Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02248
Subject:
NM_001207034.1
Aligned Length:
1001
Identities:
901
Gaps:
100

Alignment

Query    1  MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKLAERLEQRQACEDELR  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKLAERLEQRQACEDELR  74

Query   75  ERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHESQGELSSAPEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRD  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHESQGELSSAPEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRD  148

Query  149  PLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVELELQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPL  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  PLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVELELQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPL  222

Query  223  SEAAQAHTRELGRENRRLQDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKL  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  SEAAQAHTRELGRENRRLQDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKL  296

Query  297  NKHLAEALEQLNSGYYVSGSSSGFQGGQITLSMQKFEMLNAELEENQELANSRMAELEKLQAELQGAVRTNERL  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct  297  NKHLAEALEQLNSGYYVSGSSSGFQGGQITLSMQK---------------------------------------  331

Query  371  KVALRSLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYNESLQVKTQLDEARGLLLATKNSHLRHIEHMESDELGLQKKLRTE  444
                                                                         |||||||||||||
Sbjct  332  -------------------------------------------------------------SDELGLQKKLRTE  344

Query  445  VIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKL  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  345  VIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKL  418

Query  519  RAQASGSAHSTPNLGHPEDSGVSAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELVPSEEDFQGI  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  419  RAQASGSAHSTPNLGHPEDSGVSAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELVPSEEDFQGI  492

Query  593  TPGAQGPSSRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGLRAELKKAQESQ  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  493  TPGAQGPSSRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGLRAELKKAQESQ  566

Query  667  KEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKKIADEDALRRIRQAEEQIEHL  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  567  KEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKKIADEDALRRIRQAEEQIEHL  640

Query  741  QRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLREKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQV  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  641  QRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLREKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQV  714

Query  815  LGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQGSLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQ  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  715  LGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQGSLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQ  788

Query  889  PCLAESRAAREKESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVLTK  962
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Sbjct  789  PCLAESRAAREKESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVLTK  862

Query  963  CFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRIYIS  1001
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Sbjct  863  CFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRIYIS  901