Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02202
- Subject:
- NM_001329113.1
- Aligned Length:
- 1252
- Identities:
- 1131
- Gaps:
- 110
Alignment
Query 1 ATGTCCCCAGAAGTGGCCTTGAACCGAATATCTCCAATGCTCTCCCCTTTCATATCTAGCGTGGTCCGGAATGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCCCCAGAAGTGGCCTTGAACCGAATATCTCCAATGCTCTCCCCTTTCATATCTAGCGTGGTCCGGAATGG 74
Query 75 AAAAGTGGGACTGGATGCTACAAACTGTTTGAGGATAACTGACTTAAAATCTGGCTGCACATCATTGACTCCTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAAAGTGGGACTGGATGCTACAAACTGTTTGAGGATAACTGACTTAAAATCTGGCTGCACATCATTGACTCCTG 148
Query 149 GGCCCAACTGTGACCGATTTAAACTGCACATACCATATGCTGGAGAGACATTAAAGTGGGATATCATTTTCAAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGCCCAACTGTGACCGATTTAAACTGCACATACCATATGCTGGAGAGACATTAAAGTGGGATATCATTTTCAAT 222
Query 223 GCCCAATACCCAGAACTGCCTCCCGATTTTATCTTTGGAGAAGATGCTGAATTCCTGCCAGACCCCTCAGCTTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCCCAATACCCAGAACTGCCTCCCGATTTTATCTTTGGAGAAGATGCTGAATTCCTGCCAGACCCCTCAGCTTT 296
Query 297 GCAGAATCTTGCCTCCTGGAATCCTTCAAATCCTGAATGTCTCTTACTTGTGGTGAAGGAACTTGTGCAACAAT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCAGAATCTTGCCTCCTGGAATCCTTCAAATCCTGAATGTCTCTTACTTGTGGTGAAGGAACTTGTGCAACAAT 370
Query 371 ATCACCAATTCCAATGTAGCCGCCTCCGGGAGAGCTCCCGCCTCATGTTTGAATACCAGACATTACTGGAGGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATCACCAATTCCAATGTAGCCGCCTCCGGGAGAGCTCCCGCCTCATGTTTGAATACCAGACATTACTGGAGGAG 444
Query 445 CCACAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGCTGGGAAAAAAAACAACTGGACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCACAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGCTGGGAAAAAAAACAACTGGACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTT 518
Query 519 CCTTTTGAAGCTGCCCGTAGATTTCAGCAATATCCCCACATACCTTCTCAAGGATGTAAATGAAGACCCTGGAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCTTTTGAAGCTGCCCGTAGATTTCAGCAATATCCCCACATACCTTCTCAAGGATGTAAATGAAGACCCTGGAG 592
Query 593 AAGATGTGGCCCTCCTCTCTGTTAGTTTTGAGGACACTGAAGCCACCCAGGTGTACCCCAAGCTGTACTTGTCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGATGTGGCCCTCCTCTCTGTTAGTTTTGAGGACACTGAAGCCACCCAGGTGTACCCCAAGCTGTACTTGTCA 666
Query 667 CCTCGAATTGAGCATGCACTTGGAGGCTCCTCAGCTCTTCATATCCCAGCTTTTCCAGGAGGAGGATGTCTCAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCTCGAATTGAGCATGCACTTGGAGGCTCCTCAGCTCTTCATATCCCAGCTTTTCCAGGAGGAGGATGTCTCAT 740
Query 741 TGATTACGTTCCTCAAGTATGCCACCTGCTCACCAACAAGGTGCAGTACGTGATTCAAGGGTATCACAAAAGAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGATTACGTTCCTCAAGTATGCCACCTGCTCACCAACAAGGTGCAGTACGTGATTCAAGGGTATCACAAAAGAA 814
Query 815 GAGAGTATATTGCTGCTTTTCTCAGTCACTTTGGCACAGGTGTCGTGGAATATGATGCAGAAGGCTTTACAAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GAGAGTATATTGCTGCTTTTCTCAGTCACTTTGGCACAGGTGTCGTGGAATATGATGCAGAAGGCTTTACAAAA 888
Query 889 CTCACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGATTTTTGTTTTCTTGTACACATTGACCTGCCTCTGTTTTTCCCTCGAGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTCACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGATTTTTGTTTTCTTGTACACATTGACCTGCCTCTGTTTTTCCCTCGAGA 962
Query 963 CCAGCCAACTCTCACATTTCAGTCCGTTTATCACTTTACCAACAGTGGACAGCTTTACTCCCAGGCCCAAAAAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCAGCCAACTCTCACATTTCAGTCCGTTTATCACTTTACCAACAGTGGACAGCTTTACTCCCAGGCCCAAAAAA 1036
Query 1037 ATTATCCGTACAGCCCCAGATGGGATGGAAATGAAATGGCCAAAAGAGCAAAGGCTTATTTCAA---------- 1100
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .||..|||
Sbjct 1037 ATTATCCGTACAGCCCCAGATGGGATGGAAATGAAATGGCCAAAAGAGCAAAGG--GATGCCAAGGGAGCAGAG 1108
Query 1101 ---------------------AA-------CCTTTGTCCCTCAGTTCCAGGA---GGCAGC-ATTTG------- 1135
|| |||||| |||||.||..| |||.|| |..||
Sbjct 1109 ATGCCTGCAGCCCGTGGGAGCAAGTCCTGGCCTTTG-----CAGTTGCAAAAACTGGCTGCAAGCTGCTCCAGC 1177
Query 1136 -CCAATGGA-------AAGCTC---------------------------------------------- 1149
|||..||| ||||||
Sbjct 1178 CCCAGAGGAACTGGCCAAGCTCCAGAGGGCCTCCTTGGAGGGCCTCAGAGGGAGAGAGAACTGCTCAG 1245