Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02202
- Subject:
- NM_181280.1
- Aligned Length:
- 1172
- Identities:
- 986
- Gaps:
- 73
Alignment
Query 1 ATGTCCCCAGAAGTGGCCT----TGAACCGAATATCTCCAATGCTCTCCCCTTTCATATCTAGCGTGGTCCGGA 70
|||| || |||| |||| |...|||.|.|.| ||.||||||.|
Sbjct 1 ATGT--------GT-GCCTGTAATGAA---------TGGTATGGTGTGC-----CAGATCTAGAG--------- 42
Query 71 ATGGAAAAG--TGGGAC---TGGATGCTACAAACTGTTTGAGGATAA----CTG--ACT--TAAAATCTGG--- 128
|||| |.|.|| |||| |..|.||| ||.|| ||| ||| .|||| ||
Sbjct 43 -----AAAGCATCGTACCTTTGGA-GAAAGAAA---------GAAAACCATCTGCCACTAGAAAAA---GGCCA 98
Query 129 ---CTGCACATCATTGACTCCTGGGCCCAACTGTGACCGATTTAAACTGCACATACCATATGCTGGAGAGACAT 199
|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 99 AAACTGTACATCATTGACTCCTGGACCCAACTGTGACCGCTTCAAACTGCACATCCCGTACGCTGGGGAGACGT 172
Query 200 TAAAGTGGGATATCATTTTCAATGCCCAATACCCAGAACTGCCTCCCGATTTTATCTTTGGAGAAGATGCTGAA 273
||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 173 TAAAATGGGACATAATTTTCAATGCTCAGTACCCAGAGCTGCCTCCTGATTTCATCTTTGGAGAGGATGCTGAG 246
Query 274 TTCCTGCCAGACCCCTCAGCTTTGCAGAATCTTGCCTCCTGGAATCCTTCAAATCCTGAATGTCTCTTACTTGT 347
||.||||||||||||||.||..||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.||.||
Sbjct 247 TTTCTGCCAGACCCCTCTGCGCTGCACAACCTTGCCTCCTGGAACCCTTCAAACCCTGAGTGCCTGTTGCTCGT 320
Query 348 GGTGAAGGAACTTGTGCAACAATATCACCAATTCCAATGTAGCCGCCTCCGGGAGAGCTCCCGCCTCATGTTTG 421
|||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||.||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 321 GGTGAAGGAGCTGGTGCAGCAGTACCACCAGTTCCAGTGCGGCCGCCTCCGTGAGAGCTCGCGCCTCATGTTTG 394
Query 422 AATACCAGACATTACTGGAGGAGCCACAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGCTGGGAAAAAAAACAACTGG 495
|.||||||||..|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 395 AGTACCAGACGCTCCTGGAAGAGCCTCAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGCTGGAAAGAAAAACAACTGG 468
Query 496 ACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTTCCTTTTGAAGCTGCCCGTAGATTTCAGCAATATCCCCACATACCTTCTCAA 569
|||||||||||||||||||||||.||.||||||.|.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 469 ACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTTTCTATTGAAGTTACCAGTAGATTTCAGCAACATTCCCACATACCTTCTCAA 542
Query 570 GGATGTAAATGAAGACCCTGGAGAAGATGTGGCCCTCCTCTCTGTTAGTTTTGAGGACACTGAAGCCACCCAGG 643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 543 GGATGTAAATGAAGACCCTGGAGAAGATGTGGCCCTTCTTTCTGTCAGTTTTGAGGATACTGAAGCTACCCAGG 616
Query 644 TGTACCCCAAGCTGTACTTGTCACCTCGAATTGAGCATGCACTTGGAGGCTCCTCAGCTCTTCATATCCCAGCT 717
|||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 617 TGTACCCCAAGTTGTACTTGTCACCCCGAATTGAGCATGCACTCGGAGGCTCCTCTGCTCTTCACATCCCTGCT 690
Query 718 TTTCCAGGAGGAGGATGTCTCATTGATTACGTTCCTCAAGTATGCCACCTGCTCACCAACAAGGTGCAGTACGT 791
||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 691 TTCCCCGGAGGAGGATGTCTCATTGATTATGTGCCTCAAGTGTGCCACCTGCTCACCAACAAGGTACAGTATGT 764
Query 792 GATTCAAGGGTATCACAAAAGAAGAGAGTATATTGCTGCTTTTCTCAGTCACTTTGGCACAGGTGTCGTGGAAT 865
|||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 765 GATTCAAGGCTATCACAAAAGAAGAGAGTACATCGCAGCTTTCCTCAGTCACTTTGGCACAGGTGTCGTGGAAT 838
Query 866 ATGATGCAGAAGGCTTTACAAAACTCACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGATTTTTGTTTTCTTGTACACATTGAC 939
||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 839 ATGATGCAGAAGGCTTCACAAAACTTACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGACTTTTGTTTTCTTGTCCACATTGAC 912
Query 940 CTGCCTCTGTTTTTCCCTCGAGACCAGCCAACTCTCACATTTCAGTCCGTTTATCACTTTACCAACAGTGGACA 1013
|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 913 CTGCCCCTGTTTTTCCCTCGAGATCAGCCTACGCTCACATTTCAGTCAGTCTATCACTTTACCAACAGTGGACA 986
Query 1014 GCTTTACTCCCAGGCCCAAAAAAATTATCCGTACAGCCCCAGATGGGATGGAAATGAAATGGCCAAAAGAGCAA 1087
||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 987 GCTTTACTCCCAAGCACAAAAAAACTACCCATACAGCCCCAGATGGGATGGAAATGAAATGGCCAAGAGAGCAA 1060
Query 1088 AGGCTTATTTCAAAACCTTTGTCCCTCAGTTCCAGGAGGCAGCATTTGCCAATGGAAAGCTC 1149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1061 AGGCTTATTTCAAAACCTTTGTCCCTCAGTTCCAGGAGGCCGCATTTGCCAATGGAAAGCTC 1122