Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02202
- Subject:
- NM_144541.1
- Aligned Length:
- 1149
- Identities:
- 1037
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGTCCCCAGAAGTGGCCTTGAACCGAATATCTCCAATGCTCTCCCCTTTCATATCTAGCGTGGTCCGGAATGG 74
|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGTCTCCAGAAATTGCCTTGAACCGAATTTCTCCAATGCTCTCCCCATTCATATCAAGCGTGGTCCGAAATGG 74
Query 75 AAAAGTGGGACTGGATGCTACAAACTGTTTGAGGATAACTGACTTAAAATCTGGCTGCACATCATTGACTCCTG 148
.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAGGTGGGACTGGATGCTACAAACTGTTTGAGAATTACGGACTTGAAGTCTGGCTGTACATCATTGACTCCTG 148
Query 149 GGCCCAACTGTGACCGATTTAAACTGCACATACCATATGCTGGAGAGACATTAAAGTGGGATATCATTTTCAAT 222
|.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 149 GACCCAACTGTGACCGCTTCAAACTGCACATCCCGTACGCTGGGGAGACGTTAAAATGGGACATAATTTTCAAT 222
Query 223 GCCCAATACCCAGAACTGCCTCCCGATTTTATCTTTGGAGAAGATGCTGAATTCCTGCCAGACCCCTCAGCTTT 296
||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||..|
Sbjct 223 GCTCAGTACCCAGAGCTGCCTCCTGATTTCATCTTTGGAGAGGATGCTGAGTTTCTGCCAGACCCCTCTGCGCT 296
Query 297 GCAGAATCTTGCCTCCTGGAATCCTTCAAATCCTGAATGTCTCTTACTTGTGGTGAAGGAACTTGTGCAACAAT 370
|||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 297 GCACAACCTTGCCTCCTGGAACCCTTCAAACCCTGAGTGCCTGTTGCTCGTGGTGAAGGAGCTGGTGCAGCAGT 370
Query 371 ATCACCAATTCCAATGTAGCCGCCTCCGGGAGAGCTCCCGCCTCATGTTTGAATACCAGACATTACTGGAGGAG 444
|.|||||.|||||.||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||..|.|||||.|||
Sbjct 371 ACCACCAGTTCCAGTGCGGCCGCCTCCGTGAGAGCTCGCGCCTCATGTTTGAGTACCAGACGCTCCTGGAAGAG 444
Query 445 CCACAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGCTGGGAAAAAAAACAACTGGACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTT 518
||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCTCAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGCTGGAAAGAAAAACAACTGGACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTT 518
Query 519 CCTTTTGAAGCTGCCCGTAGATTTCAGCAATATCCCCACATACCTTCTCAAGGATGTAAATGAAGACCCTGGAG 592
.||.||||||.|.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCTATTGAAGTTACCAGTAGATTTCAGCAACATTCCCACATACCTTCTCAAGGATGTAAATGAAGACCCTGGAG 592
Query 593 AAGATGTGGCCCTCCTCTCTGTTAGTTTTGAGGACACTGAAGCCACCCAGGTGTACCCCAAGCTGTACTTGTCA 666
|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 593 AAGATGTGGCCCTTCTTTCTGTCAGTTTTGAGGATACTGAAGCTACCCAGGTGTACCCCAAGTTGTACTTGTCA 666
Query 667 CCTCGAATTGAGCATGCACTTGGAGGCTCCTCAGCTCTTCATATCCCAGCTTTTCCAGGAGGAGGATGTCTCAT 740
||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 667 CCCCGAATTGAGCATGCACTCGGAGGCTCCTCTGCTCTTCACATCCCTGCTTTCCCCGGAGGAGGATGTCTCAT 740
Query 741 TGATTACGTTCCTCAAGTATGCCACCTGCTCACCAACAAGGTGCAGTACGTGATTCAAGGGTATCACAAAAGAA 814
||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 741 TGATTATGTGCCTCAAGTGTGCCACCTGCTCACCAACAAGGTACAGTATGTGATTCAAGGCTATCACAAAAGAA 814
Query 815 GAGAGTATATTGCTGCTTTTCTCAGTCACTTTGGCACAGGTGTCGTGGAATATGATGCAGAAGGCTTTACAAAA 888
|||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 815 GAGAGTACATCGCAGCTTTCCTCAGTCACTTTGGCACAGGTGTCGTGGAATATGATGCAGAAGGCTTCACAAAA 888
Query 889 CTCACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGATTTTTGTTTTCTTGTACACATTGACCTGCCTCTGTTTTTCCCTCGAGA 962
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 889 CTTACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGACTTTTGTTTTCTTGTCCACATTGACCTGCCCCTGTTTTTCCCTCGAGA 962
Query 963 CCAGCCAACTCTCACATTTCAGTCCGTTTATCACTTTACCAACAGTGGACAGCTTTACTCCCAGGCCCAAAAAA 1036
.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 963 TCAGCCTACGCTCACATTTCAGTCAGTCTATCACTTTACCAACAGTGGACAGCTTTACTCCCAAGCACAAAAAA 1036
Query 1037 ATTATCCGTACAGCCCCAGATGGGATGGAAATGAAATGGCCAAAAGAGCAAAGGCTTATTTCAAAACCTTTGTC 1110
|.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACTACCCATACAGCCCCAGATGGGATGGAAATGAAATGGCCAAGAGAGCAAAGGCTTATTTCAAAACCTTTGTC 1110
Query 1111 CCTCAGTTCCAGGAGGCAGCATTTGCCAATGGAAAGCTC 1149
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCTCAGTTCCAGGAGGCCGCATTTGCCAATGGAAAGCTC 1149