Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02255
- Subject:
- XM_011247034.2
- Aligned Length:
- 2470
- Identities:
- 2121
- Gaps:
- 113
Alignment
Query 1 ATGTCCAAGAAAGGGCGAAATAAGGGCGAGAAGCCCGAGGCACTCATTGTTGCCCTTCAAGCTGCCAATGAAGA 74
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGTCCAAGAAAGGGCGGAATAAGGGCGAGAAGCCCGAGGCACTCATTGTTGCCCTTCAAGCTGCCAACGAAGA 74
Query 75 CCTCAGGACCAAGCTCACAGACATTCAGATAGAGCTGCATCAAGAGAAGTCCAAGGTATCAAAGCTTGAAAGAG 148
||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTCAGGACCAAACTCACAGACATCCAGATAGAACTGCATCAAGAGAAATCCAAGGTATCAAAGCTTGAAAGAG 148
Query 149 AGAAGACTCAAGAAGCGAAGAGGATTCGTGAGCTGGAGCAGCGCAAGCACACGGTGCTGGTGACAGAACTCAAA 222
||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||
Sbjct 149 AGAAGACTCAAGAAGCAAAGAGGATTCGTGAGTTGGAGCAGCGCAAACACACGGTCCTGGTGACCGAGCTTAAA 222
Query 223 GCCAAGCTCCATGAGGAGAAGATGAAGGAGCTGCAGGCTGTGAGGGAGAACCTTATCAAGCAGCACGAGCAGGA 296
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 223 GCCAAGCTCCACGAGGAGAAGATGAAGGAGCTGCAGGCCGTGAGGGAGAATCTCATCAAACAGCATGAGCAGGA 296
Query 297 AATGTCAAGGACGGTGAAGGTACGTGATGGAGAGATCCAGAGGCTCAAGTCTGCTCTCTGTGCTCTCCGCGACG 370
||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.|
Sbjct 297 AATGTCAAGGACAGTGAAGGTGCGGGATGGGGAGATTCAGAGACTCAAGTCCGCGCTGTGTGCTCTCCGGGATG 370
Query 371 GCAGCAGTGACAAAGTAAGGACAGCGCTCACCATTGAGGCCCGGGAGGAGGCCCGGAAACTGTTTGACACAGAG 444
|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||..|||||
Sbjct 371 GCAGCAGCGACAAAGTAAGGACAGCACTCACCATTGAGGCCCGGGAGGAGGCCCGGAAACAGTTCGATGCAGAG 444
Query 445 CGCCTTAAGCTCTTACAGGAAATTGCGGACCTGAAAACGGCCAAGAAGCAGGTGGACGAGGCTCTGAGCAATAT 518
|||||.||||||.|.|||||||||.|.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 445 CGCCTGAAGCTCCTGCAGGAAATTACAGACTTGAAAACTGCCAAGAAGCAGGTGGATGAGGCTCTAAGCAATAT 518
Query 519 GATCCAAGCAGATAAAATCAAGGCTGGGGACCTTCGGAGTGAGCATCAGTCCCACCAAGAAGCCATCTCGAAGA 592
|||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 519 GATCCAAGCGGATAAAATCAAAGCTGGGGACCTTAGGAGTGAGCATCAGTCCCACCAGGAAGCCATCTCGAAGA 592
Query 593 TCAAGTGGGAGTCGGAGCGGGATATTCGGAGGCTGATGGATGAAATCAAAGCCAAGGACAGGATCATCTTTTCC 666
||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCAAGTGGGAATCCGAACGGGATATACGGAGGCTGATGGATGAAATCAAAGCCAAGGACAGGATCATCTTTTCC 666
Query 667 CTGGAAAAGGAACTGGAGACCCAGACAGGCTATGTACAGAAACTCCAACTTCAGAAGGAGGCTTTGGACGAACA 740
||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||
Sbjct 667 CTGGAAAAAGAACTGGAGACTCAGACGGGCTATGTGCAGAAACTCCAGCTTCAGAAGGAGGCTCTGGATGAGCA 740
Query 741 ACTCTTTCTGGTCAAGGAGGCTGAGTGCAACATGAGCAGCCCAAAACGAGAAATTCCAGGAAGGGCAGGTGATG 814
.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||..||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 741 GCTCTTCCTTGTCAAGGAGGCAGAGTGTAACATGAGCAGTCCGAAGAGAGAGATTCCAGGAAGGGCAGGAGACG 814
