Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02248
- Subject:
- XM_006507750.2
- Aligned Length:
- 3024
- Identities:
- 2623
- Gaps:
- 27
Alignment
Query 1 ATGTCTGGGC-CAGGCAACAAACGCGCCGCCGGCGACGGGGGCTCAGGGCCCCCGGAAAAGAAGCTGAGTCGTG 73
||||||||.| || |||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||.|||..||.|
Sbjct 1 ATGTCTGGCCTCA-GCAACAAGCGCGCCGCCGGCGACGGGGGCTCAGGACCCCCAGAGAAGAAGATGAACCGCG 73
Query 74 AGGAGAAGACCACCACGACTCTTATCGAGCCCATTCGTCTTGGAGGCATCTCTTCCACGGAGGAGATGGA--CC 145
|||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||| ||
Sbjct 74 AGGAGAAGACCACGACCACTCTAATCGAACCCATTCGTCTCGGCGGCATTTCTTCCACGGAGGAGATGGATTCC 147
Query 146 TGAAGGTACTACAGTTCAAGAACAAGAAACTGGCAGAGCGGCTGGAACAACGGCAGGCTTGTGAAGATGAACTC 219
||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct 148 --AAGGTACTGCAGTTCAAGAACAAGAAGCTGGCGGAGCGGTTGGAGCAGCGGCAAGCCTGCGAGGATGAGCTC 219
Query 220 CGAGAACGAATTGAGAAGTTGGAGAAGCGGCAGGCCACAGATGATGCCACACTCCTCATCGTCAATCGCTACTG 293
||.||..||||||||||.|||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 220 CGGGAGAGAATTGAGAAATTGGAGAAGAGGCAGGCCACTGATGATGCCACACTCCTCATCGTCAACCGCTACTG 293
Query 294 GGCCCAGCTGGATGAAACTGTGGAAGCCCTTCTCCGATGCCATGAGAGCCAGGGGGAGCTGTCTTCAGCGCCTG 367
|||||||||||||||||||||.||||||||.||||..|||.|.||||.||||.||||.||||||||||.|.|.|
Sbjct 294 GGCCCAGCTGGATGAAACTGTAGAAGCCCTCCTCCAGTGCTACGAGAACCAGAGGGAACTGTCTTCAGGGACAG 367
Query 368 AGGCACCTGGGACCCAGGAGGGGCCAACATGTGATGGGACTCCTCTCCCAGAGCCGGGGACATCAGAGCTGAGA 441
|||..||||||..|||.|||||.|..||..||||||.||..||||..|||||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 368 AGGTGCCTGGGTGCCAAGAGGGCCTGACCCGTGATGTGATCCCTCGACCAGACCCAGGGACATCAGATCTGAGG 441
Query 442 GACCCCTTGCTGATGCAGCTGCGGCCCCCTCTCAGTGAGCCGGCCTTGGCTTTTGTGGTGGCACTGGGTGCCAG 515
||.||..|||...|||||.|.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 442 GAACCGCTGCCAGTGCAGTTTCGAGCCCCTCTCAGTGAGCCGGCCTTGGCTTTTGTGGTGGCACTGGGCGCCAG 515
Query 516 CAGCAGTGAGGAGGTGGAGCTGGAGCTGCAAGGCCGAATGGAGTTCTCCAAGGCAGCTGTGTCTCGTGTGGTAG 589
||||.|||||||.|||||||||.|||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct 516 CAGCTGTGAGGAAGTGGAGCTGCAGCTGCAGGGTCGGATGGAATTCTCCAAGGCTGCCGTGTCTCGGGTGGTCG 589
Query 590 AGGCCTCAGACCGCCTACAGCGCCGGGTGGAGGAACTCTGTCAGCGAGTGTACAGCCG---------------A 648
|||||||.||||||||.||.||.|.||||||.|||||||||||||||||.|||||||| |
Sbjct 590 AGGCCTCGGACCGCCTGCAACGGCAGGTGGAAGAACTCTGTCAGCGAGTATACAGCCGGGGCTTTGCATTCCCA 663
Query 649 GGGGACAGTGA-GCCCCTCAGTGAGGCGGCTCAGGCACACACCCGAGAGCTGGGCCGTGAGAACCGGCGACTGC 721
||||||||||| |||||| .|.||||.|||.|.||..|.||||||.|||||.|||.|.||||||||..|.||.|
Sbjct 664 GGGGACAGTGAGGCCCCT-GGGGAGGTGGCACGGGTGCGCACCCGGGAGCTAGGCAGAGAGAACCGTAGGCTAC 736
Query 722 AGGACTTGGCCACTCAGCTGCAGGAGAAACACCACCGCATCTCATTGGAGTACTCCGAGCTCCAGGATAAAGTG 795
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 737 AGGACTTGGCCACTCAGCTGCAAGAGAAACACCACCGCATCTCGTTGGAGTACTCTGAGCTCCAAGATAAAGTG 810
