Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02248
- Subject:
- XM_006507749.2
- Aligned Length:
- 3042
- Identities:
- 2623
- Gaps:
- 45
Alignment
Query 1 ATGTCTGGGC-CAGGCAACAAACGCGCCGCCGGCGACGGGGGCTCAGGGCCCCCGGAAAAGAAGCTGAGTCGTG 73
||||||||.| || |||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||.|||..||.|
Sbjct 1 ATGTCTGGCCTCA-GCAACAAGCGCGCCGCCGGCGACGGGGGCTCAGGACCCCCAGAGAAGAAGATGAACCGCG 73
Query 74 AGGAGAAGACCACCACGACTCTTATCGAGCCCATTCGTCTTGGAGGCATCTCTTCCACGGAGGAGATGGA--CC 145
|||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||| ||
Sbjct 74 AGGAGAAGACCACGACCACTCTAATCGAACCCATTCGTCTCGGCGGCATTTCTTCCACGGAGGAGATGGATTCC 147
Query 146 TGAAGGTACTACAGTTCAAGAACAAGAAACTGGCAGAGCGGCTGGAACAACGGCAGGCTTGTGAAGATGAACTC 219
||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct 148 --AAGGTACTGCAGTTCAAGAACAAGAAGCTGGCGGAGCGGTTGGAGCAGCGGCAAGCCTGCGAGGATGAGCTC 219
Query 220 CGAGAACGAATTGAGAAGTTGGAGAAGCGGCAGGCCACAGATGATGCCACACTCCTCATCGTCAATCGCTACTG 293
||.||..||||||||||.|||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 220 CGGGAGAGAATTGAGAAATTGGAGAAGAGGCAGGCCACTGATGATGCCACACTCCTCATCGTCAACCGCTACTG 293
Query 294 GGCCCAGCTGGATGAAACTGTGGAAGCCCTTCTCCGATGCCATGAGAGCCAGGGGGAGCTGTCTTCAGCGCCTG 367
|||||||||||||||||||||.||||||||.||||..|||.|.||||.||||.||||.||||||||||.|.|.|
Sbjct 294 GGCCCAGCTGGATGAAACTGTAGAAGCCCTCCTCCAGTGCTACGAGAACCAGAGGGAACTGTCTTCAGGGACAG 367
Query 368 AGGCACCTGGGACCCAGGAGGGGCCAACATGTGATGGGACTCCTCTCCCAGAGCCGGGGACATCAGAGCTGAGA 441
|||..||||||..|||.|||||.|..||..||||||.||..||||..|||||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 368 AGGTGCCTGGGTGCCAAGAGGGCCTGACCCGTGATGTGATCCCTCGACCAGACCCAGGGACATCAGATCTGAGG 441
Query 442 GACCCCTTGCTGATGCAGCTGCGGCCCCCTCTCAGTGAGCCGGCCTTGGCTTTTGTGGTGGCACTGGGTGCCAG 515
||.||..|||...|||||.|.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 442 GAACCGCTGCCAGTGCAGTTTCGAGCCCCTCTCAGTGAGCCGGCCTTGGCTTTTGTGGTGGCACTGGGCGCCAG 515
Query 516 CAGCAGTGAGGAGGTGGAGCTGGAGCTGCAAGGCCGAATGGAGTTCTCCAAGGCAGCTGTGTCTCGTGTGGTAG 589
||||.|||||||.|||||||||.|||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct 516 CAGCTGTGAGGAAGTGGAGCTGCAGCTGCAGGGTCGGATGGAATTCTCCAAGGCTGCCGTGTCTCGGGTGGTCG 589
Query 590 AGGCCTCAGACCGCCTACAGCGCCGGGTGGAGGAACTCTGTCAGCGAGTGTACAGCCG---------------- 647
|||||||.||||||||.||.||.|.||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 590 AGGCCTCGGACCGCCTGCAACGGCAGGTGGAAGAACTCTGTCAGCGAGTATACAGCCGGGGGTTTGGCTCTCAT 663
Query 648 -----------------AGGGGACAGTGA-GCCCCTCAGTGAGGCGGCTCAGGCACACACCCGAGAGCTGGGCC 703
|||||||||||| |||||| .|.||||.|||.|.||..|.||||||.|||||.|||.
