Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02248
- Subject:
- NM_001207033.1
- Aligned Length:
- 3003
- Identities:
- 3000
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGTCTGGGCCAGGCAACAAACGCGCCGCCGGCGACGGGGGCTCAGGGCCCCCGGAAAAGAAGCTGAGTCGTGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTGGGCCAGGCAACAAACGCGCCGCCGGCGACGGGGGCTCAGGGCCCCCGGAAAAGAAGCTGAGTCGTGA 74
Query 75 GGAGAAGACCACCACGACTCTTATCGAGCCCATTCGTCTTGGAGGCATCTCTTCCACGGAGGAGATGGACCTGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAGAAGACCACCACGACTCTTATCGAGCCCATTCGTCTTGGAGGCATCTCTTCCACGGAGGAGATGGACCTGA 148
Query 149 AGGTACTACAGTTCAAGAACAAGAAACTGGCAGAGCGGCTGGAACAACGGCAGGCTTGTGAAGATGAACTCCGA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGTACTACAGTTCAAGAACAAGAAACTGGCAGAGCGGCTGGAACAACGGCAGGCTTGTGAAGATGAACTCCGA 222
Query 223 GAACGAATTGAGAAGTTGGAGAAGCGGCAGGCCACAGATGATGCCACACTCCTCATCGTCAATCGCTACTGGGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAACGAATTGAGAAGTTGGAGAAGCGGCAGGCCACAGATGATGCCACACTCCTCATCGTCAATCGCTACTGGGC 296
Query 297 CCAGCTGGATGAAACTGTGGAAGCCCTTCTCCGATGCCATGAGAGCCAGGGGGAGCTGTCTTCAGCGCCTGAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAGCTGGATGAAACTGTGGAAGCCCTTCTCCGATGCCATGAGAGCCAGGGGGAGCTGTCTTCAGCGCCTGAGG 370
Query 371 CACCTGGGACCCAGGAGGGGCCAACATGTGATGGGACTCCTCTCCCAGAGCCGGGGACATCAGAGCTGAGAGAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CACCTGGGACCCAGGAGGGGCCAACATGTGATGGGACTCCTCTCCCAGAGCCGGGGACATCAGAGCTGAGAGAC 444
Query 445 CCCTTGCTGATGCAGCTGCGGCCCCCTCTCAGTGAGCCGGCCTTGGCTTTTGTGGTGGCACTGGGTGCCAGCAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCCTTGCTGATGCAGCTGCGGCCCCCTCTCAGTGAGCCGGCCTTGGCTTTTGTGGTGGCACTGGGTGCCAGCAG 518
Query 519 CAGTGAGGAGGTGGAGCTGGAGCTGCAAGGCCGAATGGAGTTCTCCAAGGCAGCTGTGTCTCGTGTGGTAGAGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGTGAGGAGGTGGAGCTGGAGCTGCAAGGCCGAATGGAGTTCTCCAAGGCAGCTGTGTCTCGTGTGGTAGAGG 592
Query 593 CCTCAGACCGCCTACAGCGCCGGGTGGAGGAACTCTGTCAGCGAGTGTACAGCCGAGGGGACAGTGAGCCCCTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCTCAGACCGCCTACAGCGCCGGGTGGAGGAACTCTGTCAGCGAGTGTACAGCCGAGGGGACAGTGAGCCCCTC 666
Query 667 AGTGAGGCGGCTCAGGCACACACCCGAGAGCTGGGCCGTGAGAACCGGCGACTGCAGGACTTGGCCACTCAGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGTGAGGCGGCTCAGGCACACACCCGAGAGCTGGGCCGTGAGAACCGGCGACTGCAGGACTTGGCCACTCAGCT 740
Query 741 GCAGGAGAAACACCACCGCATCTCATTGGAGTACTCCGAGCTCCAGGATAAAGTGACATCGGCAGAGACCAAGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCAGGAGAAACACCACCGCATCTCATTGGAGTACTCCGAGCTCCAGGATAAAGTGACATCGGCAGAGACCAAGG 814
Query 815 TGCTGGAGATGGAGACAACAGTGGAGGACTTGCAGTGGGACATCGAGAAGCTGCGGAAGCGAGAGCAAAAGCTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCTGGAGATGGAGACAACAGTGGAGGACTTGCAGTGGGACATCGAGAAGCTGCGGAAGCGAGAGCAAAAGCTC 888
Query 889 AATAAGCACCTGGCAGAGGCCTTAGAGCAGCTTAACTCTGGCTACTATGTATCTGGGAGCTCCTCAGGCTTCCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AATAAGCACCTGGCAGAGGCCTTAGAGCAGCTTAACTCTGGCTACTATGTATCTGGGAGCTCCTCAGGCTTCCA 962