Query 796 ACATCGGCAGAGACCAAGGTGCTGGAGATGGAGACAACAGTGGAGGACTTGCAGTGGGACATCGAGAAGCTGCG 869
||||||.|||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 811 ACATCGACAGAGACCAAGGTCCTAGAGATGGAGACCACAGTGGAGGACCTGCAGTGGGACATTGAGAAGCTGCG 884
Query 870 GAAGCGAGAGCAAAAGCTCAATAAGCACCTGGCAGAGGCCTTAGAGCAGCTTAACTCTGGCTACTATGTATCTG 943
.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 885 CAAGCGAGAACAGAAGCTCAATAAGCACTTGGCAGAGGCCTTGGAGCAGCTCAACTCCGGCTACTATGTGTCTG 958
Query 944 GGAGCTCCTCAGGCTTCCAGGGGGGCCAGATCACACTCAGCATGCAGAAGTTTGAGATGCTGAATGCAGAGTTA 1017
||||||||.|||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.
Sbjct 959 GGAGCTCCACAGGCTTTCAGGGAGGCCAGATTACACTCAGCATGCAGAAGTTTGAGATGTTGAATGCAGAGCTG 1032
Query 1018 GAGGAAAACCAGGAACTGGCCAACAGCCGTATGGCAGAGCTGGAGAAACTGCAGGCCGAACTTCAGGGGGCTGT 1091
||.|||||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct 1033 GAAGAAAATCAGGAATTGGCCAATAGCCGAATGGCAGAGCTGGAGAAGCTGCAGGCGGAGCTTCAGGGAGCCGT 1106
Query 1092 GCGGACCAATGAGCGCCTCAAGGTGGCCCTGCGGAGCCTTCCTGAGGAGGTAGTGCGGGAGACGGGGGAGTACC 1165
.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 1107 TCGGACCAATGAGCGTCTCAAGGTGGCCCTGCGTAGCCTTCCTGAGGAGGTCGTTCGTGAGACAGGGGAGTACC 1180
Query 1166 GCATGCTGCAGGCCCAATTCTCACTGCTCTACAACGAGTCTCTGCAAGTGAAGACCCAGCTAGACGAGGCTCGG 1239
|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1181 GCATGCTGCAGGCACAGTTCTCCCTGCTCTACAATGAGTCTTTGCAAGTGAAGACCCAGCTCGATGAGGCCCGG 1254
Query 1240 GGCCTGCTGCTGGCCACAAAGAACTCCCACCTGCGACACATCGAGCACATGGAGAGCGACGAGCTGGGGCTGCA 1313
||..|||||||||||.|.||||||||||||.||.|||||||.||.||.||||||||.||.||..||||||||||
Sbjct 1255 GGGTTGCTGCTGGCCTCCAAGAACTCCCACTTGAGACACATTGAACATATGGAGAGTGATGAATTGGGGCTGCA 1328
Query 1314 GAAGAAGCTACGCACAGAGGTCATTCAGCTGGAGGACACGCTGGCCCAGGTACGCAAGGAGTATGAGATGCTGC 1387
|||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1329 GAAGAAGCTGCGCACAGAAGTTATCCAGCTGGAAGACACCCTGGCCCAGGTACGCAAGGAGTACGAGATGCTGC 1402
Query 1388 GCATCGAGTTTGAGCAGAATCTGGCGGCCAACGAGCAGGCGGGGCCCATCAACCGTGAGATGCGCCACCTGATT 1461
|||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1403 GCATCGAGTTTGAACAGAACCTTGCGGCCAACGAGCAGGCTGGGCCTATCAACCGGGAAATGCGCCACCTGATT 1476
Query 1462 AGTAGTCTTCAAAACCACAACCACCAGCTAAAAGGGGACGCCCAGCGATACAAGCGGAAGCTTCGAGAAGTACA 1535
||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1477 AGCAGCCTCCAGAACCACAATCACCAGCTAAAAGGAGATGCCCAGCGATACAAGCGGAAACTTCGAGAAGTACA 1550
Query 1536 AGCTGAGATTGGCAAGCTCCGGGCCCAGGCCAGTGGCTCTGCCCACTCCACCCCCAACCTGGGCCACCCAGAGG 1609
.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||.||||||.||..||||.||||.||||||||||.|
Sbjct 1551 GGCTGAGATTGGTAAACTCCGGGCACAGGCCAGCGGCTCTTCCCACTGCATTCCCACCCTGAGCCACCCAGATG 1624
Query 1610 ATTCTGGCGTCAGTGCCCCAGCCCCAGGGAAAGAGGAGGGTGGGCCAGGCCCTGTCAGTACCCCCGACAACAGA 1683
|..|||||.|||.|||||..|||||||||||.||.||..|||||||||||||||...|||||||.|||..||..
