Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02255
• Subject: NM_001282282.2
• Aligned Length: 826
• Identities: 761
• Gaps: 64

Alignment

Query   1  MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRELEQRKHTVLVTELK  74
                                                     .|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ------------------------------------------MVSKLEREKTQEAKRIRELEQRKHTVLVTELK  32

Query  75  AKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCALRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTE  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  33  AKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCALRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTE  106

Query 149  RLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIKAGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFS  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107  RLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIKAGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFS  180

Query 223  LEKELETQTGYVQKLQLQKEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSEHCSSPDLRRNQKRIAELNATIR  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181  LEKELETQTGYVQKLQLQKEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSEHCSSPDLRRNQKRIAELNATIR  254

Query 297  KLEDRNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKAVTKENSEMREKITSHPP  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 255  KLEDRNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKAVTKENSEMREKITSHPP  328

Query 371  LKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKLIRRRKHRRSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDS  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 329  LKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKLIRRRKHRRSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDS  402

Query 445  ETSSMASFRTDRTPATPDDDLDESLAAEESELRFRQLTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAE  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 403  ETSSMASFRTDRTPATPDDDLDESLAAEESELRFRQLTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAE  476

Query 519  VLRYKAKIEDLEATLAQKGQDSHWVEDKQLFIKRNQELLEKIEKQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNLELE  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477  VLRYKAKIEDLEATLAQKGQDSHWVEDKQLFIKRNQELLEKIEKQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNLELE  550

Query 593  ERERRSPPFNLQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEEQVAIIQASTVLSLAEKW  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551  ERERRSPPFNLQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEEQVAIIQASTVLSLAEKW  624

Query 667  IQQIEGAEAALHQKMMELESDMEQFCKIKGYLEEELDYRKQALDQAYMRIQELEATLYNALQQETVIKFGELLS  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 625  IQQIEGAEAALHQKMMELESDMEQFCKIKGYLEEELDYRKQALDQAYMRIQELEATLYNALQQETVIKFGELLS  698

Query 741  EKQQEELRTAVEKLRRQMLRKSREYDCQILQERMELLQQAHQRIRDLEDKTDIQKRQIKDLEEKSNRKHG----  810
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct 699  EKQQEELRTAVEKLRRQMLRKSREYDCQILQERMELLQQAHQRIRDLEDKTDIQKRQIKDLEEK------FLFL  766

Query 811  ------------  810
                       
Sbjct 767  FLFFSLAFILWP  778