Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02116
• Subject: NM_001261834.1
• Aligned Length: 1926
• Identities: 1893
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ---------------------------------ATGGCAGCTCACCTGGTAAAGCGATGCACGTGCCTCCTGAG  41
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGTCAGCGGTGGTGCTCGCTGCGACATCATGGCAGCTCACCTGGTAAAGCGATGCACGTGCCTCCTGAG  74

Query   42  AGAAGCTGCTCGTCAGGCCCCTGCCATGGCTCCAGTTGGCCGACTGAGACTTGCCTGGGTAGCCCATAAGACTC  115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGAAGCTGCTCGTCAGGCCCCTGCCATGGCTCCAGTTGGCCGACTGAGACTTGCCTGGGTAGCCCATAAGACTC  148

Query  116  TGACTTCCTCAGCCACCTCACCCATTTCCCACCTCCCAGGTTCCTTGATGGAGCCGGTGGAGAAGGAACGAGCA  189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGACTTCCTCAGCCACCTCACCCATTTCCCACCTCCCAGGTTCCTTGATGGAGCCGGTGGAGAAGGAACGAGCA  222

Query  190  TCTACTCCCTACATAGAGAAGCAGGTGGACCACCTCATCAAGAAGGCCACAAGGCCAGAGGAGCTCCTGGAGCT  263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTACTCCCTACATAGAGAAGCAGGTGGACCACCTCATCAAGAAGGCCACAAGGCCAGAGGAGCTCCTGGAGCT  296

Query  264  ACTTGGTGGCAGTCACGACTTGGACAGCAATCAAGCAGCAATGGTACTTATCCGGCTCTCTCACTTGCTGTCTG  337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTTGGTGGCAGTCACGACTTGGACAGCAATCAAGCAGCAATGGTACTTATCCGGCTCTCTCACTTGCTGTCTG  370

Query  338  AGAAGCCAGAAGATAAAGGCTTGCTCATACAGGATGCCCACTTTCATCAACTTCTCTGTCTGCTCAACAGTCAG  411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAGCCAGAAGATAAAGGCTTGCTCATACAGGATGCCCACTTTCATCAACTTCTCTGTCTGCTCAACAGTCAG  444

Query  412  ATTGCCTCGGTCTGGCATGGTACCCTCTCGAAGCTGCTGGGAAGCCTGTATGCTCTGGGCATCCCCAAGGCCTC  485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGCCTCGGTCTGGCATGGTACCCTCTCGAAGCTGCTGGGAAGCCTGTATGCTCTGGGCATCCCCAAGGCCTC  518

Query  486  CAAGGAGCTGCAGTCGGTGGAGCAGGAGGTCCGCTGGCGCATGCGGAAGCTCAAGTACAAGCACCTGGCCTTCC  559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGGAGCTGCAGTCGGTGGAGCAGGAGGTCCGCTGGCGCATGCGGAAGCTCAAGTACAAGCACCTGGCCTTCC  592

Query  560  TGGCAGAGTCCTGTGCCACCCTCTCACAGGAGCAGCACTCGCAGGAGCTGCTGGCTGAGCTGCTCACACACCTG  633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCAGAGTCCTGTGCCACCCTCTCACAGGAGCAGCACTCGCAGGAGCTGCTGGCTGAGCTGCTCACACACCTG  666

Query  634  GAAAGGCGTTGGACAGAAATTGAAGATTCCCACACATTAGTGACCGTCATGATGAAGGTGGGACACCTCTCGGA  707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAAGGCGTTGGACAGAAATTGAAGATTCCCACACATTAGTGACCGTCATGATGAAGGTGGGACACCTCTCGGA  740

Query  708  GCCACTAATGAACCGCCTGGAAGACAAGTGCCTGGAGTTGGTGGAGCACTTTGGCCCCAATGAGCTGCGGAAGG  781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCACTAATGAACCGCCTGGAAGACAAGTGCCTGGAGTTGGTGGAGCACTTTGGCCCCAATGAGCTGCGGAAGG  814

Query  782  TGCTGGTGATGCTGGCAGCTCAGAGCCGGCGGTCCGTGCCCTTGCTGCGGGCCATCTCCTACCACCTGGTGCAG  855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCTGGTGATGCTGGCAGCTCAGAGCCGGCGGTCCGTGCCCTTGCTGCGGGCCATCTCCTACCACCTGGTGCAG  888

Query  856  AAGCCCTTCTCTCTGACGAAAGATGTGCTCTTGGACGTGGCCTATGCCTATGGCAAACTCAGCTTTCACCAGAC  929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGCCCTTCTCTCTGACGAAAGATGTGCTCTTGGACGTGGCCTATGCCTATGGCAAACTCAGCTTTCACCAGAC  962