Sbjct 1625 ACCCTGGCCTCAATGCCCTTGCCCCAGGGAAGGAAGATAGTGGGCCAGGCCCTGGAGGTACCCCTGACTGCAAG 1698
Query 1684 AAGGAGATGGCTCCAGTGCCTGGCACCACCACTACTACCACTTCAGTGAAGAAGGAGGAGCTGGTCCCCTCTGA 1757
||||||||||||..|.||.||||..|||||.||.||||..||||..|.|||||.||||||||||||.|||||||
Sbjct 1699 AAGGAGATGGCTTTATTGGCTGGAGCCACCTCTGCTACTTCTTCCATAAAGAAAGAGGAGCTGGTCTCCTCTGA 1772
Query 1758 AGAGGACTTCCAGGGTATAACCCCTGGGGCCCAGGGCCCTT--CCTCCCGGGGCCGAGAACCTGAGGCCAGGCC 1829
|||.|||..|||||...|||||||||...||||||| ||| |||||.||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1773 AGATGACGCCCAGGCCCTAACCCCTGTAACCCAGGG--CTTGCCCTCCAGGGGTCGAGAACCTGAGGCCAGACC 1844
Query 1830 CAAGCGGGAGCTTCGGGAACGGGAAGGTCCCAGCCTAGGACCTCCACCTGTAGCCTCCGCTCTCTCAAGGGCTG 1903
||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||.||||||..||||.||||||||||
Sbjct 1845 CAAGCGAGAACTTCGGGAACGGGAAGGGCCTAGCCTAGGACCCCCACCTGCAGCCTCAACTCTGTCAAGGGCTG 1918
Query 1904 ATCGGGAGAAGGCCAAGGTGGAAGAAACCAAGCGGAAGGAATCAGAACTCCTCAAGGGTCTCCGAGCAGAGCTC 1977
||||.||.||||||||||||||||||.||||..||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1919 ATCGAGAAAAGGCCAAGGTGGAAGAAGCCAAAAGGAAGGAATCGGAACTGCTCAAAGGTCTCCGAGCAGAGCTC 1992
Query 1978 AAGAAGGCCCAGGAGAGCCAGAAGGAGATGAAACTGCTGCTGGATATGTACAAGTCAGCGCCCAAGGAGCAGCG 2051
||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1993 AAGAAGGCTCAGGAAAGCCAGAAGGAGATGAAGCTGCTCCTGGACATGTACAAGTCAGCACCCAAGGAGCAGCG 2066
Query 2052 GGATAAGGTGCAGCTCATGGCAGCGGAACGCAAGGCTAAGGCCGAGGTTGATGAGCTGCGGAGCCGCATCCGGG 2125
|||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 2067 GGACAAGGTGCAGCTCATGGCAGCTGAGCGCAAGGCCAAGGCTGAGGTGGATGAGCTTCGGAGCCGCATCCGAG 2140
Query 2126 AATTGGAGGAGAGGGATCGAAGGGAGAGCAAGAAGATCGCGGATGAGGATGCCCTGCGGCGCATTCGGCAGGCA 2199
|..||||.||..|.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 2141 AGCTGGAAGAACGAGACCGAAGAGAAAGCAAGAAGATTGCGGATGAAGATGCCCTGCGGCGGATCCGGCAGGCA 2214
Query 2200 GAGGAGCAGATAGAACACCTGCAGCGCAAGCTGGGTGCCACCAAGCAGGAGGAGGAGGCTCTGCTCTCAGAGAT 2273
||.||||||||.||||||.||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||..||||.||.|||||
Sbjct 2215 GAAGAGCAGATTGAACACTTGCAACGCAAATTGGGTGCCACCAAGCAGGAGGAGGAGGCGTTGCTGTCGGAGAT 2288
Query 2274 GGATGTGACAGGTCAGGCTTTTGAGGACATGCAGGAACAGAACGGGCGGCTGCTACAGCAGTTGCGGGAAAAGG 2347
