Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02248
- Subject:
- XM_024450500.1
- Aligned Length:
- 3008
- Identities:
- 2500
- Gaps:
- 499
Alignment
Query 1 ATGTCTGGGCCAGGCAACAAACGCGCCGCCGGCGACGGGGGCTCAGGGCCCCCGGAAAAGAAGCTGAGTCGTGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTGGGCCAGGCAACAAACGCGCCGCCGGCGACGGGGGCTCAGGGCCCCCGGAAAAGAAGCTGAGTCGTGA 74
Query 75 GGAGAAGACCACCACGACTCTTATCGAGCCCATTCGTCTTGGAGGCATCTCTTCCACGGAGGAGATGGACCTGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAGAAGACCACCACGACTCTTATCGAGCCCATTCGTCTTGGAGGCATCTCTTCCACGGAGGAGATGGACCTGA 148
Query 149 AGGTACTACAGTTCAAGAACAAGAAACTGGCAGAGCGGCTGGAACAACGGCAGGCTTGTGAAGATGAACTCCGA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGTACTACAGTTCAAGAACAAGAAACTGGCAGAGCGGCTGGAACAACGGCAGGCTTGTGAAGATGAACTCCGA 222
Query 223 GAACGAATTGAGAAGTTGGAGAAGCGGCAGGCCACAGATGATGCCACACTCCTCATCGTCAATCGCTACTGGGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAACGAATTGAGAAGTTGGAGAAGCGGCAGGCCACAGATGATGCCACACTCCTCATCGTCAATCGCTACTGGGC 296
Query 297 CCAGCTGGATGAAACTGTGGAAGCCCTTCTCCGATGCCATGAGAGCCAGGGGGAGCTGTCTTCAGCGCCTGAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAGCTGGATGAAACTGTGGAAGCCCTTCTCCGATGCCATGAGAGCCAGGGGGAGCTGTCTTCAGCGCCTGAGG 370
Query 371 CACCTGGGACCCAGGAGGGGCCAACATGTGATGGGACTCCTCTCCCAGAGCCGGGGACATCAGAGCTGAGAGAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CACCTGGGACCCAGGAGGGGCCAACATGTGATGGGACTCCTCTCCCAGAGCCGGGGACATCAGAGCTGAGAGAC 444
Query 445 CCCTTGCTGATGCAGCTGCGGCCCCCTCTCAGTGAGCCGGCCTTGGCTTTTGTGGTGGCACTGGGTGCCAGCAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCCTTGCTGATGCAGCTGCGGCCCCCTCTCAGTGAGCCGGCCTTGGCTTTTGTGGTGGCACTGGGTGCCAGCAG 518
Query 519 CAGTGAGGAGGTGGAGCTGGAGCTGCAAGGCCGAATGGAGTTCTCCAAGGCAGCTGTGTCTCGTGTGGTAGAGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGTGAGGAGGTGGAGCTGGAGCTGCAAGGCCGAATGGAGTTCTCCAAGGCAGCTGTGTCTCGTGTGGTAGAGG 592
Query 593 CCTCAGACCGCCTACAGCGCCGGGTGGAGGAACTCTGTCAGCGAGTGTACAGCCGAGGGGACAGTGAGCCCCTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCTCAGACCGCCTACAGCGCCGGGTGGAGGAACTCTGTCAGCGAGTGTACAGCCGAGGGGACAGTGAGCCCCTC 666
Query 667 AGTGAGGCGGCTCAGGCACACACCCGAGAGCTGGGCCGTGAGAACCGGCGACTGCAGGACTTGGCCACTCAGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGTGAGGCGGCTCAGGCACACACCCGAGAGCTGGGCCGTGAGAACCGGCGACTGCAGGACTTGGCCACTCAGCT 740
Query 741 GCAGGAGAAACACCACCGCATCTCATTGGAGTACTCCGAGCTCCAGGATAAAGTGACATCGGCAGAGACCAAGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCAGGAGAAACACCACCGCATCTCATTGGAGTACTCCGAGCTCCAGGATAAAGTGACATCGGCAGAGACCAAGG 814
Query 815 TGCTGGAGATGGAGACAACAGTGGAGGACTTGCAGTGGGACATCGAGAAGCTGCGGAAGCGAGAGCAAAAGCTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCTGGAGATGGAGACAACAGTGGAGGACTTGCAGTGGGACATCGAGAAGCTGCGGAAGCGAGAGCAAAAGCTC 888
Query 889 AATAAGCACCTGGCAGAGGCCTTAGAGCAGCTTAACTCTGGCTACTATGTATCTGGGAGCTCCTCAGGCTTCCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AATAAGCACCTGGCAGAGGCCTTAGAGCAGCTTAACTCTGGCTACTATGTATCTGGGAGCTCCTCAGGCTTCCA 962
