Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02249
• Subject: XM_006503006.3
• Aligned Length: 1485
• Identities: 1249
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATGAAAAAGCGCAAAGAGCTCAATGCATTGATTGGTTTGGCTGGGGACAGCCGGAGAAAGAAGCCCAAGAAAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||.|||...||||||||||||.|||||.||||
Sbjct    1  ATGAAAAAGCGCAAAGAGCTCAATGCGTTGATCGGCCTGGCTGGTGACCATCGGAGAAAGAAGACCAAGCAAGG  74

Query   75  CCCAAGCAGTCACCGCCTGCTTCGCACTGAGCCTCCCGACTCAGACTCTGAGTCCAGCTCCGAAGAGGAAGAGG  148
            |.||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|   |||.|||||||
Sbjct   75  CTCAGGCAGCCACCGCCTGCTTCGCACTGAGCCTCCTGACTCAGACTCAGAGTCCAGCAC---AGACGAAGAGG  145

Query  149  AATTCGGTGTGGTTGGAAATCGCTCTCGCTTTGCCAAGGGAGACTATTTACGATGCTGCAAGATCTGTTATCCG  222
            ||||.||.|...||||||||||||||||.||||.|||||||||||||...|||||||||||||||||.|.|||.
Sbjct  146  AATTTGGAGCAATTGGAAATCGCTCTCGTTTTGTCAAGGGAGACTATGCCCGATGCTGCAAGATCTGCTGTCCC  219

Query  223  CTCTGTGGTTTTGTCATCCTTGCTGCCTGTGTTGTGGCCTGTGTTGGCTTGGTGTGGATGCAGGTTGCTCTCAA  296
            |||||||..|||||||||||.||.|||||.||||||||||.|||.|||||||||||||||||..|.||||||||
Sbjct  220  CTCTGTGCCTTTGTCATCCTCGCAGCCTGCGTTGTGGCCTCTGTGGGCTTGGTGTGGATGCAAATGGCTCTCAA  293

Query  297  GGAGGATCTGGATGCCCTCAAGGAAAAATTTCGAACAATGGAATCTAATCAGAAAAGCTCATTCCAAGAAATCC  370
            ||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  294  GGAGGATCTGGATGTCCTCAAGGAAAAATTTAGAACAATGGAGTCTAATCAGAAGAGCTCATTCCAGGAAATCC  367

Query  371  CCAAACTTAATGAAGAACTACTCAGCAAGCAAAAACAACTTGAGAAGATTGAATCTGGAGAGATGGGTTTGAAC  444
            |||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||.||.|.|
Sbjct  368  CCAAACTTAATGAGGAACTTCTCAGCAAACAAAAACAACTTGAGAAGATTGAGTCTGGGGAGCTGGGCTTAAGC  441

Query  445  AAAGTCTGGATAAACATCACAGAAATGAATAAGCAGATTTCTCTGTTGACTTCTGCAGTGAACCACCTCAAAGC  518
            |.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  442  AGAGTCTGGATCAACATCACAGAAATGAATAAGCAGATTTCTCTCTTGAGTTCTGCAGTAAACCACCTAAAAGC  515

Query  519  CAATGTTAAGTCAGCTGCAGACTTGATTAGCCTGCCTACCACTGTAGAGGGACTTCAGAAGAGTGTAGCTTCCA  592
            ||..||.||||||||.||||||||..||||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  516  CAGCGTCAAGTCAGCCGCAGACTTACTTAGTCTGCCTAGCACTGTAGAAGGACTTCAGAAGAGTGTGGCTTCCA  589

Query  593  TTGGCAATACTTTAAACAGCGTCCATCTTGCTGTGGAAGCACTACAGAAAACTGTGGATGAACACAAGAAAACG  666
            |||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|...|||||||.|||||||||||.||||.||.|||.
Sbjct  590  TTGGCAATACTTTAAACAGTGTCCACCTTGCTGTAGAGGTGATACAGAAGACTGTGGATGAGCACAGGACAACC  663

Query  667  ATGGAATTACTGCAGAGTGATATGAATCAGCACTTCTTGAAGGAGACTCCTGGAAGCAACCAGATCATTCCGTC  740
            .|||..|||||||||.|...|||                  |||||....||||||||||||||||.|.||.||
Sbjct  664  TTGGGGTTACTGCAGGGCAGTAT------------------GGAGAACAATGGAAGCAACCAGATCTTGCCATC  719

