Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02248
- Subject:
- NM_001207034.1
- Aligned Length:
- 1001
- Identities:
- 901
- Gaps:
- 100
Alignment
Query 1 MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKLAERLEQRQACEDELR 74
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Sbjct 1 MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKLAERLEQRQACEDELR 74
Query 75 ERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHESQGELSSAPEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRD 148
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Sbjct 75 ERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHESQGELSSAPEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRD 148
Query 149 PLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVELELQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPL 222
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Sbjct 149 PLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVELELQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPL 222
Query 223 SEAAQAHTRELGRENRRLQDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKL 296
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Sbjct 223 SEAAQAHTRELGRENRRLQDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKL 296
Query 297 NKHLAEALEQLNSGYYVSGSSSGFQGGQITLSMQKFEMLNAELEENQELANSRMAELEKLQAELQGAVRTNERL 370
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Sbjct 297 NKHLAEALEQLNSGYYVSGSSSGFQGGQITLSMQK--------------------------------------- 331
Query 371 KVALRSLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYNESLQVKTQLDEARGLLLATKNSHLRHIEHMESDELGLQKKLRTE 444
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Sbjct 332 -------------------------------------------------------------SDELGLQKKLRTE 344
Query 445 VIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKL 518
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Sbjct 345 VIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKL 418
Query 519 RAQASGSAHSTPNLGHPEDSGVSAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELVPSEEDFQGI 592
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Sbjct 419 RAQASGSAHSTPNLGHPEDSGVSAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELVPSEEDFQGI 492
Query 593 TPGAQGPSSRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGLRAELKKAQESQ 666
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Sbjct 493 TPGAQGPSSRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGLRAELKKAQESQ 566
Query 667 KEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKKIADEDALRRIRQAEEQIEHL 740
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Sbjct 567 KEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKKIADEDALRRIRQAEEQIEHL 640
Query 741 QRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLREKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQV 814
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Sbjct 641 QRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLREKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQV 714
Query 815 LGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQGSLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQ 888
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Sbjct 715 LGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQGSLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQ 788
Query 889 PCLAESRAAREKESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVLTK 962
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Sbjct 789 PCLAESRAAREKESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVLTK 862
Query 963 CFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRIYIS 1001
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Sbjct 863 CFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRIYIS 901