Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02202
• Subject: NM_181279.1
• Aligned Length: 1265
• Identities: 1032
• Gaps: 121

Alignment

Query    1  ATGTCCCCAGAAGTGGCCTTGAACCGAATATCTCCAATGCTCTCCCCTTTCATATCTAGCGTGGTCCGGAATG-  73
            |||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||| 
Sbjct    1  ATGTCTCCAGAAATTGCCTTGAACCGAATTTCTCCAATGCTCTCCCCATTCATATCAAGCGTGGTCCGAAATGG  74

Query   74  ----------GAAAA---------------------------------------------------GTGGGACT  86
                      |||||                                                   |||.|.||
Sbjct   75  GAAGATCCATGAAAAAGGGCCGTCACAGAAGCTTTCATTCAAGTCCTGCTCTTATCATCTGCCGATGTGTGCCT  148

Query   87  G----------------------GATGCTACA-----------AACTGTTTGAG-------GATAA----CTG-  115
            |                      ||| |||.|           |.|| ||.|||       ||.||    ||| 
Sbjct  149  GTAATGAATGGTATGGTGTGCCAGAT-CTAGAGAAAGCATCGTACCT-TTGGAGAAAGAAAGAAAACCATCTGC  220

Query  116  -ACT--TAAAATCTGG------CTGCACATCATTGACTCCTGGGCCCAACTGTGACCGATTTAAACTGCACATA  180
             |||  .||||   ||      |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct  221  CACTAGAAAAA---GGCCAAAACTGTACATCATTGACTCCTGGACCCAACTGTGACCGCTTCAAACTGCACATC  291

Query  181  CCATATGCTGGAGAGACATTAAAGTGGGATATCATTTTCAATGCCCAATACCCAGAACTGCCTCCCGATTTTAT  254
            ||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  292  CCGTACGCTGGGGAGACGTTAAAATGGGACATAATTTTCAATGCTCAGTACCCAGAGCTGCCTCCTGATTTCAT  365

Query  255  CTTTGGAGAAGATGCTGAATTCCTGCCAGACCCCTCAGCTTTGCAGAATCTTGCCTCCTGGAATCCTTCAAATC  328
            |||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||..||||.||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  366  CTTTGGAGAGGATGCTGAGTTTCTGCCAGACCCCTCTGCGCTGCACAACCTTGCCTCCTGGAACCCTTCAAACC  439

Query  329  CTGAATGTCTCTTACTTGTGGTGAAGGAACTTGTGCAACAATATCACCAATTCCAATGTAGCCGCCTCCGGGAG  402
            ||||.||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||.||..||||||||||.|||
Sbjct  440  CTGAGTGCCTGTTGCTCGTGGTGAAGGAGCTGGTGCAGCAGTACCACCAGTTCCAGTGCGGCCGCCTCCGTGAG  513

Query  403  AGCTCCCGCCTCATGTTTGAATACCAGACATTACTGGAGGAGCCACAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGC  476
            |||||.||||||||||||||.||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  AGCTCGCGCCTCATGTTTGAGTACCAGACGCTCCTGGAAGAGCCTCAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGC  587

Query  477  TGGGAAAAAAAACAACTGGACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTTCCTTTTGAAGCTGCCCGTAGATTTCAGCAATA  550
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|.||.||||||||||||||.|
Sbjct  588  TGGAAAGAAAAACAACTGGACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTTTCTATTGAAGTTACCAGTAGATTTCAGCAACA  661

Query  551  TCCCCACATACCTTCTCAAGGATGTAAATGAAGACCCTGGAGAAGATGTGGCCCTCCTCTCTGTTAGTTTTGAG  624
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  662  TTCCCACATACCTTCTCAAGGATGTAAATGAAGACCCTGGAGAAGATGTGGCCCTTCTTTCTGTCAGTTTTGAG  735

Query  625  GACACTGAAGCCACCCAGGTGTACCCCAAGCTGTACTTGTCACCTCGAATTGAGCATGCACTTGGAGGCTCCTC  698
            ||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  736  GATACTGAAGCTACCCAGGTGTACCCCAAGTTGTACTTGTCACCCCGAATTGAGCATGCACTCGGAGGCTCCTC  809

Query  699  AGCTCTTCATATCCCAGCTTTTCCAGGAGGAGGATGTCTCATTGATTACGTTCCTCAAGTATGCCACCTGCTCA  772
            .||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  810  TGCTCTTCACATCCCTGCTTTCCCCGGAGGAGGATGTCTCATTGATTATGTGCCTCAAGTGTGCCACCTGCTCA  883

Query  773  CCAACAAGGTGCAGTACGTGATTCAAGGGTATCACAAAAGAAGAGAGTATATTGCTGCTTTTCTCAGTCACTTT  846
            ||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  884  CCAACAAGGTACAGTATGTGATTCAAGGCTATCACAAAAGAAGAGAGTACATCGCAGCTTTCCTCAGTCACTTT  957

Query  847  GGCACAGGTGTCGTGGAATATGATGCAGAAGGCTTTACAAAACTCACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGATTTTTG  920
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  958  GGCACAGGTGTCGTGGAATATGATGCAGAAGGCTTCACAAAACTTACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGACTTTTG  1031

Query  921  TTTTCTTGTACACATTGACCTGCCTCTGTTTTTCCCTCGAGACCAGCCAACTCTCACATTTCAGTCCGTTTATC  994
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1032  TTTTCTTGTCCACATTGACCTGCCCCTGTTTTTCCCTCGAGATCAGCCTACGCTCACATTTCAGTCAGTCTATC  1105

Query  995  ACTTTACCAACAGTGGACAGCTTTACTCCCAGGCCCAAAAAAATTATCCGTACAGCCCCAGATGGGATGGAAAT  1068
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  ACTTTACCAACAGTGGACAGCTTTACTCCCAAGCACAAAAAAACTACCCATACAGCCCCAGATGGGATGGAAAT  1179

Query 1069  GAAATGGCCAAAAGAGCAAAGGCTTATTTCAAAACCTTTGTCCCTCAGTTCCAGGAGGCAGCATTTGCCAATGG  1142
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1180  GAAATGGCCAAGAGAGCAAAGGCTTATTTCAAAACCTTTGTCCCTCAGTTCCAGGAGGCCGCATTTGCCAATGG  1253

Query 1143  AAAGCTC  1149
            |||||||
Sbjct 1254  AAAGCTC  1260