||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 2289 GGATGTAACAGGTCAGGCTTTTGAAGACATGCAGGAGCAAAACGGGCGGCTACTTCAGCAGTTACGGGAAAAGG 2362
Query 2348 ATGATGCCAACTTTAAGCTAATGTCAGAGCGGATCAAGGCCAACCAGATTCACAAGCTGCTGCGGGAGGAGAAG 2421
||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 2363 ATGACGCCAACTTCAAGCTCATGTCGGAGCGGATCAAGGCCAACCAGATTCACAAGCTGCTCCGAGAGGAGAAG 2436
Query 2422 GATGAGTTGGGCGAGCAGGTCCTTGGCCTCAAGTCCCAGGTGGATGCCCAGCTGCTGACTGTGCAGAAGCTGGA 2495
||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 2437 GATGAGTTGGGCGAGCAGGTTCTTGGCCTTAAGTCCCAGGTGGATGCCCAGCTGCTGACCGTACAGAAGCTTGA 2510
Query 2496 GGAGAAGGAGCGAGCCTTGCAGGGCAGCCTCGGGGGTGTGGAGAAGGAGCTGACGCTGCGCAGCCAAGCCCTGG 2569
||||||||||||.||..|||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 2511 GGAGAAGGAGCGGGCTCTGCAGGGCAGCCTCGGGGGTGTGGAAAAGGAGTTGACTCTGCGCAGCCAGGCTCTGG 2584
Query 2570 AGCTCAACAAGCGGAAGGCTGTAGAAGCCGCCCAGCTGGCCGAGGACCTGAAGGTGCAGCTGGAGCACGTGCAG 2643
||||.||.|||.|.||||||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct 2585 AGCTTAATAAGAGAAAGGCTGTAGAAGCAGCCCAGTTGGCTGAGGACCTGAAGGTGCAGTTGGAGCATGTGCAG 2658
Query 2644 ACTCGGCTGCGGGAGATCCAGCCCTGCCTGGCAGAGAGCCGGGCTGCTCGTGAGAAAGAGAGCTTCAACCTCAA 2717
|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2659 ACTCGACTTCGAGAGATCCAGCCCTGCCTGGCAGAGAGCCGGGCTGCCCGGGAGAAGGAGAGCTTCAACCTCAA 2732
Query 2718 GAGGGCTCAGGAGGACATCTCACGGCTGCGGCGCAAGCTGGAAAAGCAGAGGAAGGTGGAGGTCTACGCAGATG 2791
||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.||.|||.||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 2733 GAGGGCTCAGGAGGACATTTCCCGGCTTCGGCGAAAACTAGAGAAACAGCGGAAAGTGGAGGTTTATGCAGATG 2806
Query 2792 CCGACGAAATCCTCCAGGAGGAGATCAAGGAGTACAAGGCGCGGTTGACCTGCCCCTGCTGTAACACCCGCAAG 2865
|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2807 CTGACGAGATCCTGCAGGAGGAGATCAAGGAGTACAAGGCCCGGTTGACCTGCCCCTGCTGTAACACCCGCAAG 2880
Query 2866 AAGGATGCAGTCCTTACCAAGTGCTTCCACGTTTTCTGCTTCGAGTGCGTGCGGGGCCGCTATGAGGCCCGCCA 2939
||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2881 AAGGATGCCGTGCTTACCAAGTGCTTCCACGTTTTCTGCTTTGAATGTGTGCGGGGCCGCTATGAGGCCCGCCA 2954
Query 2940 GAGGAAGTGCCCCAAGTGCAACGCGGCCTTTGGTGCCCACGACTTCCATCGTATCTACATCAGC 3003
||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||||||
Sbjct 2955 GAGGAAATGTCCCAAGTGCAACGCAGCCTTTGGTGCCCACGACTTCCACCGTGTGTACATCAGC 3018