Query 963 GGGGGGCCAGATCACACTCAGCATGCAGAAGTTTGAGATGCTGAATGCAGAGTTAGAGGAAAACCAGGAACTGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGGGGGCCAGATCACACTCAGCATGCAGAAGTTTGAGATGCTGAATGCAGAGTTAGAGGAAAACCAGGAACTGG 1036
Query 1037 CCAACAGCCGTATGGCAGAGCTGGAGAAACTGCAGGCCGAACTTCAGGGGGCTGTGCGGACCAATGAGCGCCTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCAACAGCCGTATGGCAGAGCTGGAGAAACTGCAGGCCGAACTTCAGGGGGCTGTGCGGACCAATGAGCGCCTC 1110
Query 1111 AAGGTGGCCCTGCGGAGCCTTCCTGAGGAGGTAGTGCGGGAGACGGGGGAGTACCGCATGCTGCAGGCCCAATT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGGTGGCCCTGCGGAGCCTTCCTGAGGAGGTAGTGCGGGAGACGGGGGAGTACCGCATGCTGCAGGCCCAATT 1184
Query 1185 CTCACTGCTCTACAACGAGTCTCTGCAAGTGAAGACCCAGCTAGACGAGGCTCGGGGCCTGCTGCTGGCCACAA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTCACTGCTCTACAACGAGTCTCTGCAAGTGAAGACCCAGCTAGACGAGGCTCGGGGCCTGCTGCTGGCCACAA 1258
Query 1259 AGAACTCCCACCTGCGACACATCGAGCACATGGAGAGCGACGAGCTGGGGCTGCAGAAGAAGCTACGCACAGAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGAACTCCCACCTGCGACACATCGAGCACATGGAGAGCGACGAGCTGGGGCTGCAGAAGAAGCTACGCACAGAG 1332
Query 1333 GTCATTCAGCTGGAGGACACGCTGGCCCAGGTACGCAAGGAGTATGAGATGCTGCGCATCGAGTTTGAGCAGAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTCATTCAGCTGGAGGACACGCTGGCCCAGGTACGCAAGGAGTATGAGATGCTGCGCATCGAGTTTGAGCAGAA 1406
Query 1407 TCTGGCGGCCAACGAGCAGGCGGGGCCCATCAACCGTGAGATGCGCCACCTGATTAGTAGTCTTCAAAACCACA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCTGGCGGCCAACGAGCAGGCGGGGCCCATCAACCGTGAGATGCGCCACCTGATTAGTAGTCTTCAAAACCACA 1480
Query 1481 ACCACCAGCTAAAAGGGGACGCCCAGCGATACAAGCGGAAGCTTCGAGAAGTACAAGCTGAGATTGGCAAGCTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ACCACCAGCTAAAAGGGGACGCCCAGCGATACAAGCGGAAGCTTCGAGAAGTACAAGCTGAGATTGGCAAGCTC 1554
Query 1555 CGGGCCCAGGCCAGTGGCTCTGCCCACTCCACCCCCAACCTGGGCCACCCAGAGGATTCTGGCGTCAGTGCCCC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CGGGCCCAGGCCAGTGGCTCTGCCCACTCCACCCCCAACCTGGGCCACCCAGAGGATTCTGGCGTCAGTGCCCC 1628
Query 1629 AGCCCCAGGGAAAGAGGAGGGTGGGCCAGGCCCTGTCAGTACCCCCGACAACAGAAAGGAGATGGCTCCAGTGC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGCCCCAGGGAAAGAGGAGGGTGGGCCAGGCCCTGTCAGTACCCCCGACAACAGAAAGGAGATGGCTCCAGTGC 1702
Query 1703 CTGGCACCACCACTACTACCACTTCAGTGAAGAAGGAGGAGCTGGTCCCCTCTGAAGAGGACTTCCAGGGTATA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CTGGCACCACCACTACTACCACTTCAGTGAAGAAGGAGGAGCTGGTCCCCTCTGAAGAGGACTTCCAGGGTATA 1776
Query 1777 ACCCCTGGGGCCCAGGGCCCTTCCTCCCGGGGCCGAGAACCTGAGGCCAGGCCCAAGCGGGAGCTTCGGGAACG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ACCCCTGGGGCCCAGGGCCCTTCCTCCCGGGGCCGAGAACCTGAGGCCAGGCCCAAGCGGGAGCTTCGGGAACG 1850
Query 1851 GGAAGGTCCCAGCCTAGGACCTCCACCTGTAGCCTCCGCTCTCTCAAGGGCTGATCGGGAGAAGGCCAAGGTGG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGAAGGTCCCAGCCTAGGACCTCCACCTGTAGCCTCCGCTCTCTCAAGGGCTGATCGGGAGAAGGCCAAGGTGG 1924