Query  930  CCAGGTGTCCCAGCGCCTGGCCACCGACCTGCTATCCCTCATGCCCAGCCTGACTTCTGGTGAGGTGGCCCACT  1003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAGGTGTCCCAGCGCCTGGCCACCGACCTGCTATCCCTCATGCCCAGCCTGACTTCTGGTGAGGTGGCCCACT  1036

Query 1004  GTGCCAAGTCCTTCGCCTTACTCAAGTGGCTCAGCCTGCCCCTGTTTGAGGCCTTTGCCCAGCACGTCCTGAAC  1077
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGCCAAGTCCTTCGCCTTACTCAAGTGGCTCAGCCTGCCCCTGTTTGAGGCCTTTGCCCAGCACGTCCTGAAC  1110

Query 1078  AGAGCGCAGGACATCACCCTGCCCCACCTGTGCAGCGTACTTCTGGCTTTTGCGCGTCTGAACTTCCATCCAGA  1151
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGAGCGCAGGACATCACCCTGCCCCACCTGTGCAGCGTACTTCTGGCTTTTGCGCGTCTGAACTTCCATCCAGA  1184

Query 1152  CCAAGAGGATCAGTTCTTCAGCCTGGTACATGAGAAGCTGGGGTCAGAGCTGCCAGGCCTGGAGCCAGCCCTGC  1225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCAAGAGGATCAGTTCTTCAGCCTGGTACATGAGAAGCTGGGGTCAGAGCTGCCAGGCCTGGAGCCAGCCCTGC  1258

Query 1226  AGGTGGACCTGGTGTGGGCCCTGTGTGTGCTGCAGCAGGCACGGGAAGCAGAGCTGCAAGCCGTCCTCCACCCT  1299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGTGGACCTGGTGTGGGCCCTGTGTGTGCTGCAGCAGGCACGGGAAGCAGAGCTGCAAGCCGTCCTCCACCCT  1332

Query 1300  GAATTTCACATCCAATTTCTAGGGGGCAAGTCTCAGAAGGATCAGAACACCTTCCAGAAGCTGCTCCACATCAA  1373
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAATTTCACATCCAATTTCTAGGGGGCAAGTCTCAGAAGGATCAGAACACCTTCCAGAAGCTGCTCCACATCAA  1406

Query 1374  CGCCACTGCCCTGCTGGAGTACCCCGAGTACTCGGGTCCCCTTCTGCCTGCCTCGGCTGTGGCCCCTGGGCCCT  1447
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGCCACTGCCCTGCTGGAGTACCCCGAGTACTCGGGTCCCCTTCTGCCTGCCTCGGCTGTGGCCCCTGGGCCCT  1480

Query 1448  CAGCCCTTGACAGGAAGGTGACCCCCCTGCAAAAGGAGCTGCAGGAGACGCTGAAGGGGCTGCTGGGGAGCGCC  1521
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGCCCTTGACAGGAAGGTGACCCCCCTGCAAAAGGAGCTGCAGGAGACGCTGAAGGGGCTGCTGGGGAGCGCC  1554

Query 1522  GACAAGGGCAGCCTCGAGGTGGCCACGCAGTATGGCTGGGTGCTGGATGCTGAGGTGCTGCTGGACAGTGACGG  1595
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GACAAGGGCAGCCTCGAGGTGGCCACGCAGTATGGCTGGGTGCTGGATGCTGAGGTGCTGCTGGACAGTGACGG  1628

Query 1596  CGAGTTTCTGCCCGTAAGGGACTTTGTGGCACCTCACCTTGCCCAGCCAACTGGGAGCCAGTCACCACCTCCAG  1669
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGAGTTTCTGCCCGTAAGGGACTTTGTGGCACCTCACCTTGCCCAGCCAACTGGGAGCCAGTCACCACCTCCAG  1702

Query 1670  GGTCTAAGAGGCTAGCGTTCTTGCGGTGGGAGTTCCCCAACTTCAACAGCCGAAGCAAGGACTTGCTGGGTCGC  1743
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGTCTAAGAGGCTAGCGTTCTTGCGGTGGGAGTTCCCCAACTTCAACAGCCGAAGCAAGGACTTGCTGGGTCGC  1776

Query 1744  TTTGTTCTGGCCCGGCGACACATAGTGGCTGCAGGCTTCCTGATAGTGGACGTCCCATTCTATGAGTGGCTGGA  1817
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTTGTTCTGGCCCGGCGACACATAGTGGCTGCAGGCTTCCTGATAGTGGACGTCCCATTCTATGAGTGGCTGGA  1850

Query 1818  ACTCAAGTCTGAATGGCAGAAAGGCGCCTACCTCAAGGACAAGATGCGCAAAGCGGTGGCTGAGGAGCTGGCCA  1891
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACTCAAGTCTGAATGGCAGAAAGGCGCCTACCTCAAGGACAAGATGCGCAAAGCGGTGGCTGAGGAGCTGGCCA  1924

Query 1892  AG  1893
            ||
Sbjct 1925  AG  1926