGGATCGAAGCTGGAAATATTAATATAACCTCTGGAGAAGTGTTTGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  TTTTGGGGAAAGACGGACTTAAAGCAGGGATCGAAGCTGGAAATATTAATATAACCTCTGGAGAAGTGTTTGAA  219

Query  223  ATTGAAGAGCATATCAGCGAGCGACAGGCAGAAGTATTGGCTGAGTTTGAGAGAAGGAAGCGAGCCCGGCAGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  ATTGAAGAGCATATCAGCGAGCGACAGGCAGAAGTATTGGCTGAGTTTGAGAGAAGGAAGCGAGCCCGGCAGAT  293

Query  297  CAATGTTTCCACAGATGACTCAGAGGTCAAAGCTTGCCTTAGAGCCTTGGGGGAACCCATCACACTTTTTGGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  CAATGTTTCCACAGATGACTCAGAGGTCAAAGCTTGCCTTAGAGCCTTGGGGGAACCCATCACACTTTTTGGAG  367

Query  371  AGGGTCCTGCTGAAAGAAGAGAAAGGTTAAGAAATATCCTCTCAGTTGTCGGTACTGATGCCTTGAAAAAGACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  AGGGTCCTGCTGAAAGAAGAGAAAGGTTAAGAAATATCCTCTCAGTTGTCGGTACTGATGCCTTGAAAAAGACC  441

Query  445  AAAAAGGATGATGAGAAGTCTAAAAAGTCCAAAGAAGAGTATCAGCAAACCTGGTATCATGAAGGACCAAATAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  AAAAAGGATGATGAGAAGTCTAAAAAGTCCAAAGAAGAGTATCAGCAAACCTGGTATCATGAAGGACCAAATAG  515

Query  519  CTTGAAGGTGGCAAGACTATGGATTGCTAATTATTCGTTGCCCAGGGCAATGAAACGCTTGGAAGAGGCCCGAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  CTTGAAGGTGGCAAGACTATGGATTGCTAATTATTCGTTGCCCAGGGCAATGAAACGCTTGGAAGAGGCCCGAC  589

Query  593  TCCATAAGGAGATTCCTGAGACAACAAGGACCTCCCAGATGCAAGAGCTGCACAAGTCTCTCCGGTCTTTGAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  TCCATAAGGAGATTCCTGAGACAACAAGGACCTCCCAGATGCAAGAGCTGCACAAGTCTCTCCGGTCTTTGAAT  663

Query  667  AATTTTTGCAGTCAGATTGGGGATGATCGGCCTATCTCCTACTGTCACTTTAGTCCCAATTCCAAGATGCTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  AATTTTTGCAGTCAGATTGGGGATGATCGGCCTATCTCCTACTGTCACTTTAGTCCCAATTCCAAGATGCTGGC  737

Query  741  CACAGCTTGTTGGAGTGGGCTTTGCAAGCTCTGGTCTGTTCCTGATTGCAACCTCCTTCACACTCTTCGAGGGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  CACAGCTTGTTGGAGTGGGCTTTGCAAGCTCTGGTCTGTTCCTGATTGCAACCTCCTTCACACTCTTCGAGGGC  811

Query  815  ATAACACAAATGTAGGAGCAATTGTATTCCATCCCAAATCCACTGTCTCCTTGGACCCAAAAGATGTCAACCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  ATAACACAAATGTAGGAGCAATTGTATTCCATCCCAAATCCACTGTCTCCTTGGACCCAAAAGATGTCAACCTG  885

Query  889  GCCTCTTGTGCGGCTGATGGCTCTGTGAAGCTTTGGAGTCTCGACAGTGATGAACCAGTGGCAGATATTGAAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  GCCTCTTGTGCGGCTGATGGCTCTGTGAAGCTTTGGAGTCTCGACAGTGATGAACCAGTGGCAGATATTGAAGG  959

Query  963  CCATACAGTGCGTGTGGCGCGGGTAATGTGGCATCCTTCAGGACGTTTCCTGGGCACCACCTGCTATGACCGTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  CCATACAGTGCGTGTGGCGCGGGTAATGTGGCATCCTTCAGGACGTTTCCTGGGCACCACCTGCTATGACCGTT  1033

Query 1037  CATGGCGCTTATGGGATTTGGAGGCTCAAGAGGAGATCCTGCATCAGGAAGGCCATAGCATGGGTGTGTATGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  CATGGCGCTTATGGGATTTGGAGGCTCAAGAGGAGATCCTGCATCAGGAAGGCCATAGCATGGGTGTGTATGAC  1107

Query 1111  ATTGCCTTCCATCAAGATGGCTCTTTGGCTGGCACTGGGGGACTGGATGCATTTGGTCGAGTTTGGGACCTACG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  ATTGCCTTCCATCAAGATGGCTCTTTGGCTGGCACTGGGGGACTGGATGCATTTGGTCGAGTTTGGGACCTACG  1181

Query 1185  CACAGGACGTTGTATCATGTTCTTAGAAGGCCACCTGAAAGAAATCTATGGAATAAATTTCTCCCCCAATGGCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  CACAGGACGTTGTATCATGTTCTTAGAAGGCCACCTGAAAGAAATCTATGGAATAAATTTCTCCCCCAATGGCT  1255

Query 1259  ATCACATTGCAACCGGCAGTGGTGACAACACCTGCAAAGTGTGGGACCTCCGACAGCGGCGTTGCGTCTACACC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  ATCACATTGCAACCGGCAGTGGTGACAACACCTGCAAAGTGTGGGACCTCCGACAGCGGCGTTGCGTCTACACC  1329

Query 1333  ATCCCTGCTCATCAGAACTTAGTGACTGGTGTCAAGTTTGAGCCTATCCATGGGAACTTCTTGCTTACTGGTGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  ATCCCTGCTCATCAGAACTTAGTGACTGGTGTCAAGTTTGAGCCTATCCATGGGAACTTCTTGCTTACTGGTGC  1403

Query 1407  CTATGATAACACAGCCAAGATCTGGACGCACCCAGGCTGGTCCCCGCTGAAGACTCTGGCTGGCCACGAAGGCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  CTATGATAACACAGCCAAGATCTGGACGCACCCAGGCTGGTCCCCGCTGAAGACTCTGGCTGGCCACGAAGGCA  1477

Query 1481  AAGTGATGGGCCTAGATATTTCTTCCGATGGGCAGCTCATAGCCACTTGCTCATATGACAGGACCTTCAAGCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  AAGTGATGGGCCTAGATATTTCTTCCGATGGGCAGCTCATAGCCACTTGCTCATATGACAGGACCTTCAAGCTG  1551

Query 1555  TGGATGGCTGAA  1566
            ||||||||||||
Sbjct 1552  TGGATGGCTGAA  1563