Query 1925 AAGAAACCAAGCGGAAGGAATCAGAACTCCTCAAGGGTCTCCGAGCAGAGCTCAAGAAGGCCCAGGAGAGCCAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AAGAAACCAAGCGGAAGGAATCAGAACTCCTCAAGGGTCTCCGAGCAGAGCTCAAGAAGGCCCAGGAGAGCCAG 1998
Query 1999 AAGGAGATGAAACTGCTGCTGGATATGTACAAGTCAGCGCCCAAGGAGCAGCGGGATAAGGTGCAGCTCATGGC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AAGGAGATGAAACTGCTGCTGGATATGTACAAGTCAGCGCCCAAGGAGCAGCGGGATAAGGTGCAGCTCATGGC 2072
Query 2073 AGCGGAACGCAAGGCTAAGGCCGAGGTTGATGAGCTGCGGAGCCGCATCCGGGAATTGGAGGAGAGGGATCGAA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGCGGAACGCAAGGCTAAGGCCGAGGTTGATGAGCTGCGGAGCCGCATCCGGGAATTGGAGGAGAGGGATCGAA 2146
Query 2147 GGGAGAGCAAGAAGATCGCGGATGAGGATGCCCTGCGGCGCATTCGGCAGGCAGAGGAGCAGATAGAACACCTG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GGGAGAGCAAGAAGATCGCGGATGAGGATGCCCTGCGGCGCATTCGGCAGGCAGAGGAGCAGATAGAACACCTG 2220
Query 2221 CAGCGCAAGCTGGGTGCCACCAAGCAGGAGGAGGAGGCTCTGCTCTCAGAGATGGATGTGACAGGTCAGGCTTT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CAGCGCAAGCTGGGTGCCACCAAGCAGGAGGAGGAGGCTCTGCTCTCAGAGATGGATGTGACAGGTCAGGCTTT 2294
Query 2295 TGAGGACATGCAGGAACAGAACGGGCGGCTGCTACAGCAGTTGCGGGAAAAGGATGATGCCAACTTTAAGCTAA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TGAGGACATGCAGGAACAGAACGGGCGGCTGCTACAGCAGTTGCGGGAAAAGGATGATGCCAACTTTAAGCTAA 2368
Query 2369 TGTCAGAGCGGATCAAGGCCAACCAGATTCACAAGCTGCTGCGGGAGGAGAAGGATGAGTTGGGCGAGCAGGTC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGTCAGAGCGGATCAAGGCCAACCAGATTCACAAGCTGCTGCGGGAGGAGAAGGATGAGTTGGGCGAGCAGGTC 2442
Query 2443 CTTGGCCTCAAGTCCCAGG--TGGATGC--CCAGC-TGCTGACTGTGCAGAAGCTGGAGGAGAAGGAGCGAGCC 2511
||||||||||||||||||| |||..|| ||||| |||.|||| |.|||||||| |||.|.|.|
Sbjct 2443 CTTGGCCTCAAGTCCCAGGTATGGCCGCCGCCAGCTTGCAGACT-----GGAGCTGGAG----AGGTGGGGG-- 2505
Query 2512 TTGCAGGGCAGCCTCGGGGGTGTGGAGAAGGAGCTGACGCTGCGCAGCCAAGCCCTGGAGCTCAACAAGCGGAA 2585
.||.||| ||
Sbjct 2506 --TCATGGC--CC------------------------------------------------------------- 2514
Query 2586 GGCTGTAGAAGCCGCCCAGCTGGCCGAGGACCTGAAGGTGCAGCTGGAGCACGTGCAGACTCGGCTGCGGGAGA 2659
Sbjct 2515 -------------------------------------------------------------------------- 2514
Query 2660 TCCAGCCCTGCCTGGCAGAGAGCCGGGCTGCTCGTGAGAAAGAGAGCTTCAACCTCAAGAGGGCTCAGGAGGAC 2733
Sbjct 2515 -------------------------------------------------------------------------- 2514
Query 2734 ATCTCACGGCTGCGGCGCAAGCTGGAAAAGCAGAGGAAGGTGGAGGTCTACGCAGATGCCGACGAAATCCTCCA 2807
Sbjct 2515 -------------------------------------------------------------------------- 2514
Query 2808 GGAGGAGATCAAGGAGTACAAGGCGCGGTTGACCTGCCCCTGCTGTAACACCCGCAAGAAGGATGCAGTCCTTA 2881
Sbjct 2515 -------------------------------------------------------------------------- 2514
Query 2882 CCAAGTGCTTCCACGTTTTCTGCTTCGAGTGCGTGCGGGGCCGCTATGAGGCCCGCCAGAGGAAGTGCCCCAAG 2955
Sbjct 2515 -------------------------------------------------------------------------- 2514
Query 2956 TGCAACGCGGCCTTTGGTGCCCACGACTTCCATCGTATCTACATCAGC 3003
Sbjct 2515 ------------------------------------------------ 2514