Query 815 GTTCCGAACACTGCAGCAGTCCTGATTTGCGAAGAAATCAAAAGAGAATAGCTGAATTGAATGCCACTATAAGA 888
|.||.||.|||||||||||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||
Sbjct 815 GCTCTGAGCACTGCAGCAGCCCCGACCTGCGAAGAAATCAAAAGAGAATAGCTGAGTTGAACGCCACTATACGA 888
Query 889 AAATTAGAAGACAGGAATACCTTGCTTGGAGATGAACGAAATGAACTGTTAAAACGTGTGCGGGAAACCGAAAA 962
||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGTTAGAAGACAGGAACACCTTGCTTGGAGATGAGCGGAATGAGTTGTTAAAACGCGTGCGGGAAACCGAAAA 962
Query 963 GCAATGTAAACCTCTCCTGGAAAGGAACAAGTGCCTCGCCAAGAGAAACGATGAACTGATGGTGTCCTTGCAGC 1036
.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 963 ACAATGCAAACCTCTCCTGGAAAGGAACAAGTGCCTAGCCAAGAGAAACGATGAACTGATGGTGTCTTTGCAGC 1036
Query 1037 GCATGGAAGAAAAACTAAAAGCCGTTACCAAGGAAAATTCAGAAATGAGAGAAAAAATAACATCCCATCCACCC 1110
||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037 GCATGGAAGAGAAACTAAAAGCCGTAACCAAGGAAAATTCAGAAATGAGAGAAAAAATAACATCTCACCCACCT 1110
Query 1111 CTGAAGAAATTAAAATCTCTGAATGACCTCGACCAAGCTAATGAAGAACAAGAAACAGAGTTTCTAAAACTTCA 1184
.||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1111 TTGAAGAAACTGAAGTCTCTGAACGACCTTGACCAAGCTAATGAAGAACAAGAGACAGAGTTTCTAAAACTGCA 1184
Query 1185 GGTCATTGAGCAACAGAACATTATTGATGAGCTCACAAGGGACCGAGAAAAGCTCATCCGTAGAAGAAAGCATA 1258
||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185 GGTCATTGAGCAGCAAAACATCATTGATGAGCTCACAAGGGATCGAGAAAAACTCATCCGTAGAAGAAAGCACA 1258
Query 1259 GAAGAAGTTCCAAGCCAATTAAGAGGCCTGTTTTGGACCCGTTTATTGGCTATGATGAGGACTCTATGGATTCA 1332
|.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1259 GGAGAAGCTCGAAACCAATCAAGAGGCCTGTTTTAGATCCGTTCATTGGCTATGACGAGGACTCCATGGATTCA 1332
Query 1333 GAGACATCATCCATGGCCTCATTTAGAACAGACAGAACACCAGCTACTCCTGATGATGACTTGGATGAAAGTTT 1406
||.||||||||||||.||||.||||||||||||.|.|||||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1333 GAAACATCATCCATGACCTCCTTTAGAACAGACCGGACACCTGCTACCCCCGATGATGACCTGGATGAAAGTCT 1406
Query 1407 AGCAGCTGAAGAATCTGAACTAAGATTTCGACAATTAACAAAAGAATATCAGGCCCTCCAAAGAGCATATGCCC 1480
|||.||||||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGCTGCTGAAGAATCTGAGCTACGATTTAGACAACTAACAAAAGAATACCAAGCCCTCCAAAGAGCATATGCCC 1480
Query 1481 TCCTACAGGAGCAGACGGGAGGCATCATCGACGCTGAACGAGAAGCCAAGGCTCAAGAACAGCTCCAAGCAGAG 1554
||.|.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1481 TCTTGCAGGAACAGACTGGCGGCATCATCGATGCTGAAAGAGAAGCCAAGGCACAAGAGCAGCTCCAGGCAGAG 1554
Query 1555 GTGCTAAGGTATAAAGCCAAAATTGAAGACCTGGAAGCGACTCTGGCTCAGAAAGGGCAGGATTCACACTGGGT 1628
|||||.|||||.|..||||||||.|||||.||.||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTGCTGAGGTACAGGGCCAAAATCGAAGATCTAGAGGCAACGCTGGCTCAGAAAGGGC---------------- 1612