Sbjct 664 CCAGGCTTTGCATTCCCAGGGGACAGTGAGGCCCCT-GGGGAGGTGGCACGGGTGCGCACCCGGGAGCTAGGCA 736
Query 704 GTGAGAACCGGCGACTGCAGGACTTGGCCACTCAGCTGCAGGAGAAACACCACCGCATCTCATTGGAGTACTCC 777
|.||||||||..|.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 737 GAGAGAACCGTAGGCTACAGGACTTGGCCACTCAGCTGCAAGAGAAACACCACCGCATCTCGTTGGAGTACTCT 810
Query 778 GAGCTCCAGGATAAAGTGACATCGGCAGAGACCAAGGTGCTGGAGATGGAGACAACAGTGGAGGACTTGCAGTG 851
||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||
Sbjct 811 GAGCTCCAAGATAAAGTGACATCGACAGAGACCAAGGTCCTAGAGATGGAGACCACAGTGGAGGACCTGCAGTG 884
Query 852 GGACATCGAGAAGCTGCGGAAGCGAGAGCAAAAGCTCAATAAGCACCTGGCAGAGGCCTTAGAGCAGCTTAACT 925
||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 885 GGACATTGAGAAGCTGCGCAAGCGAGAACAGAAGCTCAATAAGCACTTGGCAGAGGCCTTGGAGCAGCTCAACT 958
Query 926 CTGGCTACTATGTATCTGGGAGCTCCTCAGGCTTCCAGGGGGGCCAGATCACACTCAGCATGCAGAAGTTTGAG 999
|.|||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 CCGGCTACTATGTGTCTGGGAGCTCCACAGGCTTTCAGGGAGGCCAGATTACACTCAGCATGCAGAAGTTTGAG 1032
Query 1000 ATGCTGAATGCAGAGTTAGAGGAAAACCAGGAACTGGCCAACAGCCGTATGGCAGAGCTGGAGAAACTGCAGGC 1073
|||.|||||||||||.|.||.|||||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1033 ATGTTGAATGCAGAGCTGGAAGAAAATCAGGAATTGGCCAATAGCCGAATGGCAGAGCTGGAGAAGCTGCAGGC 1106
Query 1074 CGAACTTCAGGGGGCTGTGCGGACCAATGAGCGCCTCAAGGTGGCCCTGCGGAGCCTTCCTGAGGAGGTAGTGC 1147
.||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1107 GGAGCTTCAGGGAGCCGTTCGGACCAATGAGCGTCTCAAGGTGGCCCTGCGTAGCCTTCCTGAGGAGGTCGTTC 1180
Query 1148 GGGAGACGGGGGAGTACCGCATGCTGCAGGCCCAATTCTCACTGCTCTACAACGAGTCTCTGCAAGTGAAGACC 1221
|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct 1181 GTGAGACAGGGGAGTACCGCATGCTGCAGGCACAGTTCTCCCTGCTCTACAATGAGTCTTTGCAAGTGAAGACC 1254
Query 1222 CAGCTAGACGAGGCTCGGGGCCTGCTGCTGGCCACAAAGAACTCCCACCTGCGACACATCGAGCACATGGAGAG 1295
|||||.||.|||||.|||||..|||||||||||.|.||||||||||||.||.|||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1255 CAGCTCGATGAGGCCCGGGGGTTGCTGCTGGCCTCCAAGAACTCCCACTTGAGACACATTGAACATATGGAGAG 1328
Query 1296 CGACGAGCTGGGGCTGCAGAAGAAGCTACGCACAGAGGTCATTCAGCTGGAGGACACGCTGGCCCAGGTACGCA 1369
.||.||..|||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1329 TGATGAATTGGGGCTGCAGAAGAAGCTGCGCACAGAAGTTATCCAGCTGGAAGACACCCTGGCCCAGGTACGCA 1402
Query 1370 AGGAGTATGAGATGCTGCGCATCGAGTTTGAGCAGAATCTGGCGGCCAACGAGCAGGCGGGGCCCATCAACCGT 1443
|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1403 AGGAGTACGAGATGCTGCGCATCGAGTTTGAACAGAACCTTGCGGCCAACGAGCAGGCTGGGCCTATCAACCGG 1476
Query 1444 GAGATGCGCCACCTGATTAGTAGTCTTCAAAACCACAACCACCAGCTAAAAGGGGACGCCCAGCGATACAAGCG 1517
||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1477 GAAATGCGCCACCTGATTAGCAGCCTCCAGAACCACAATCACCAGCTAAAAGGAGATGCCCAGCGATACAAGCG 1550
Query 1518 GAAGCTTCGAGAAGTACAAGCTGAGATTGGCAAGCTCCGGGCCCAGGCCAGTGGCTCTGCCCACTCCACCCCCA 1591
|||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||.||||||.||..||||
Sbjct 1551 GAAACTTCGAGAAGTACAGGCTGAGATTGGTAAACTCCGGGCACAGGCCAGCGGCTCTTCCCACTGCATTCCCA 1624
Query 1592 ACCTGGGCCACCCAGAGGATTCTGGCGTCAGTGCCCCAGCCCCAGGGAAAGAGGAGGGTGGGCCAGGCCCTGTC 1665
.||||.||||||||||.||..|||||.|||.|||||..|||||||||||.||.||..|||||||||||||||..