Query 963 GGGGGGCCAGATCACACTCAGCATGCAGAAGTTTGAGATGCTGAATGCAGAGTTAGAGGAAAACCAGGAACTGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGGGGGCCAGATCACACTCAGCATGCAGAAGTTTGAGATGCTGAATGCAGAGTTAGAGGAAAACCAGGAACTGG 1036
Query 1037 CCAACAGCCGTATGGCAGAGCTGGAGAAACTGCAGGCCGAACTTCAGGGGGCTGTGCGGACCAATGAGCGCCTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCAACAGCCGTATGGCAGAGCTGGAGAAACTGCAGGCCGAACTTCAGGGGGCTGTGCGGACCAATGAGCGCCTC 1110
Query 1111 AAGGTGGCCCTGCGGAGCCTTCCTGAGGAGGTAGTGCGGGAGACGGGGGAGTACCGCATGCTGCAGGCCCAATT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGGTGGCCCTGCGGAGCCTTCCTGAGGAGGTAGTGCGGGAGACGGGGGAGTACCGCATGCTGCAGGCCCAATT 1184
Query 1185 CTCACTGCTCTACAACGAGTCTCTGCAAGTGAAGACCCAGCTAGACGAGGCTCGGGGCCTGCTGCTGGCCACAA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTCACTGCTCTACAACGAGTCTCTGCAAGTGAAGACCCAGCTAGACGAGGCTCGGGGCCTGCTGCTGGCCACAA 1258
Query 1259 AGAACTCCCACCTGCGACACATCGAGCACATGGAGAGCGACGAGCTGGGGCTGCAGAAGAAGCTACGCACAGAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGAACTCCCACCTGCGACACATCGAGCACATGGAGAGCGACGAGCTGGGGCTGCAGAAGAAGCTACGCACAGAG 1332
Query 1333 GTCATTCAGCTGGAGGACACGCTGGCCCAGGTACGCAAGGAGTATGAGATGCTGCGCATCGAGTTTGAGCAGAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTCATTCAGCTGGAGGACACGCTGGCCCAGGTACGCAAGGAGTATGAGATGCTGCGCATCGAGTTTGAGCAGAA 1406
Query 1407 TCTGGCGGCCAACGAGCAGGCGGGGCCCATCAACCGTGAGATGCGCCACCTGATTAGTAGTCTTCAAAACCACA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCTGGCGGCCAACGAGCAGGCGGGGCCCATCAACCGTGAGATGCGCCACCTGATTAGTAGTCTTCAAAACCACA 1480
Query 1481 ACCACCAGCTAAAAGGGGACGCCCAGCGATACAAGCGGAAGCTTCGAGAAGTACAAGCTGAGATTGGCAAGCTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ACCACCAGCTAAAAGGGGACGCCCAGCGATACAAGCGGAAGCTTCGAGAAGTACAAGCTGAGATTGGCAAGCTC 1554
Query 1555 CGGGCCCAGGCCAGTGGCTCTGCCCACTCCACCCCCAACCTGGGCCACCCAGAGGATTCTGGCGTCAGTGCCCC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CGGGCCCAGGCCAGTGGCTCTGCCCACTCCACCCCCAACCTGGGCCACCCAGAGGATTCTGGCGTCAGTGCCCC 1628
Query 1629 AGCCCCAGGGAAAGAGGAGGGTGGGCCAGGCCCTGTCAGTACCCCCGACAACAGAAAGGAGATGGCTCCAGTGC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGCCCCAGGGAAAGAGGAGGGTGGGCCAGGCCCTGTCAGTACCCCCGACAACAGAAAGGAGATGGCTCCAGTGC 1702
Query 1703 CTGGCACCACCACTACTACCACTTCAGTGAAGAAGGAGGAGCTGGTCCCCTCTGAAGAGGACTTCCAGGGTATA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CTGGCACCACCACTACTACCACTTCAGTGAAGAAGGAGGAGCTGGTCCCCTCTGAAGAGGACTTCCAGGGTATA 1776
Query 1777 ACCCCTGGGGCCCAGGGCCCTTCCTCCCGGGGCCGAGAACCTGAGGCCAGGCCCAAGCGGGAGCTTCGGGAACG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ACCCCTGGGGCCCAGGGCCCTTCCTCCCGGGGCCGAGAACCTGAGGCCAGGCCCAAGCGGGAGCTTCGGGAACG 1850
Query 1851 GGAAGGTCCCAGCCTAGGACCTCCACCTGTAGCCTCCGCTCTCTCAAGGGCTGATCGGGAGAAGGCCAAGGTGG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGAAGGTCCCAGCCTAGGACCTCCACCTGTAGCCTCCGCTCTCTCAAGGGCTGATCGGGAGAAGGCCAAGGTGG 1924
Query 1925 AAGAAACCAAGCGGAAGGAATCAGAACTCCTCAAGGGTCTCCGAGCAGAGCTCAAGAAGGCCCAGGAGAGCCAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AAGAAACCAAGCGGAAGGAATCAGAACTCCTCAAGGGTCTCCGAGCAGAGCTCAAGAAGGCCCAGGAGAGCCAG 1998
