Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02202
• Subject: NM_001329115.1
• Aligned Length: 1320
• Identities: 1149
• Gaps: 171

Alignment

Query    1  ATGTCCCCAGAAGTGGCCTTGAACCGAATATCTCCAATGCTCTCCCCTTTCATATCTAGCGTGGTCCGGAATGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCCCAGAAGTGGCCTTGAACCGAATATCTCCAATGCTCTCCCCTTTCATATCTAGCGTGGTCCGGAATGG  74

Query   75  AAAAGTGGGACTGGATGCTACAAACTGTTTGAGGATAACTGACTTAAAATCTGGCTGCACATCATTGACTCCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAAAGTGGGACTGGATGCTACAAACTGTTTGAGGATAACTGACTTAAAATCTGGCTGCACATCATTGACTCCTG  148

Query  149  GGCCCAACTGTGACCGATTTAAACTGCACATACCATATGCTGGAGAGACATTAAAGTGGGATATCATTTTCAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCCCAACTGTGACCGATTTAAACTGCACATACCATATGCTGGAGAGACATTAAAGTGGGATATCATTTTCAAT  222

Query  223  GCCCAATACCCAGAACTGCCTCCCGATTTTATCTTTGGAGAAGATGCTGAATTCCTGCCAGACCCCTCAGCTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCCAATACCCAGAACTGCCTCCCGATTTTATCTTTGGAGAAGATGCTGAATTCCTGCCAGACCCCTCAGCTTT  296

Query  297  GCAGAATCTTGCCTCCTGGAATCCTTCAAATCCTGAATGTCTCTTACTTGTGGTGAAGGAACTTGTGCAACAAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGAATCTTGCCTCCTGGAATCCTTCAAATCCTGAATGTCTCTTACTTGTGGTGAAGGAACTTGTGCAACAAT  370

Query  371  ATCACCAATTCCAATGTAGCCGCCTCCGGGAGAGCTCCCGCCTCATGTTTGAATACCAGACATTACTGGAGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCACCAATTCCAATGTAGCCGCCTCCGGGAGAGCTCCCGCCTCATGTTTGAATACCAGACATTACTGGAGGAG  444

Query  445  CCACAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGCTGGGAAAAAAAACAACTGGACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCACAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGCTGGGAAAAAAAACAACTGGACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTT  518

Query  519  CCTTTTGAAGCTGCCCGTAGATTTCAGCAATATCCCCACATACCTTCTCAAGGATGTAAATGAAGACCCTGGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTTTTGAAGCTGCCCGTAGATTTCAGCAATATCCCCACATACCTTCTCAAGGATGTAAATGAAGACCCTGGAG  592

Query  593  AAGATGTGGCCCTCCTCTCTGTTAGTTTTGAGGACACTGAAGCCACCCAGGTGTACCCCAAGCTGTACTTGTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGATGTGGCCCTCCTCTCTGTTAGTTTTGAGGACACTGAAGCCACCCAGGTGTACCCCAAGCTGTACTTGTCA  666

Query  667  CCTCGAATTGAGCATGCACTTGGAGGCTCCTCAGCTCTTCATATCCCAGCTTTTCCAGGAGGAGGATGTCTCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCTCGAATTGAGCATGCACTTGGAGGCTCCTCAGCTCTTCATATCCCAGCTTTTCCAGGAGGAGGATGTCTCAT  740

Query  741  TGATTACGTTCCTCAAGTATGCCACCTGCTCACCAACAAGGTGCAGTACGTGATTCAAGGGTATCACAAAAGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATTACGTTCCTCAAGTATGCCACCTGCTCACCAACAAGGTGCAGTACGTGATTCAAGGGTATCACAAAAGAA  814

Query  815  GAGAGTATATTGCTGCTTTTCTCAGTCACTTTGGCACAGGTGTCGTGGAATATGATGCAGAAGGCTTTACAAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGAGTATATTGCTGCTTTTCTCAGTCACTTTGGCACAGGTGTCGTGGAATATGATGCAGAAGGCTTTACAAAA  888

Query  889  CTCACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGATTTTTGTTTTCTTGTACACATTGACCTGCCTCTGTTTTTCCCTCGAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGATTTTTGTTTTCTTGTACACATTGACCTGCCTCTGTTTTTCCCTCGAGA  962

Query  963  CCAGCCAACTCTCACATTTCAGTCCGTTTATCACTTTACCAACAGTGGACAGCTTTACTCCCAGGCCCAAAAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAGCCAACTCTCACATTTCAGTCCGTTTATCACTTTACCAACAGTGGACAGCTTTACTCCCAGGCCCAAAAAA  1036

Query 1037  ATTATCCGTACAGCCCCAGATGGGATGGAAATGAAATGGCCAAAAGAGCAAA----------------------  1088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct 1037  ATTATCCGTACAGCCCCAGATGGGATGGAAATGAAATGGCCAAAAGAGCAAATGAAATGATAAGCTCCATTGAA  1110

Query 1089  --------------------------------------------------------------------------  1088
                                                                                      
Sbjct 1111  AAGCCTGGCCATCAATTACTGCCAATACAGCCCTCATCCCAGAGGAAGCCACTCACCATCCTCTCAGCCTGTGC  1184

Query 1089  --------------------------------------------------------------------------  1088
                                                                                      
Sbjct 1185  AGACCAGGCTGCACCAGGCACGGAGTGTTTACAGCCCAGCTCAGTCTCCTGGCTCCCCTGGGGGAGGGGCAGCA  1258

Query 1089  -GGCTTATTTCAAAACCTTTGTCCCTCAGTTCCAGGAGGCAGCATTTGCCAATGGAAAGCTC  1149
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGCTTATTTCAAAACCTTTGTCCCTCAGTTCCAGGAGGCAGCATTTGCCAATGGAAAGCTC  1320