Sbjct 1625 CCCTGAGCCACCCAGATGACCCTGGCCTCAATGCCCTTGCCCCAGGGAAGGAAGATAGTGGGCCAGGCCCTGGA 1698
Query 1666 AGTACCCCCGACAACAGAAAGGAGATGGCTCCAGTGCCTGGCACCACCACTACTACCACTTCAGTGAAGAAGGA 1739
.|||||||.|||..||..||||||||||||..|.||.||||..|||||.||.||||..||||..|.|||||.||
Sbjct 1699 GGTACCCCTGACTGCAAGAAGGAGATGGCTTTATTGGCTGGAGCCACCTCTGCTACTTCTTCCATAAAGAAAGA 1772
Query 1740 GGAGCTGGTCCCCTCTGAAGAGGACTTCCAGGGTATAACCCCTGGGGCCCAGGGCCCTT--CCTCCCGGGGCCG 1811
||||||||||.||||||||||.|||..|||||...|||||||||...||||||| ||| |||||.||||.||
Sbjct 1773 GGAGCTGGTCTCCTCTGAAGATGACGCCCAGGCCCTAACCCCTGTAACCCAGGG--CTTGCCCTCCAGGGGTCG 1844
Query 1812 AGAACCTGAGGCCAGGCCCAAGCGGGAGCTTCGGGAACGGGAAGGTCCCAGCCTAGGACCTCCACCTGTAGCCT 1885
|||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1845 AGAACCTGAGGCCAGACCCAAGCGAGAACTTCGGGAACGGGAAGGGCCTAGCCTAGGACCCCCACCTGCAGCCT 1918
Query 1886 CCGCTCTCTCAAGGGCTGATCGGGAGAAGGCCAAGGTGGAAGAAACCAAGCGGAAGGAATCAGAACTCCTCAAG 1959
|..||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||..||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1919 CAACTCTGTCAAGGGCTGATCGAGAAAAGGCCAAGGTGGAAGAAGCCAAAAGGAAGGAATCGGAACTGCTCAAA 1992
Query 1960 GGTCTCCGAGCAGAGCTCAAGAAGGCCCAGGAGAGCCAGAAGGAGATGAAACTGCTGCTGGATATGTACAAGTC 2033
||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1993 GGTCTCCGAGCAGAGCTCAAGAAGGCTCAGGAAAGCCAGAAGGAGATGAAGCTGCTCCTGGACATGTACAAGTC 2066
Query 2034 AGCGCCCAAGGAGCAGCGGGATAAGGTGCAGCTCATGGCAGCGGAACGCAAGGCTAAGGCCGAGGTTGATGAGC 2107
|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 2067 AGCACCCAAGGAGCAGCGGGACAAGGTGCAGCTCATGGCAGCTGAGCGCAAGGCCAAGGCTGAGGTGGATGAGC 2140
Query 2108 TGCGGAGCCGCATCCGGGAATTGGAGGAGAGGGATCGAAGGGAGAGCAAGAAGATCGCGGATGAGGATGCCCTG 2181
|.||||||||||||||.||..||||.||..|.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2141 TTCGGAGCCGCATCCGAGAGCTGGAAGAACGAGACCGAAGAGAAAGCAAGAAGATTGCGGATGAAGATGCCCTG 2214
Query 2182 CGGCGCATTCGGCAGGCAGAGGAGCAGATAGAACACCTGCAGCGCAAGCTGGGTGCCACCAAGCAGGAGGAGGA 2255
|||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||.||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 CGGCGGATCCGGCAGGCAGAAGAGCAGATTGAACACTTGCAACGCAAATTGGGTGCCACCAAGCAGGAGGAGGA 2288
Query 2256 GGCTCTGCTCTCAGAGATGGATGTGACAGGTCAGGCTTTTGAGGACATGCAGGAACAGAACGGGCGGCTGCTAC 2329
|||..||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|
