Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02202
• Subject: XM_011240687.3
• Aligned Length: 1149
• Identities: 869
• Gaps: 195

Alignment

Query    1  ATGTCCCCAGAAGTGGCCTTGAACCGAATATCTCCAATGCTCTCCCCTTTCATATCTAGCGTGGTCCGGAATGG  74
            |||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGTCTCCAGAAATTGCCTTGAACCGAATTTCTCCAATGCTCTCCCCATTCATATCAAGCGTGGTCCGAAATGG  74

Query   75  AAAAGTGGGACTGGATGCTACAAACTGTTTGAGGATAACTGACTTAAAATCTGGCTGCACATCATTGACTCCTG  148
            .||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGGTGGGACTGGATGCTACAAACTGTTTGAGAATTACGGACTTGAAGTCTGGCTGTACATCATTGACTCCTG  148

Query  149  GGCCCAACTGTGACCGATTTAAACTGCACATACCATATGCTGGAGAGACATTAAAGTGGGATATCATTTTCAAT  222
            |.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct  149  GACCCAACTGTGACCGCTTCAAACTGCACATCCCGTACGCTGGGGAGACGTTAAAATGGGACATAATTTTCAAT  222

Query  223  GCCCAATACCCAGAACTGCCTCCCGATTTTATCTTTGGAGAAGATGCTGAATTCCTGCCAGACCCCTCAGCTTT  296
            ||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||..|
Sbjct  223  GCTCAGTACCCAGAGCTGCCTCCTGATTTCATCTTTGGAGAGGATGCTGAGTTTCTGCCAGACCCCTCTGCGCT  296

Query  297  GCAGAATCTTGCCTCCTGGAATCCTTCAAATCCTGAATGTCTCTTACTTGTGGTGAAGGAACTTGTGCAACAAT  370
            |||                                                                       
Sbjct  297  GCA-----------------------------------------------------------------------  299

Query  371  ATCACCAATTCCAATGTAGCCGCCTCCGGGAGAGCTCCCGCCTCATGTTTGAATACCAGACATTACTGGAGGAG  444
                                                                                      
Sbjct  300  --------------------------------------------------------------------------  299

Query  445  CCACAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGCTGGGAAAAAAAACAACTGGACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTT  518
                                                              .|||||||||||||||||||||||
Sbjct  300  --------------------------------------------------CACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTT  323

Query  519  CCTTTTGAAGCTGCCCGTAGATTTCAGCAATATCCCCACATACCTTCTCAAGGATGTAAATGAAGACCCTGGAG  592
            .||.||||||.|.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  324  TCTATTGAAGTTACCAGTAGATTTCAGCAACATTCCCACATACCTTCTCAAGGATGTAAATGAAGACCCTGGAG  397

Query  593  AAGATGTGGCCCTCCTCTCTGTTAGTTTTGAGGACACTGAAGCCACCCAGGTGTACCCCAAGCTGTACTTGTCA  666
            |||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  398  AAGATGTGGCCCTTCTTTCTGTCAGTTTTGAGGATACTGAAGCTACCCAGGTGTACCCCAAGTTGTACTTGTCA  471

Query  667  CCTCGAATTGAGCATGCACTTGGAGGCTCCTCAGCTCTTCATATCCCAGCTTTTCCAGGAGGAGGATGTCTCAT  740
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  472  CCCCGAATTGAGCATGCACTCGGAGGCTCCTCTGCTCTTCACATCCCTGCTTTCCCCGGAGGAGGATGTCTCAT  545

Query  741  TGATTACGTTCCTCAAGTATGCCACCTGCTCACCAACAAGGTGCAGTACGTGATTCAAGGGTATCACAAAAGAA  814
            ||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  546  TGATTATGTGCCTCAAGTGTGCCACCTGCTCACCAACAAGGTACAGTATGTGATTCAAGGCTATCACAAAAGAA  619

Query  815  GAGAGTATATTGCTGCTTTTCTCAGTCACTTTGGCACAGGTGTCGTGGAATATGATGCAGAAGGCTTTACAAAA  888
            |||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  620  GAGAGTACATCGCAGCTTTCCTCAGTCACTTTGGCACAGGTGTCGTGGAATATGATGCAGAAGGCTTCACAAAA  693

Query  889  CTCACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGATTTTTGTTTTCTTGTACACATTGACCTGCCTCTGTTTTTCCCTCGAGA  962
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  694  CTTACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGACTTTTGTTTTCTTGTCCACATTGACCTGCCCCTGTTTTTCCCTCGAGA  767

Query  963  CCAGCCAACTCTCACATTTCAGTCCGTTTATCACTTTACCAACAGTGGACAGCTTTACTCCCAGGCCCAAAAAA  1036
            .|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  768  TCAGCCTACGCTCACATTTCAGTCAGTCTATCACTTTACCAACAGTGGACAGCTTTACTCCCAAGCACAAAAAA  841

Query 1037  ATTATCCGTACAGCCCCAGATGGGATGGAAATGAAATGGCCAAAAGAGCAAAGGCTTATTTCAAAACCTTTGTC  1110
            |.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  842  ACTACCCATACAGCCCCAGATGGGATGGAAATGAAATGGCCAAGAGAGCAAAGGCTTATTTCAAAACCTTTGTC  915

Query 1111  CCTCAGTTCCAGGAGGCAGCATTTGCCAATGGAAAGCTC  1149
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  916  CCTCAGTTCCAGGAGGCCGCATTTGCCAATGGAAAGCTC  954