Query  741  ACCTTCAGCCACATCAGAACTTGACAATAAAACCCACAGTGAGAATTTGAAACAGGATATCCTGTACCTTCACA  814
            |||||||.|..|||||||.||||||||||||.||||||||||.|.|...||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  720  ACCTTCACCTCCATCAGAGCTTGACAATAAATCCCACAGTGAAAGTGCAAAACAGGATATCCTGTACCTGCACA  793

Query  815  ACTCTTTAGAGGAGGTAAACAGTGCCCTAGTGGGGTACCAGAGACAGAATGATCTTAAACTCGAGGGAATGAAC  888
            ||||.||||||||.||.||||||.|..||||||..|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||.|
Sbjct  794  ACTCCTTAGAGGAAGTCAACAGTACTGTAGTGGAATACCAGAGACAGAATGACCTTAAACTCAAGGGAATGAGC  867

Query  889  GAGACAGTCAGTAATCTTACCCAGAGAGTCAACCTGATAGAAAGCGATGTGGTTGCTATGAGCAAGGTAGAAAA  962
            |||||..|||||||.||.||.||||||.|||.|||||||||||||.||||||||||..|||||||||.||||.|
Sbjct  868  GAGACCCTCAGTAACCTGACACAGAGACTCAGCCTGATAGAAAGCCATGTGGTTGCACTGAGCAAGGCAGAACA  941

Query  963  GAAAGCAAACCTGTCCTTCAGCATGATGGGTGATAGATCTGCCACTCTGAAAAGACAGTCTTTGGATCAAGTCA  1036
            ||.|.|||||.||..||.|||||.|||||...||||..|||||||||||||||||.||||||||      ||.|
Sbjct  942  GAGAACAAACGTGAGCTCCAGCACGATGGAGAATAGGGCTGCCACTCTGAAAAGAGAGTCTTTG------GTGA  1009

Query 1037  CCAACAGAACAGATACAGTAAAAATCCAAAGCATAAAGAAAGAAGATAGTTCAAATTCTCAGGTATCCAAGCTA  1110
            |||||||||..||.||.|||.|....||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 1010  CCAACAGAAGTGACACTGTACAGGCGCAAAGCATGAAGAAAGAAGATAATTCAAATTCTCAGGTATCCGAGCTT  1083

Query 1111  AGAGAGAAACTCCAGCTGATCAGTGCTCTTACAAACAAACCTGAGAGCAACAGGCCTCCAGAGACCGCCGATGA  1184
            .||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|.|||||
Sbjct 1084  CGAGAAAAACTGCAGCTGATCAGTGCTCTCACAAACAAACCTGAAAGCAACAGGCCTCCGGAGACCACAGATGA  1157

Query 1185  AGAGCAAGTAGAGAGTTTCACATCAAAGCCATCAGCATTGCCAAAATTTTCACAGTTTCTTGGAGACCCAGTTG  1258
            ||||||||||.|||..|||||||||.|.||.||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||.|.|||
Sbjct 1158  AGAGCAAGTACAGAACTTCACATCAGATCCTTCAGCATTGCCAGAATTTTCACAGCTTCTTAGAAACCAAATTG  1231

Query 1259  AGAAAGCTGCCCAACTAAGACCTATCTCCCTACCAGGAGTTTCTAGCACTGAAGATCTTCAGGATTTATTCCGC  1332
            |||      |||||.|||.||||.|||||||.||.||..|||||||||...|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1232  AGA------CCCAAGTAAAACCTCTCTCCCTGCCTGGGATTTCTAGCATCAAAGATCTTCAGGATTTATTCCAC  1299

Query 1333  AAGACTGGCCAGGACGTGGATGGGAAGCTGACCTACCAGGAAATCTGGACCTCCCTAGGTTCTGCTATGCCAGA  1406
            ||||||||.||.||.||||||||||.||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||.||||||..
Sbjct 1300  AAGACTGGTCAAGATGTGGATGGGATGCTGACCTACCAGGAACTCTGGAACTCCCTAGGTTCTGCCATGCCAAG  1373

Query 1407  ACCAGAGAGCTTGAGAGCATTTGATTCCGATGGAGATGGAAGATACTCATTCCTGGAGCTAAGGGTAGCTTTAG  1480
            |||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||.|||||..|||||||||
Sbjct 1374  ACCAGAGAGCTTGAGAGCATTTGATTCGAATGGAGATGGAAGATACTCTTTCCTGGAACTAAGATTAGCTTTAG  1447

Query 1481  GTATC  1485
            |||||
Sbjct 1448  GTATC  1452