Sbjct 2289 GGCGTTGCTGTCGGAGATGGATGTAACAGGTCAGGCTTTTGAAGACATGCAGGAGCAAAACGGGCGGCTACTTC 2362
Query 2330 AGCAGTTGCGGGAAAAGGATGATGCCAACTTTAAGCTAATGTCAGAGCGGATCAAGGCCAACCAGATTCACAAG 2403
|||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2363 AGCAGTTACGGGAAAAGGATGACGCCAACTTCAAGCTCATGTCGGAGCGGATCAAGGCCAACCAGATTCACAAG 2436
Query 2404 CTGCTGCGGGAGGAGAAGGATGAGTTGGGCGAGCAGGTCCTTGGCCTCAAGTCCCAGGTGGATGCCCAGCTGCT 2477
|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2437 CTGCTCCGAGAGGAGAAGGATGAGTTGGGCGAGCAGGTTCTTGGCCTTAAGTCCCAGGTGGATGCCCAGCTGCT 2510
Query 2478 GACTGTGCAGAAGCTGGAGGAGAAGGAGCGAGCCTTGCAGGGCAGCCTCGGGGGTGTGGAGAAGGAGCTGACGC 2551
|||.||.||||||||.||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|
Sbjct 2511 GACCGTACAGAAGCTTGAGGAGAAGGAGCGGGCTCTGCAGGGCAGCCTCGGGGGTGTGGAAAAGGAGTTGACTC 2584
Query 2552 TGCGCAGCCAAGCCCTGGAGCTCAACAAGCGGAAGGCTGTAGAAGCCGCCCAGCTGGCCGAGGACCTGAAGGTG 2625
||||||||||.||.||||||||.||.|||.|.||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 2585 TGCGCAGCCAGGCTCTGGAGCTTAATAAGAGAAAGGCTGTAGAAGCAGCCCAGTTGGCTGAGGACCTGAAGGTG 2658
Query 2626 CAGCTGGAGCACGTGCAGACTCGGCTGCGGGAGATCCAGCCCTGCCTGGCAGAGAGCCGGGCTGCTCGTGAGAA 2699
|||.|||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 2659 CAGTTGGAGCATGTGCAGACTCGACTTCGAGAGATCCAGCCCTGCCTGGCAGAGAGCCGGGCTGCCCGGGAGAA 2732
Query 2700 AGAGAGCTTCAACCTCAAGAGGGCTCAGGAGGACATCTCACGGCTGCGGCGCAAGCTGGAAAAGCAGAGGAAGG 2773
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.||.|||.||||.|
Sbjct 2733 GGAGAGCTTCAACCTCAAGAGGGCTCAGGAGGACATTTCCCGGCTTCGGCGAAAACTAGAGAAACAGCGGAAAG 2806
Query 2774 TGGAGGTCTACGCAGATGCCGACGAAATCCTCCAGGAGGAGATCAAGGAGTACAAGGCGCGGTTGACCTGCCCC 2847
|||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2807 TGGAGGTTTATGCAGATGCTGACGAGATCCTGCAGGAGGAGATCAAGGAGTACAAGGCCCGGTTGACCTGCCCC 2880
Query 2848 TGCTGTAACACCCGCAAGAAGGATGCAGTCCTTACCAAGTGCTTCCACGTTTTCTGCTTCGAGTGCGTGCGGGG 2921
||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 2881 TGCTGTAACACCCGCAAGAAGGATGCCGTGCTTACCAAGTGCTTCCACGTTTTCTGCTTTGAATGTGTGCGGGG 2954
Query 2922 CCGCTATGAGGCCCGCCAGAGGAAGTGCCCCAAGTGCAACGCGGCCTTTGGTGCCCACGACTTCCATCGTATCT 2995
||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|.|
Sbjct 2955 CCGCTATGAGGCCCGCCAGAGGAAATGTCCCAAGTGCAACGCAGCCTTTGGTGCCCACGACTTCCACCGTGTGT 3028
Query 2996 ACATCAGC 3003
||||||||
Sbjct 3029 ACATCAGC 3036