Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02173
• Subject: NM_001286108.1
• Aligned Length: 825
• Identities: 639
• Gaps: 186

Alignment

Query   1  ATGACAGATGACAAAGATGTGCTTCGAGATGTGTGGTTTGGACGAATTCCAACTTGTTTCACGCTATATCAGGA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGACAGATGACAAAGATGTGCTTCGAGATGTGTGGTTTGGACGAATTCCAACTTGTTTCACGCTATATCAGGA  74

Query  75  TGAGATAACTGAAAGGGAAGCAGAACCATACTATTTGCTTTTGCCAAGAGTAAGTTATTTGACGTTGGTAACTG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TGAGATAACTGAAAGGGAAGCAGAACCATACTATTTGCTTTTGCCAAGAGTAAGTTATTTGACGTTGGTAACTG  148

Query 149  ACAAAGTGAAAAAGCACTTTCAGAAGGTTATGAGACAAGAAGACATTAGTGAGATATGGTTTGAATATGAAGGC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACAAAGTGAAAAAGCACTTTCAGAAGGTTATGAGACAAGAAGACATTAGTGAGATATGGTTTGAATATGAAGGC  222

Query 223  ACACCACTGAAATGGCATTATCCAATTGGTTTGCTATTTGATCTTCTTGCATCAAGTTCAGCTCTTCCTTGGAA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ACACCACTGAAATGGCATTATCCAATTGGTTTGCTATTTGATCTTCTTGCATCAAGTTCAGCTCTTCCTTGGAA  296

Query 297  CATCACAGTACATTTTAAGAGTTTTCCAGAAAAAGACCTTCTGCACTGTCCATCTAAGGATGCAATTGAAGCTC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CATCACAGTACATTTTAAGAGTTTTCCAGAAAAAGACCTTCTGCACTGTCCATCTAAGGATGCAATTGAAGCTC  370

Query 371  ATTTTATGTCATGTATGAAAGAAGCTGATGCTTTAAAACATAAAAGTCAAGTAATCAATGAAATGCAGAAAAAA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ATTTTATGTCATGTATGAAAGAAGCTGATGCTTTAAAACATAAAAGTCAAGTAATCAATGAAATGCAGAAAAAA  444

Query 445  GATCACAAGCAACTCTGGATGGGATTGCAAAATGACAGATTTGACCAGTTTTGGGCCATCAATCGGAAACTCAT  518
           |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GATCACAAGCAACTCTGGATGGGATTGCAAAAT----GATTTGACCAGTTTTGGGCCATCAATCGGAAACTCAT  514

Query 519  GGAATATCCTGCAGAAGAAAATGGATTTCGTTATATCCCCTTTAGAATATATCAGACAACGACTGAAAGACCTT  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 515  GGAATATCCTGCAGAAGAAAATGGATTTCGTTATATCCCCTTTAGAATATATCAGACAACGACTGAAAGACCTT  588

Query 593  TCATTCAGAAGCTGTTTCGTCCTGTGGCTGCAGATGGACAGTTGCACACACTAGGAGATCTCCTCAAAGAAGTT  666
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct 589  TCATTCAGAAGCTGTTTCGTCCTGTGGCTGCAGATGGACAGTTGCACACAC-----------------------  639

Query 667  TGTCCTTCTGCTATTGATCCTGAAGATGGGGAAAAAAAGAATCAAGTGATGATTCATGGAATTGAGCCAATGTT  740
                                                                                     
Sbjct 640  --------------------------------------------------------------------------  639

Query 741  GGAAACACCTCTGCAGTGGCTGAGTGAACATCTGAGCTACCCGGATAATTTTCTTCATATTAGTATCATCCCAC  814
                                                                                     
Sbjct 640  --------------------------------------------------------------------------  639

Query 815  AGCCAACAGAT  825
                      
Sbjct 640  -----------  639