Query 1629 AGAAGATAAACAACTTTTCATTAAGAGAAACCAGGAGCTTTTAGAAAAGATAGAAAAACAGGAGGCAGAAAATC 1702
|||||||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1613 -----------------------------------------------AGATAGAGAAGCAGGAAGCAGAGAATC 1639
Query 1703 ACCGGTTACAACAAGAACTACAGGACGCCAGAGACCAGAATGAGCTGCTGGAGTTTCGAAACCTAGAGCTAGAA 1776
|||||.||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 1640 ACCGGCTACAGCAGGAACTTCAGGATGCCAGGGACCAGAATGAGCTGCTGGAGTTTCGCAACCTAGAACTGGAA 1713
Query 1777 GAGAGAGAGAGACGATCCCCTCCATTTAATCTCCAAATTCACCCATTCTCAGATGGTGTGAGTGCTCTACAGAT 1850
|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1714 GAGAGAGAGAGGCGATCCCCTCCATTTAATCTACAAATTCACCCCTTCTCAGATGGTGTGAGTGCGCTGCAGAT 1787
Query 1851 CTACTGTATGAAAGAAGGTGTTAAGGATGTGAACATCCCTGATCTCATAAAGCAGCTTGATATCTTGGGTGATA 1924
||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||.|
Sbjct 1788 CTACTGCATGAAAGAAGGTGTCAAGGATGTCAACATCCCTGACCTCATAAAGCAGCTTGATATCCTAGGTGACA 1861
Query 1925 ATGGGAATTTAAGAAATGAAGAACAAGTGGCCATAATTCAGGCCAGCACTGTGCTGTCCCTGGCAGAGAAGTGG 1998
|.|||||..||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1862 ACGGGAACCTAAGGAATGAAGAACAGGTGGCCATTATTCAGGCCAGCACTGTGCTGTCCCTGGCAGAAAAGTGG 1935
Query 1999 ATCCAGCAGATTGAAGGAGCTGAGGCTGCCCTACACCAGAAAATGATGGAATTGGAAAGTGACATGGAACAGTT 2072
|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1936 ATCCAACAAATTGAAGGAGCGGAGGCTGCCCTGCACCAGAAAATGATGGAACTGGAAAGTGACATGGAACAGTT 2009
Query 2073 CTGCAAAATAAAAGGCTATCTGGAGGAAGAACTAGACTACAGAAAACAAGCTCTTGACCAAGCATATATGAGAA 2146
|||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2010 CTGCAAAATCAAAGGCTACCTGGAGGAAGAACTAGACTACAGAAAACAGGCTCTTGACCAGGCATATATGAGAA 2083
Query 2147 TCCAGGAACTAGAAGCTACTTTGTACAATGCTCTACAGCAAGAAACTGTTATCAAGTTTGGTGAATTATTAAGT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||.|.||||||
Sbjct 2084 TCCAGGAACTAGAAGCTACTTTGTACAATGCTCTGCAGCAAGAAACTGTGATCAAATTCGGCGAACTGTTAAGT 2157
Query 2221 GAAAAACAGCAAGAGGAGCTGAGGACGGCAGTAGAAAAGTTACGGCGGCAAATGCTGAGGAAGAGCAGAGAGTA 2294
||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 2158 GACAAGCAGCAGGAGGAGCTGAGGACGGCTGTGGAAAAGTTACGGCGGCAAATGCTGAGGAAGAGCCGGGAGTA 2231
Query 2295 TGACTGTCAGATTCTTCAGGAGAGAATGGAGCTCTTACAGCAAGCCCATCAGAGAATTCGTGACTTAGAAGATA 2368
.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct 2232 CGACTGTCAGATCCTCCAGGAGAGGATGGAGCTCCTGCAGCAAGCGCACCAGAGAATCCGTGACCTAGAAGATA 2305
Query 2369 AAACAGACATCCAGAAAAGACAAATAAAAGACTTAGAAGAAAAGAGTAACCGAAAACATGGA------------ 2430
|||||||||||||.||..||||.|||||.|||.|||||||||||..| .||..
Sbjct 2306 AAACAGACATCCAAAAGCGACAGATAAAGGACCTAGAAGAAAAGTTT----------CTGTTTCTATTCTTGTT 2369
Query 2431 ---------------------------- 2430
Sbjct 2370 CTTCTCTCTTGCCTTCATTCTATGGCCT 2397