Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02248
• Subject: NM_172281.2
• Aligned Length: 1001
• Identities: 926
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKLAERLEQRQACEDELR  74
            |||..||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MSGLSNKRAAGDGGSGPPEKKMNREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDSKVLQFKNKKLAERLEQRQACEDELR  74

Query   75  ERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHESQGELSSAPEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRD  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|.|.||||..|.||.|||.|.|..|.|.||||.||.
Sbjct   75  ERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLQCYENQRELSSGTEVPGCQEGLTRDVIPRPDPGTSDLRE  148

Query  149  PLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVELELQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPL  222
            ||..|.|.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||..
Sbjct  149  PLPVQFRAPLSEPALAFVVALGASSCEEVELQLQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRQVEELCQRVYSRGDSEAP  222

Query  223  SEAAQAHTRELGRENRRLQDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKL  296
            .|.|...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GEVARVRTRELGRENRRLQDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSTETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKL  296

Query  297  NKHLAEALEQLNSGYYVSGSSSGFQGGQITLSMQKFEMLNAELEENQELANSRMAELEKLQAELQGAVRTNERL  370
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  NKHLAEALEQLNSGYYVSGSSTGFQGGQITLSMQKFEMLNAELEENQELANSRMAELEKLQAELQGAVRTNERL  370

Query  371  KVALRSLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYNESLQVKTQLDEARGLLLATKNSHLRHIEHMESDELGLQKKLRTE  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  KVALRSLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYNESLQVKTQLDEARGLLLASKNSHLRHIEHMESDELGLQKKLRTE  444

Query  445  VIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKL  518
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Sbjct  445  VIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKL  518

Query  519  RAQASGSAHSTPNLGHPEDSGVSAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELVPSEEDFQGI  592
            |||||||.|..|.|.||.|.|..|.|||||..||||..|||..||||...|.|..|.|.||||||.||.|.|..
Sbjct  519  RAQASGSSHCIPTLSHPDDPGLNALAPGKEDSGPGPGGTPDCKKEMALLAGATSATSSIKKEELVSSEDDAQAL  592

Query  593  TPGAQGPSSRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGLRAELKKAQESQ  666
            ||..||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TPVTQGLPSRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPAASTLSRADREKAKVEEAKRKESELLKGLRAELKKAQESQ  666

Query  667  KEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKKIADEDALRRIRQAEEQIEHL  740
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Sbjct  667  KEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKKIADEDALRRIRQAEEQIEHL  740

Query  741  QRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLREKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQV  814
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Sbjct  741  QRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLREKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQV  814

Query  815  LGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQGSLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQ  888
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Sbjct  815  LGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQGSLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQ  888

Query  889  PCLAESRAAREKESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVLTK  962
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Sbjct  889  PCLAESRAAREKESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVLTK  962

Query  963  CFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRIYIS  1001
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Sbjct  963  CFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRVYIS  1001