Query 1999 AAGGAGATGAAACTGCTGCTGGATATGTACAAGTCAGCGCCCAAGGAGCAGCGGGATAAGGTGCAGCTCATGGC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AAGGAGATGAAACTGCTGCTGGATATGTACAAGTCAGCGCCCAAGGAGCAGCGGGATAAGGTGCAGCTCATGGC 2072
Query 2073 AGCGGAACGCAAGGCTAAGGCCGAGGTTGATGAGCTGCGGAGCCGCATCCGGGAATTGGAGGAGAGGGATCGAA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGCGGAACGCAAGGCTAAGGCCGAGGTTGATGAGCTGCGGAGCCGCATCCGGGAATTGGAGGAGAGGGATCGAA 2146
Query 2147 GGGAGAGCAAGAAGATCGCGGATGAGGATGCCCTGCGGCGCATTCGGCAGGCAGAGGAGCAGATAGAACACCTG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GGGAGAGCAAGAAGATCGCGGATGAGGATGCCCTGCGGCGCATTCGGCAGGCAGAGGAGCAGATAGAACACCTG 2220
Query 2221 CAGCGCAAGCTGGGTGCCACCAAGCAGGAGGAGGAGGCTCTGCTCTCAGAGATGGATGTGACAGGTCAGGCTTT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CAGCGCAAGCTGGGTGCCACCAAGCAGGAGGAGGAGGCTCTGCTCTCAGAGATGGATGTGACAGGTCAGGCTTT 2294
Query 2295 TGAGGACATGCAGGAACAGAACGGGCGGCTGCTACAGCAGTTGCGGGAAAAGGATGATGCCAACTTTAAGCTAA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TGAGGACATGCAGGAACAGAACGGGCGGCTGCTACAGCAGTTGCGGGAAAAGGATGATGCCAACTTTAAGCTAA 2368
Query 2369 TGTCAGAGCGGATCAAGGCCAACCAGATTCACAAGCTGCTGCGGGAGGAGAAGGATGAGTTGGGCGAGCAGGTC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGTCAGAGCGGATCAAGGCCAACCAGATTCACAAGCTGCTGCGGGAGGAGAAGGATGAGTTGGGCGAGCAGGTC 2442
Query 2443 CTTGGCCTCAAGTCCCAGGTGGATGCCCAGCTGCTGACTGTGCAGAAGCTGGAGGAGAAGGAGCGAGCCTTGCA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CTTGGCCTCAAGTCCCAGGTGGATGCCCAGCTGCTGACTGTGCAGAAGCTGGAGGAGAAGGAGCGAGCCTTGCA 2516
Query 2517 GGGCAGCCTCGGGGGTGTGGAGAAGGAGCTGACGCTGCGCAGCCAAGCCCTGGAGCTCAACAAGCGGAAGGCTG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GGGCAGCCTCGGGGGTGTGGAGAAGGAGCTGACGCTGCGCAGCCAAGCCCTGGAGCTCAACAAGCGGAAGGCTG 2590
Query 2591 TAGAAGCCGCCCAGCTGGCCGAGGACCTGAAGGTGCAGCTGGAGCACGTGCAGACTCGGCTGCGGGAGATCCAG 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TAGAAGCCGCCCAGCTGGCCGAGGACCTGAAGGTGCAGCTGGAGCACGTGCAGACTCGGCTGCGGGAGATCCAG 2664
Query 2665 CCCTGCCTGGCAGAGAGCCGGGCTGCTCGTGAGAAAGAGAGCTTCAACCTCAAGAGGGCTCAGGAGGACATCTC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2665 CCCTGCCTGGCAGAGAGCCGGGCTGCTCGTGAGAAAGAGAGCTTCAACCTCAAGAGGGCTC---AGGACATCTC 2735
Query 2739 ACGGCTGCGGCGCAAGCTGGAAAAGCAGAGGAAGGTGGAGGTCTACGCAGATGCCGACGAAATCCTCCAGGAGG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736 ACGGCTGCGGCGCAAGCTGGAAAAGCAGAGGAAGGTGGAGGTCTACGCAGATGCCGACGAAATCCTCCAGGAGG 2809
Query 2813 AGATCAAGGAGTACAAGGCGCGGTTGACCTGCCCCTGCTGTAACACCCGCAAGAAGGATGCAGTCCTTACCAAG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810 AGATCAAGGAGTACAAGGCGCGGTTGACCTGCCCCTGCTGTAACACCCGCAAGAAGGATGCAGTCCTTACCAAG 2883
Query 2887 TGCTTCCACGTTTTCTGCTTCGAGTGCGTGCGGGGCCGCTATGAGGCCCGCCAGAGGAAGTGCCCCAAGTGCAA 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2884 TGCTTCCACGTTTTCTGCTTCGAGTGCGTGCGGGGCCGCTATGAGGCCCGCCAGAGGAAGTGCCCCAAGTGCAA 2957
Query 2961 CGCGGCCTTTGGTGCCCACGACTTCCATCGTATCTACATCAGC 3003
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2958 CGCGGCCTTTGGTGCCCACGACTTCCATCGTATCTACATCAGC 3000